260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0163 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0163  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
435 aa  854    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0515868 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6352  sodium/hydrogen exchanger  31.29 
 
 
436 aa  149  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105497 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2667  sodium/hydrogen exchanger  30.98 
 
 
435 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  29.9 
 
 
482 aa  142  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  31.98 
 
 
460 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  25.53 
 
 
748 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  27.86 
 
 
756 aa  139  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  27.44 
 
 
749 aa  137  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4159  sodium/hydrogen exchanger  31.22 
 
 
446 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3561  sodium/hydrogen exchanger  28.3 
 
 
420 aa  130  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2302  sodium/hydrogen exchanger  26.57 
 
 
423 aa  129  7.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113166  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  26.03 
 
 
764 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0546  Na+/H+ antiporter  28.46 
 
 
715 aa  127  4.0000000000000003e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0995  sodium/hydrogen exchanger  31.19 
 
 
452 aa  127  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2552  sodium/hydrogen exchanger  26.29 
 
 
747 aa  126  8.000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.803467  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3828  sodium/hydrogen exchanger  26.85 
 
 
715 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3878  sodium/hydrogen exchanger  26.85 
 
 
715 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.267583  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  29.15 
 
 
750 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3440  sodium/hydrogen exchanger  31.22 
 
 
573 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3562  sodium/hydrogen exchanger  29.12 
 
 
429 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  28.06 
 
 
389 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4109  sodium/hydrogen exchanger  29.16 
 
 
425 aa  117  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.478962 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0736  sodium/hydrogen exchanger  27.74 
 
 
495 aa  117  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1632  Sodium/hydrogen exchanger  26.16 
 
 
723 aa  116  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.531828 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0928  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.49 
 
 
430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0935  sodium/hydrogen exchanger  27.91 
 
 
448 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0791  Na+/H+ antiporter, putative  27.91 
 
 
448 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  28.68 
 
 
385 aa  116  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4342  sodium/hydrogen exchanger  30.99 
 
 
416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.322852  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43795  K(+)/H(+) antiporter  25.68 
 
 
816 aa  115  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00004515  normal  0.344688 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1107  sodium/hydrogen exchanger  26.4 
 
 
775 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112633  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2757  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.59 
 
 
442 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.224799  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04834  transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family  27.45 
 
 
421 aa  111  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  25 
 
 
387 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  25.62 
 
 
414 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  25.06 
 
 
387 aa  110  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  25 
 
 
387 aa  110  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  25 
 
 
387 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  25.32 
 
 
387 aa  110  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  24.75 
 
 
387 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  25 
 
 
387 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  25 
 
 
387 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  24.82 
 
 
387 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  24.03 
 
 
387 aa  108  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  28.01 
 
 
445 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3558  sodium/hydrogen exchanger  26.72 
 
 
455 aa  106  9e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790544  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  25.58 
 
 
375 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  26.18 
 
 
767 aa  106  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  25.58 
 
 
375 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  25.58 
 
 
375 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  25.58 
 
 
375 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01670  potassium:hydrogen antiporter, putative  27.07 
 
 
951 aa  105  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  26.84 
 
 
416 aa  106  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  25.58 
 
 
375 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  26.03 
 
 
375 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3445  sodium/hydrogen exchanger  27.45 
 
 
427 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243488 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  25.84 
 
 
375 aa  103  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  24.62 
 
 
385 aa  103  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1281  sodium/hydrogen exchanger  26.72 
 
 
460 aa  103  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345739  normal  0.428465 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1474  sodium/hydrogen exchanger  28.87 
 
 
703 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00326365  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  25 
 
 
375 aa  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  25.06 
 
 
389 aa  99.8  9e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  25.58 
 
 
375 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  25.58 
 
 
375 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  25.58 
 
 
375 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  26.87 
 
 
412 aa  95.9  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4036  sodium/hydrogen exchanger  26.15 
 
 
422 aa  94  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554914  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  26.61 
 
 
412 aa  94.4  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1396  sodium/hydrogen exchanger  27.65 
 
 
689 aa  94  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0052164  normal  0.118619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5898  Kef-type K+ transport systems membrane components-like protein  29.65 
 
 
683 aa  93.6  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103243  normal  0.0297868 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6043  sodium/hydrogen exchanger  25.78 
 
 
414 aa  93.6  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5813  sodium/hydrogen exchanger  25.67 
 
 
414 aa  93.2  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1205  Integral membrane transporter protein  26.75 
 
 
425 aa  91.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.88 
 
 
587 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  28.42 
 
 
390 aa  91.7  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  26.87 
 
 
386 aa  90.9  4e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  24.65 
 
 
585 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  23.87 
 
 
382 aa  89.7  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  26.21 
 
 
586 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  24.88 
 
 
585 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  25.65 
 
 
586 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  25.51 
 
 
375 aa  88.6  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  25.55 
 
 
587 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  26.52 
 
 
399 aa  88.2  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.18 
 
 
587 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  25.65 
 
 
586 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  24.49 
 
 
400 aa  86.7  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01290  potassium ion/proton antiporter (Eurofung)  25.94 
 
 
883 aa  85.9  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.721044  normal  0.960342 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  25.73 
 
 
586 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1229  sodium/hydrogen exchanger  26.25 
 
 
410 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.440766  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0839  hypothetical protein  26.75 
 
 
479 aa  85.5  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1098  sodium/hydrogen exchanger  32.18 
 
 
419 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000276702  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  25.41 
 
 
398 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0706  sodium/hydrogen exchanger  27.94 
 
 
404 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.584868  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3950  sodium/hydrogen exchanger  25.06 
 
 
414 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.387419 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  26.95 
 
 
399 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  26.28 
 
 
423 aa  84  0.000000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3484  sodium/hydrogen exchanger  28.93 
 
 
406 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.861174  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1572  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  27.39 
 
 
410 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0868  hypothetical protein  26.5 
 
 
479 aa  83.2  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>