More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0581 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
416 aa  795    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  35.19 
 
 
445 aa  207  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  35.29 
 
 
398 aa  205  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  37.71 
 
 
385 aa  202  7e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  36.39 
 
 
389 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  36.53 
 
 
375 aa  194  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  32.52 
 
 
396 aa  193  4e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  33.58 
 
 
385 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  35.4 
 
 
375 aa  190  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  35.82 
 
 
375 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  35.14 
 
 
375 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  35.14 
 
 
375 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  35.14 
 
 
375 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  35.14 
 
 
375 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  33.84 
 
 
387 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.73 
 
 
427 aa  187  3e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  33.84 
 
 
387 aa  187  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  33.84 
 
 
387 aa  187  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  33.84 
 
 
387 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  35.49 
 
 
375 aa  187  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  34.68 
 
 
424 aa  187  4e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  33.59 
 
 
387 aa  186  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  33.59 
 
 
387 aa  186  7e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  33.67 
 
 
387 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  33.59 
 
 
387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  33.59 
 
 
387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  34.59 
 
 
424 aa  184  3e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  33.59 
 
 
387 aa  184  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  36.08 
 
 
375 aa  180  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  36.08 
 
 
375 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  33.51 
 
 
379 aa  179  4.999999999999999e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  35.82 
 
 
375 aa  178  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  33.16 
 
 
386 aa  174  2.9999999999999996e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  32.98 
 
 
375 aa  173  5e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  35 
 
 
412 aa  170  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  33 
 
 
382 aa  170  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  33.97 
 
 
467 aa  167  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  33.97 
 
 
467 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  31.89 
 
 
389 aa  166  5.9999999999999996e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  32.4 
 
 
423 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  33.5 
 
 
399 aa  166  8e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0706  sodium/hydrogen exchanger  34.29 
 
 
404 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.584868  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1868  sodium/hydrogen exchanger  33.26 
 
 
469 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  35.48 
 
 
395 aa  162  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2594  sodium/hydrogen exchanger  32.48 
 
 
491 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.02 
 
 
399 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  31.83 
 
 
404 aa  158  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.4 
 
 
418 aa  157  3e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3029  Sodium/hydrogen exchanger  33.1 
 
 
453 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75325  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  30.83 
 
 
400 aa  156  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3668  Sodium/hydrogen exchanger  32.52 
 
 
415 aa  156  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2107  sodium/hydrogen exchanger  32.99 
 
 
391 aa  155  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20501  CPA2 family Na+/H+ antiporter  31.21 
 
 
457 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0786073  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1175  Na+/H+ antiporter  31.21 
 
 
457 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4724  sodium/hydrogen exchanger  31.65 
 
 
473 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3809  sodium/hydrogen exchanger  33.08 
 
 
413 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.397158  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17221  CPA2 family Na+/H+ antiporter  31.35 
 
 
457 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.597221 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0868  hypothetical protein  34.53 
 
 
479 aa  150  6e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0839  hypothetical protein  34.53 
 
 
479 aa  149  8e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  29.1 
 
 
585 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25931  putative Na+/H+ antiporter, CPA2 family  30.99 
 
 
457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  28.22 
 
 
397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0153  CPA2 family Na+/H+ antiporter  31.51 
 
 
458 aa  147  4.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.430918  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1631  sodium/hydrogen exchanger  30.88 
 
 
474 aa  146  6e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.599529 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  28.54 
 
 
585 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3964  sodium/hydrogen exchanger  30.19 
 
 
402 aa  144  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0770173  normal  0.0859803 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  28.54 
 
 
585 aa  144  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.95 
 
 
587 aa  144  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3726  sodium/hydrogen exchanger  32.23 
 
 
413 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0183  CPA2 family Na+/H+ antiporter  30.8 
 
 
458 aa  143  5e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17871  CPA2 family Na+/H+ antiporter  29.2 
 
 
455 aa  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.69 
 
 
587 aa  141  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  28.22 
 
 
586 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  32.85 
 
 
399 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  27.85 
 
 
586 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  28.65 
 
 
352 aa  140  4.999999999999999e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2359  Na+/H+ antiporter  33.41 
 
 
460 aa  139  6e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  26.41 
 
 
585 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  27.43 
 
 
586 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1464  Sodium/hydrogen exchanger  33.91 
 
 
485 aa  139  8.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000329156  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  28.54 
 
 
586 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1081  sodium/hydrogen exchanger  29.92 
 
 
386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1692  CPA2 family Na+/H+ antiporter  29.2 
 
 
455 aa  137  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18091  CPA2 family Na+/H+ antiporter  28.98 
 
 
455 aa  137  4e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  26.1 
 
 
585 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17921  CPA2 family Na+/H+ antiporter  29.23 
 
 
455 aa  136  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3950  sodium/hydrogen exchanger  31.87 
 
 
414 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.387419 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1799  sodium/hydrogen exchanger  32.81 
 
 
462 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  26.4 
 
 
587 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  28.07 
 
 
414 aa  133  5e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1412  sodium/hydrogen exchanger  26.2 
 
 
395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.179509 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  30.08 
 
 
390 aa  131  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  32.49 
 
 
388 aa  131  3e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0454  Na+/H+ antiporter  30.81 
 
 
701 aa  129  8.000000000000001e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.809076  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0847  sodium/hydrogen exchanger  32.07 
 
 
392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.461656  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0606  sodium/hydrogen exchanger  31.44 
 
 
414 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1576  sodium/hydrogen exchanger  32.07 
 
 
392 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.000000405712  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1130  sodium/hydrogen exchanger  26.99 
 
 
586 aa  124  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.496723 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1099  sodium/hydrogen exchanger  32.24 
 
 
392 aa  124  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0863  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 
513 aa  122  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0750424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>