More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1098 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1098  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 419 aa  822    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000276702  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3558  sodium/hydrogen exchanger  54 
 
 		 455 aa  439  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04834  transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family  50.61 
 
 		 421 aa  385  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4109  sodium/hydrogen exchanger  47.12 
 
 		 425 aa  312  7.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.478962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4036  sodium/hydrogen exchanger  45.14 
 
 		 422 aa  291  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554914  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3828  sodium/hydrogen exchanger  41.4 
 
 		 715 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3878  sodium/hydrogen exchanger  41.16 
 
 		 715 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.267583  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  40.2 
 
 		 756 aa  285  1.0000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2552  sodium/hydrogen exchanger  42.22 
 
 		 747 aa  281  2e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.803467  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1632  Sodium/hydrogen exchanger  42.51 
 
 		 723 aa  278  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.531828 
 
 
-
 
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  40.71 
 
 		 767 aa  268  1e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  38.73 
 
 		 764 aa  266  5.999999999999999e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0546  Na+/H+ antiporter  40.86 
 
 		 715 aa  266  7e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1107  sodium/hydrogen exchanger  38.33 
 
 		 775 aa  255  9e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112633  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0736  sodium/hydrogen exchanger  40.3 
 
 		 495 aa  254  2.0000000000000002e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  38.64 
 
 		 482 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1396  sodium/hydrogen exchanger  41.93 
 
 		 689 aa  239  9e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0052164  normal  0.118619 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2132  sodium/hydrogen exchanger  42.25 
 
 		 425 aa  232  8.000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1474  sodium/hydrogen exchanger  40.73 
 
 		 703 aa  227  4e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00326365  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2302  sodium/hydrogen exchanger  35.52 
 
 		 423 aa  224  2e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113166  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0935  sodium/hydrogen exchanger  35.98 
 
 		 448 aa  223  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0791  Na+/H+ antiporter, putative  35.98 
 
 		 448 aa  223  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5898  Kef-type K+ transport systems membrane components-like protein  36.93 
 
 		 683 aa  219  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103243  normal  0.0297868 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01670  potassium:hydrogen antiporter, putative  35.71 
 
 		 951 aa  219  8.999999999999998e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4342  sodium/hydrogen exchanger  37.83 
 
 		 416 aa  213  4.9999999999999996e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.322852  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3562  sodium/hydrogen exchanger  36.59 
 
 		 429 aa  206  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1281  sodium/hydrogen exchanger  37.06 
 
 		 460 aa  202  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345739  normal  0.428465 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0928  sodium/hydrogen exchanger family protein  36.45 
 
 		 430 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43795  K(+)/H(+) antiporter  33.33 
 
 		 816 aa  200  3e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00004515  normal  0.344688 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3561  sodium/hydrogen exchanger  35.48 
 
 		 420 aa  198  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3445  sodium/hydrogen exchanger  33.73 
 
 		 427 aa  187  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243488 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2757  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.36 
 
 		 442 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.224799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5813  sodium/hydrogen exchanger  34.3 
 
 		 414 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6043  sodium/hydrogen exchanger  34.54 
 
 		 414 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  34.7 
 
 		 750 aa  179  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1229  sodium/hydrogen exchanger  34.37 
 
 		 410 aa  177  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.440766  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01290  potassium ion/proton antiporter (Eurofung)  35.27 
 
 		 883 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.721044  normal  0.960342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2714  sodium/hydrogen exchanger  37.47 
 
 		 439 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4159  sodium/hydrogen exchanger  33.96 
 
 		 446 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  31.38 
 
 		 749 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1572  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  33.25 
 
 		 410 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1654  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  33.41 
 
 		 410 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148564  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0143  sodium/hydrogen exchanger  33.17 
 
 		 410 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  32.33 
 
 		 748 aa  160  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3175  sodium/hydrogen exchanger  35.1 
 
 		 416 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  29.67 
 
 		 460 aa  156  7e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6352  sodium/hydrogen exchanger  32.12 
 
 		 436 aa  153  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105497 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0995  sodium/hydrogen exchanger  32.76 
 
 		 452 aa  152  7e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2667  sodium/hydrogen exchanger  32.92 
 
 		 435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4038  sodium/hydrogen exchanger  29.35 
 
 		 406 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3484  sodium/hydrogen exchanger  29.95 
 
 		 406 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.861174  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3440  sodium/hydrogen exchanger  31.11 
 
 		 573 aa  143  7e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  26.57 
 
 		 387 aa  137  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  26.49 
 
 		 387 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  26.97 
 
 		 387 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  26.25 
 
 		 387 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  26.25 
 
 		 387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  26.25 
 
 		 387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  26.25 
 
 		 387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  27.14 
 
 		 387 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2241  sodium/hydrogen exchanger  30.02 
 
 		 444 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310432  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2049  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.02 
 
 		 444 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2104  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.02 
 
 		 444 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.134319  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1004  sodium/hydrogen exchanger  30.02 
 
 		 444 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0864919  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  25.85 
 
 		 385 aa  133  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  26.49 
 
 		 387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  26.49 
 
 		 387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  28.75 
 
 		 382 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0913  sodium/hydrogen exchanger  30.2 
 
 		 413 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  27.4 
 
 		 414 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2332  sodium/hydrogen exchanger  28.09 
 
 		 444 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.93 
 
 		 427 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  26.12 
 
 		 445 aa  121  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  27.93 
 
 		 424 aa  119  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  28.08 
 
 		 424 aa  119  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1208  sodium/hydrogen exchanger  28.34 
 
 		 410 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0581239  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0173  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.34 
 
 		 410 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.661692  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1126  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.34 
 
 		 410 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.251778  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1476  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.34 
 
 		 547 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0269203  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  25.62 
 
 		 375 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1391  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.34 
 
 		 547 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  28.91 
 
 		 400 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2617  sodium/hydrogen exchanger  28.34 
 
 		 592 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.129932  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1412  sodium/hydrogen exchanger  25.26 
 
 		 424 aa  116  7.999999999999999e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0450  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.34 
 
 		 625 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.26198  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  24.31 
 
 		 389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  29.05 
 
 		 397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  23.77 
 
 		 375 aa  110  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3203  sodium/hydrogen exchanger  25.74 
 
 		 404 aa  110  7.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  26.15 
 
 		 375 aa  107  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4191  Sodium/hydrogen exchanger  25.33 
 
 		 399 aa  107  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  22.85 
 
 		 375 aa  106  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  23.66 
 
 		 396 aa  106  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  25.6 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  23.1 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  23.1 
 
 		 375 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  23.1 
 
 		 375 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3230  sodium/hydrogen exchanger  27.37 
 
 		 401 aa  105  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  23.1 
 
 		 375 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  23.1 
 
 		 375 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>