More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1557 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
404 aa  770    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  38.99 
 
 
397 aa  265  7e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3964  sodium/hydrogen exchanger  37.76 
 
 
402 aa  258  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0770173  normal  0.0859803 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  37.05 
 
 
467 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  37.05 
 
 
467 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1868  sodium/hydrogen exchanger  35.66 
 
 
469 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3029  Sodium/hydrogen exchanger  35.43 
 
 
453 aa  213  5.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75325  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4724  sodium/hydrogen exchanger  36.05 
 
 
473 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1631  sodium/hydrogen exchanger  33.03 
 
 
474 aa  210  5e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.599529 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2594  sodium/hydrogen exchanger  35.14 
 
 
491 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0863  sodium/hydrogen exchanger  35.35 
 
 
513 aa  187  4e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0750424  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  33.17 
 
 
396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  35.68 
 
 
385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1464  Sodium/hydrogen exchanger  36.92 
 
 
485 aa  183  6e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000329156  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3809  sodium/hydrogen exchanger  32.99 
 
 
413 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.397158  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  33.85 
 
 
389 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  34.67 
 
 
375 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  34.34 
 
 
375 aa  179  8e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3668  Sodium/hydrogen exchanger  33.25 
 
 
415 aa  179  8e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  34.34 
 
 
375 aa  179  9e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  34.34 
 
 
375 aa  179  9e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  34.34 
 
 
375 aa  179  9e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  34.34 
 
 
375 aa  179  9e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  34.67 
 
 
375 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  33.67 
 
 
400 aa  176  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  34.43 
 
 
375 aa  176  6e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17221  CPA2 family Na+/H+ antiporter  31.22 
 
 
457 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.597221 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1799  sodium/hydrogen exchanger  32.87 
 
 
462 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18091  CPA2 family Na+/H+ antiporter  30.61 
 
 
455 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1175  Na+/H+ antiporter  31.93 
 
 
457 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1692  CPA2 family Na+/H+ antiporter  30.84 
 
 
455 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20501  CPA2 family Na+/H+ antiporter  31.93 
 
 
457 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0786073  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3726  sodium/hydrogen exchanger  33.42 
 
 
413 aa  173  5e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  32.98 
 
 
386 aa  173  5e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17921  CPA2 family Na+/H+ antiporter  30.61 
 
 
455 aa  172  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2359  Na+/H+ antiporter  35.1 
 
 
460 aa  172  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25931  putative Na+/H+ antiporter, CPA2 family  31.57 
 
 
457 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0868  hypothetical protein  33.95 
 
 
479 aa  171  3e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0839  hypothetical protein  33.72 
 
 
479 aa  170  5e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  34.34 
 
 
375 aa  169  8e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  34.34 
 
 
375 aa  169  8e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  34.34 
 
 
375 aa  169  9e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17871  CPA2 family Na+/H+ antiporter  30.95 
 
 
455 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0153  CPA2 family Na+/H+ antiporter  30.57 
 
 
458 aa  166  5e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.430918  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  33.5 
 
 
385 aa  166  9e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  35.92 
 
 
399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0183  CPA2 family Na+/H+ antiporter  31.02 
 
 
458 aa  165  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  32.59 
 
 
387 aa  160  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  32.59 
 
 
387 aa  159  9e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  32.34 
 
 
387 aa  159  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  32.34 
 
 
387 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  32.34 
 
 
387 aa  159  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  33 
 
 
387 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  32.09 
 
 
387 aa  158  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  32.09 
 
 
387 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  33 
 
 
387 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  32.04 
 
 
586 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  31.59 
 
 
387 aa  156  7e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  31.27 
 
 
586 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  31.96 
 
 
586 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  31.78 
 
 
585 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  31.83 
 
 
416 aa  153  4e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  31.56 
 
 
375 aa  152  7e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  31.52 
 
 
586 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  30.67 
 
 
382 aa  152  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  32.99 
 
 
398 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  30.83 
 
 
587 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  31.27 
 
 
585 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  29.43 
 
 
424 aa  149  7e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  30.42 
 
 
424 aa  149  9e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.52 
 
 
587 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  30.3 
 
 
379 aa  147  4.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  31.7 
 
 
389 aa  146  5e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  30.61 
 
 
399 aa  146  6e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.38 
 
 
427 aa  145  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  27.3 
 
 
412 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.09 
 
 
587 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  33.07 
 
 
423 aa  144  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0847  sodium/hydrogen exchanger  32.52 
 
 
392 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.461656  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  35.12 
 
 
399 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.54 
 
 
418 aa  137  4e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1576  sodium/hydrogen exchanger  32.98 
 
 
392 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.000000405712  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1099  sodium/hydrogen exchanger  32.53 
 
 
392 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  32.8 
 
 
388 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  31.47 
 
 
352 aa  128  1.0000000000000001e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1130  sodium/hydrogen exchanger  30.61 
 
 
586 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.496723 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  29.31 
 
 
585 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  30.62 
 
 
445 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  29.31 
 
 
585 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  29.56 
 
 
585 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  29.77 
 
 
395 aa  126  7e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2295  sodium/hydrogen exchanger  29.31 
 
 
386 aa  126  7e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.784703 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  29.72 
 
 
390 aa  124  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  25.8 
 
 
748 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  31.03 
 
 
412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  31.12 
 
 
388 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50516  predicted protein  28.18 
 
 
806 aa  119  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0706  sodium/hydrogen exchanger  32.8 
 
 
404 aa  117  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.584868  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  30.32 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5016  sodium/hydrogen exchanger  28.96 
 
 
745 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>