More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3950 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0606  sodium/hydrogen exchanger  86 
 
 		 414 aa  645    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3950  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 414 aa  810    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.387419 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0960  Sodium/hydrogen exchanger  48.54 
 
 		 425 aa  302  7.000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848142  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  29.37 
 
 		 387 aa  173  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  29.37 
 
 		 387 aa  173  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  29.85 
 
 		 375 aa  172  9e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  30.35 
 
 		 375 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  30.1 
 
 		 375 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  29.13 
 
 		 387 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  30.1 
 
 		 375 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  30.1 
 
 		 375 aa  171  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  30.1 
 
 		 375 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  30.1 
 
 		 375 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  30.1 
 
 		 375 aa  171  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  30.1 
 
 		 385 aa  169  7e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  29.2 
 
 		 387 aa  169  9e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  28.88 
 
 		 387 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  28.88 
 
 		 387 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  28.88 
 
 		 387 aa  168  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  28.95 
 
 		 387 aa  168  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  28.88 
 
 		 387 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  28.64 
 
 		 387 aa  167  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  29.53 
 
 		 375 aa  161  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  29.53 
 
 		 375 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  29.53 
 
 		 375 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  28.57 
 
 		 414 aa  155  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  29.37 
 
 		 412 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  28.78 
 
 		 396 aa  154  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0499  NaH antiporter protein  29.59 
 
 		 389 aa  151  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  28.89 
 
 		 445 aa  150  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.32 
 
 		 399 aa  145  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  29.53 
 
 		 390 aa  144  4e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  28.99 
 
 		 382 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  29.93 
 
 		 389 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  31.53 
 
 		 416 aa  139  8.999999999999999e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  29.86 
 
 		 424 aa  138  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  26.98 
 
 		 379 aa  137  4e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  29.44 
 
 		 424 aa  137  5e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.83 
 
 		 427 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2667  sodium/hydrogen exchanger  29.97 
 
 		 767 aa  134  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  28.61 
 
 		 412 aa  133  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3809  sodium/hydrogen exchanger  30.47 
 
 		 413 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.397158  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.26 
 
 		 418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  28.75 
 
 		 400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  27.59 
 
 		 386 aa  131  3e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3726  sodium/hydrogen exchanger  31.13 
 
 		 413 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0706  sodium/hydrogen exchanger  30.9 
 
 		 404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.584868  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  27.32 
 
 		 375 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  27.21 
 
 		 389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3668  Sodium/hydrogen exchanger  31.46 
 
 		 415 aa  126  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  27.64 
 
 		 399 aa  125  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  30.88 
 
 		 385 aa  124  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  29.49 
 
 		 460 aa  123  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  29.52 
 
 		 399 aa  122  8e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  28.4 
 
 		 750 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  27.8 
 
 		 423 aa  120  3e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  32.52 
 
 		 395 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2295  sodium/hydrogen exchanger  28.72 
 
 		 386 aa  120  6e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.784703 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1868  sodium/hydrogen exchanger  29.6 
 
 		 469 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  26.18 
 
 		 352 aa  114  3e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4724  sodium/hydrogen exchanger  31.01 
 
 		 473 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  28.54 
 
 		 748 aa  114  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  26.76 
 
 		 388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0546  Na+/H+ antiporter  28.71 
 
 		 715 aa  110  6e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2594  sodium/hydrogen exchanger  26.33 
 
 		 491 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3878  sodium/hydrogen exchanger  25.12 
 
 		 715 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.267583  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3558  sodium/hydrogen exchanger  26.22 
 
 		 455 aa  109  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2667  sodium/hydrogen exchanger  27.93 
 
 		 435 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3828  sodium/hydrogen exchanger  24.88 
 
 		 715 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1474  sodium/hydrogen exchanger  28.03 
 
 		 703 aa  108  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00326365  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0433  sodium/hydrogen exchanger  25.48 
 
 		 387 aa  107  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  26.62 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4159  sodium/hydrogen exchanger  26.43 
 
 		 446 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  25.93 
 
 		 398 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  26.34 
 
 		 767 aa  104  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  28.47 
 
 		 467 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  28.47 
 
 		 467 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  26.23 
 
 		 756 aa  104  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  26.37 
 
 		 388 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  27.23 
 
 		 749 aa  102  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04834  transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family  27.49 
 
 		 421 aa  102  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1099  sodium/hydrogen exchanger  25.8 
 
 		 392 aa  102  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3029  Sodium/hydrogen exchanger  27.02 
 
 		 453 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0995  sodium/hydrogen exchanger  29.65 
 
 		 452 aa  101  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1792  sodium/hydrogen exchanger  26.42 
 
 		 388 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.906777  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  25.56 
 
 		 764 aa  101  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5898  Kef-type K+ transport systems membrane components-like protein  28.12 
 
 		 683 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103243  normal  0.0297868 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4342  sodium/hydrogen exchanger  27.18 
 
 		 416 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.322852  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0791  Na+/H+ antiporter, putative  26.38 
 
 		 448 aa  100  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1576  sodium/hydrogen exchanger  26.82 
 
 		 392 aa  100  5e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.000000405712  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0935  sodium/hydrogen exchanger  26.38 
 
 		 448 aa  100  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2552  sodium/hydrogen exchanger  26.08 
 
 		 747 aa  99  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.803467  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  25.41 
 
 		 482 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  26.37 
 
 		 388 aa  98.2  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1631  sodium/hydrogen exchanger  27.64 
 
 		 474 aa  98.6  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.599529 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0847  sodium/hydrogen exchanger  26.82 
 
 		 392 aa  97.8  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.461656  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3440  sodium/hydrogen exchanger  28.61 
 
 		 573 aa  97.4  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3561  sodium/hydrogen exchanger  27.6 
 
 		 420 aa  96.7  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  26.78 
 
 		 397 aa  96.3  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6352  sodium/hydrogen exchanger  25.8 
 
 		 436 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105497 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>