More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4109 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4109  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
425 aa  828    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.478962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4036  sodium/hydrogen exchanger  56.05 
 
 
422 aa  385  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554914  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2132  sodium/hydrogen exchanger  58.64 
 
 
425 aa  368  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3558  sodium/hydrogen exchanger  43.15 
 
 
455 aa  307  3e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790544  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04834  transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family  42.26 
 
 
421 aa  292  9e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1098  sodium/hydrogen exchanger  45.11 
 
 
419 aa  291  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000276702  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  37.08 
 
 
756 aa  264  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2552  sodium/hydrogen exchanger  38.92 
 
 
747 aa  255  9e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.803467  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0546  Na+/H+ antiporter  40.37 
 
 
715 aa  251  2e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0736  sodium/hydrogen exchanger  36.59 
 
 
495 aa  248  1e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3878  sodium/hydrogen exchanger  38.99 
 
 
715 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.267583  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3828  sodium/hydrogen exchanger  38.73 
 
 
715 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1632  Sodium/hydrogen exchanger  39.06 
 
 
723 aa  247  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.531828 
 
 
-
 
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  35.58 
 
 
767 aa  240  4e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  39.33 
 
 
482 aa  238  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  36.8 
 
 
764 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1107  sodium/hydrogen exchanger  36.97 
 
 
775 aa  231  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112633  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1474  sodium/hydrogen exchanger  40.25 
 
 
703 aa  222  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00326365  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1396  sodium/hydrogen exchanger  39.72 
 
 
689 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0052164  normal  0.118619 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01670  potassium:hydrogen antiporter, putative  34.75 
 
 
951 aa  202  9.999999999999999e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43795  K(+)/H(+) antiporter  33.82 
 
 
816 aa  201  1.9999999999999998e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00004515  normal  0.344688 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3561  sodium/hydrogen exchanger  36.75 
 
 
420 aa  199  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4342  sodium/hydrogen exchanger  37.17 
 
 
416 aa  198  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.322852  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2302  sodium/hydrogen exchanger  34.81 
 
 
423 aa  198  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113166  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1281  sodium/hydrogen exchanger  36.75 
 
 
460 aa  190  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345739  normal  0.428465 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0935  sodium/hydrogen exchanger  33.51 
 
 
448 aa  186  8e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0791  Na+/H+ antiporter, putative  33.51 
 
 
448 aa  186  8e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3445  sodium/hydrogen exchanger  35.59 
 
 
427 aa  186  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243488 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0928  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.68 
 
 
430 aa  183  6e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5898  Kef-type K+ transport systems membrane components-like protein  37.29 
 
 
683 aa  182  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103243  normal  0.0297868 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3562  sodium/hydrogen exchanger  36.59 
 
 
429 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01290  potassium ion/proton antiporter (Eurofung)  35.68 
 
 
883 aa  180  4e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.721044  normal  0.960342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2667  sodium/hydrogen exchanger  36.36 
 
 
435 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2757  sodium/hydrogen exchanger family protein  36.23 
 
 
442 aa  173  5.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.224799  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6352  sodium/hydrogen exchanger  36.99 
 
 
436 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4159  sodium/hydrogen exchanger  36.46 
 
 
446 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3175  sodium/hydrogen exchanger  39.27 
 
 
416 aa  163  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2714  sodium/hydrogen exchanger  37.37 
 
 
439 aa  156  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6043  sodium/hydrogen exchanger  31.62 
 
 
414 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5813  sodium/hydrogen exchanger  31.86 
 
 
414 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1229  sodium/hydrogen exchanger  31.63 
 
 
410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.440766  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1654  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  31.57 
 
 
410 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148564  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0143  sodium/hydrogen exchanger  31.31 
 
 
410 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3484  sodium/hydrogen exchanger  32.02 
 
 
406 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.861174  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1572  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  31.31 
 
 
410 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4038  sodium/hydrogen exchanger  30.94 
 
 
406 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  30.54 
 
 
460 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0995  sodium/hydrogen exchanger  35.08 
 
 
452 aa  146  5e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  29.9 
 
 
749 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  29.95 
 
 
748 aa  144  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  30.77 
 
 
750 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2049  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.63 
 
 
444 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2104  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.63 
 
 
444 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.134319  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2241  sodium/hydrogen exchanger  30.63 
 
 
444 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310432  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1004  sodium/hydrogen exchanger  30.63 
 
 
444 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0864919  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1208  sodium/hydrogen exchanger  32.43 
 
 
410 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0581239  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1476  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.43 
 
 
547 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0269203  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1126  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.43 
 
 
410 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.251778  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0173  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.43 
 
 
410 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.661692  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1391  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.43 
 
 
547 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2617  sodium/hydrogen exchanger  32.43 
 
 
592 aa  133  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.129932  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0450  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  31.23 
 
 
625 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.26198  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2332  sodium/hydrogen exchanger  29.12 
 
 
444 aa  131  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0913  sodium/hydrogen exchanger  29.8 
 
 
413 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3440  sodium/hydrogen exchanger  30.46 
 
 
573 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 
400 aa  124  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  26.43 
 
 
375 aa  120  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  26.01 
 
 
375 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  26.18 
 
 
375 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  26.18 
 
 
375 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  26.18 
 
 
375 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  27.16 
 
 
375 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  26.18 
 
 
375 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  26.18 
 
 
375 aa  118  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  26.33 
 
 
387 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  29.97 
 
 
412 aa  117  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  25.92 
 
 
385 aa  117  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  26.21 
 
 
387 aa  117  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0163  sodium/hydrogen exchanger  29.16 
 
 
435 aa  116  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0515868 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  25.95 
 
 
387 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  25.95 
 
 
387 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  25.7 
 
 
387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  28.47 
 
 
389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  28.08 
 
 
414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  25.95 
 
 
387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  28.18 
 
 
382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  25.95 
 
 
387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  25.95 
 
 
387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  26.4 
 
 
379 aa  114  4.0000000000000004e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  25.7 
 
 
387 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  26.42 
 
 
399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 
445 aa  113  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1282  sodium/hydrogen exchanger  27.18 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  25.32 
 
 
387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  25.85 
 
 
386 aa  112  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  26.18 
 
 
375 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  26.18 
 
 
375 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  26.18 
 
 
375 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  25.75 
 
 
375 aa  105  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  26.29 
 
 
396 aa  103  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>