More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0706 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0706  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 404 aa  789    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.584868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  65.06 
 
 		 395 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  63.99 
 
 		 399 aa  479  1e-134  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  59.21 
 
 		 423 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  36.5 
 
 		 387 aa  213  7e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  36.5 
 
 		 387 aa  212  9e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  36.5 
 
 		 387 aa  212  9e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  36.25 
 
 		 387 aa  212  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  34.99 
 
 		 385 aa  211  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  36.25 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  35.99 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  35.68 
 
 		 387 aa  211  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  35.68 
 
 		 387 aa  211  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  35.99 
 
 		 387 aa  210  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  35.48 
 
 		 387 aa  206  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  38.07 
 
 		 382 aa  201  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  36.56 
 
 		 375 aa  199  6e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  36.56 
 
 		 375 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  36.56 
 
 		 375 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  36.56 
 
 		 375 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  36.56 
 
 		 375 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  36.56 
 
 		 375 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  36.46 
 
 		 375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  36.99 
 
 		 399 aa  195  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  36.1 
 
 		 375 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  33.75 
 
 		 396 aa  193  4e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  32.91 
 
 		 445 aa  189  9e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  36.29 
 
 		 375 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  36.29 
 
 		 375 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  36.29 
 
 		 375 aa  187  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  34.29 
 
 		 389 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  36.5 
 
 		 399 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  35.85 
 
 		 375 aa  171  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  35.69 
 
 		 385 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  33.61 
 
 		 398 aa  169  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  32.63 
 
 		 386 aa  169  1e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  33.94 
 
 		 412 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  34.29 
 
 		 416 aa  167  4e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  30.87 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.9 
 
 		 418 aa  161  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  32.11 
 
 		 379 aa  160  5e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1631  sodium/hydrogen exchanger  33.43 
 
 		 474 aa  157  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.599529 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  32.16 
 
 		 412 aa  156  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3668  Sodium/hydrogen exchanger  34.55 
 
 		 415 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3726  sodium/hydrogen exchanger  33.85 
 
 		 413 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.7 
 
 		 427 aa  150  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  32.61 
 
 		 467 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  32.61 
 
 		 467 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3809  sodium/hydrogen exchanger  33.16 
 
 		 413 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.397158  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  30.57 
 
 		 352 aa  147  3e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  30.96 
 
 		 424 aa  147  5e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  31.45 
 
 		 424 aa  147  5e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2594  sodium/hydrogen exchanger  32.01 
 
 		 491 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1464  Sodium/hydrogen exchanger  34.44 
 
 		 485 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000329156  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3964  sodium/hydrogen exchanger  30.5 
 
 		 402 aa  145  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0770173  normal  0.0859803 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  32.45 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0839  hypothetical protein  34.11 
 
 		 479 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  30.05 
 
 		 400 aa  139  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4724  sodium/hydrogen exchanger  34.04 
 
 		 473 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  28.07 
 
 		 586 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0868  hypothetical protein  33.82 
 
 		 479 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1868  sodium/hydrogen exchanger  34.54 
 
 		 469 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  27.25 
 
 		 586 aa  136  8e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3950  sodium/hydrogen exchanger  30.83 
 
 		 414 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.387419 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  26.98 
 
 		 586 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3029  Sodium/hydrogen exchanger  35.49 
 
 		 453 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  27.05 
 
 		 586 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1799  sodium/hydrogen exchanger  31.81 
 
 		 462 aa  133  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  28.34 
 
 		 585 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  28.93 
 
 		 741 aa  132  9e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.52 
 
 		 587 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  28.07 
 
 		 585 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  27.25 
 
 		 587 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.45 
 
 		 587 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  28.02 
 
 		 585 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0606  sodium/hydrogen exchanger  30.23 
 
 		 414 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  28.69 
 
 		 585 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  27.47 
 
 		 585 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2359  Na+/H+ antiporter  33.33 
 
 		 460 aa  126  8.000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1130  sodium/hydrogen exchanger  28.69 
 
 		 586 aa  125  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.496723 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  29.41 
 
 		 397 aa  125  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  27.82 
 
 		 414 aa  125  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2295  sodium/hydrogen exchanger  29.27 
 
 		 386 aa  123  6e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.784703 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2667  sodium/hydrogen exchanger  31.56 
 
 		 767 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0454  Na+/H+ antiporter  29.55 
 
 		 701 aa  121  1.9999999999999998e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.809076  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0960  Sodium/hydrogen exchanger  30.99 
 
 		 425 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848142  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1390  sodium/hydrogen exchanger  28.42 
 
 		 782 aa  121  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  26.42 
 
 		 460 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50516  predicted protein  30.61 
 
 		 806 aa  119  9e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0863  sodium/hydrogen exchanger  33.06 
 
 		 513 aa  119  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0750424  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1412  sodium/hydrogen exchanger  30.61 
 
 		 395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.179509 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.26 
 
 		 697 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1282  sodium/hydrogen exchanger  26.58 
 
 		 406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0433  sodium/hydrogen exchanger  27.72 
 
 		 387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  28.83 
 
 		 750 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04834  transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family  26.25 
 
 		 421 aa  117  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2552  sodium/hydrogen exchanger  29.06 
 
 		 747 aa  114  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.803467  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2302  sodium/hydrogen exchanger  26.68 
 
 		 423 aa  114  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113166  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  30.3 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17221  CPA2 family Na+/H+ antiporter  31.04 
 
 		 457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.597221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>