More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1464 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1464  Sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
485 aa  926    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000329156  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0863  sodium/hydrogen exchanger  85.81 
 
 
513 aa  675    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0750424  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4724  sodium/hydrogen exchanger  75.73 
 
 
473 aa  611  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1868  sodium/hydrogen exchanger  72.62 
 
 
469 aa  580  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3029  Sodium/hydrogen exchanger  69.61 
 
 
453 aa  559  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75325  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1631  sodium/hydrogen exchanger  65.51 
 
 
474 aa  558  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.599529 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  68.35 
 
 
467 aa  545  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  68.66 
 
 
467 aa  545  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2594  sodium/hydrogen exchanger  66.21 
 
 
491 aa  524  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1799  sodium/hydrogen exchanger  65.42 
 
 
462 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2359  Na+/H+ antiporter  62.42 
 
 
460 aa  448  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17221  CPA2 family Na+/H+ antiporter  45.39 
 
 
457 aa  325  9e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.597221 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20501  CPA2 family Na+/H+ antiporter  44.21 
 
 
457 aa  318  2e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0786073  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1175  Na+/H+ antiporter  44.21 
 
 
457 aa  318  2e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0183  CPA2 family Na+/H+ antiporter  46.24 
 
 
458 aa  313  3.9999999999999997e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25931  putative Na+/H+ antiporter, CPA2 family  45.14 
 
 
457 aa  313  4.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18091  CPA2 family Na+/H+ antiporter  44.87 
 
 
455 aa  311  2e-83  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17921  CPA2 family Na+/H+ antiporter  44.24 
 
 
455 aa  310  4e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1692  CPA2 family Na+/H+ antiporter  44.06 
 
 
455 aa  307  3e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17871  CPA2 family Na+/H+ antiporter  44.42 
 
 
455 aa  306  5.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0153  CPA2 family Na+/H+ antiporter  45.58 
 
 
458 aa  303  4.0000000000000003e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.430918  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3726  sodium/hydrogen exchanger  41.65 
 
 
413 aa  237  4e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3809  sodium/hydrogen exchanger  41.16 
 
 
413 aa  236  7e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.397158  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3668  Sodium/hydrogen exchanger  40.29 
 
 
415 aa  225  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  34.88 
 
 
404 aa  222  9.999999999999999e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0839  hypothetical protein  32.36 
 
 
479 aa  202  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0868  hypothetical protein  32.56 
 
 
479 aa  199  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  36.15 
 
 
385 aa  195  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  32.24 
 
 
385 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  32.24 
 
 
424 aa  189  9e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.94 
 
 
427 aa  188  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  33.56 
 
 
397 aa  188  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  32.55 
 
 
387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  31.46 
 
 
387 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  32.24 
 
 
424 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  31.92 
 
 
387 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  31.92 
 
 
387 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  32.32 
 
 
387 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  32.08 
 
 
387 aa  182  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  31.69 
 
 
387 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  31.69 
 
 
387 aa  182  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  34.67 
 
 
375 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  31.69 
 
 
387 aa  182  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  31.69 
 
 
387 aa  182  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  34.91 
 
 
375 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  34.91 
 
 
375 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  34.91 
 
 
375 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  34.91 
 
 
375 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  34.67 
 
 
375 aa  179  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  34.04 
 
 
375 aa  179  8e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  35.87 
 
 
398 aa  179  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  34.91 
 
 
375 aa  172  9e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  34.67 
 
 
375 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  34.67 
 
 
375 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  31.57 
 
 
396 aa  171  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.04 
 
 
399 aa  171  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  32.53 
 
 
375 aa  169  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  32.3 
 
 
382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  35.32 
 
 
400 aa  164  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3964  sodium/hydrogen exchanger  31.37 
 
 
402 aa  164  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0770173  normal  0.0859803 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  35.41 
 
 
399 aa  164  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  33.71 
 
 
412 aa  163  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.38 
 
 
418 aa  163  7e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  33.41 
 
 
389 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  29.88 
 
 
375 aa  152  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  28.93 
 
 
386 aa  148  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  31.68 
 
 
445 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  30.98 
 
 
416 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1576  sodium/hydrogen exchanger  31.71 
 
 
392 aa  146  8.000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.000000405712  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0847  sodium/hydrogen exchanger  31.47 
 
 
392 aa  144  3e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.461656  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1099  sodium/hydrogen exchanger  31.63 
 
 
392 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  29.67 
 
 
388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  32.2 
 
 
399 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  28.95 
 
 
390 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  29.63 
 
 
389 aa  137  4e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  32.53 
 
 
423 aa  136  8e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  34.69 
 
 
395 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  27.97 
 
 
379 aa  133  7.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  29.52 
 
 
412 aa  133  9e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  29.59 
 
 
749 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0706  sodium/hydrogen exchanger  35 
 
 
404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.584868  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  28.31 
 
 
388 aa  131  3e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  28.28 
 
 
756 aa  130  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  28.64 
 
 
388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1792  sodium/hydrogen exchanger  28.01 
 
 
388 aa  126  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.906777  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  29.91 
 
 
750 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  28.96 
 
 
352 aa  124  3e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  28.41 
 
 
748 aa  123  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.7 
 
 
587 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  28.7 
 
 
587 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  29.28 
 
 
586 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.7 
 
 
587 aa  120  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2302  sodium/hydrogen exchanger  28.08 
 
 
423 aa  120  7e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113166  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  28.61 
 
 
586 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  28.61 
 
 
586 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  28.33 
 
 
586 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0454  Na+/H+ antiporter  25.32 
 
 
701 aa  117  3.9999999999999997e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.809076  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  28.81 
 
 
585 aa  117  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  29.31 
 
 
460 aa  117  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  28.81 
 
 
585 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>