More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3964 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3964  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 402 aa  790    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0770173  normal  0.0859803 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  63.52 
 
 		 397 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  37.76 
 
 		 404 aa  269  8e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  31.63 
 
 		 467 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  31.63 
 
 		 467 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1631  sodium/hydrogen exchanger  35.28 
 
 		 474 aa  182  8.000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.599529 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  32.82 
 
 		 385 aa  179  7e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  31.53 
 
 		 387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  31.53 
 
 		 387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  31.53 
 
 		 387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  31.09 
 
 		 387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4724  sodium/hydrogen exchanger  30.88 
 
 		 473 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  31.09 
 
 		 387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  31.92 
 
 		 387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2594  sodium/hydrogen exchanger  31.48 
 
 		 491 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  31.28 
 
 		 387 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  31.28 
 
 		 387 aa  173  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  31.03 
 
 		 387 aa  172  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1868  sodium/hydrogen exchanger  30.88 
 
 		 469 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  31.28 
 
 		 387 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  33.95 
 
 		 379 aa  171  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3029  Sodium/hydrogen exchanger  30.28 
 
 		 453 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75325  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  32.98 
 
 		 375 aa  167  4e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  31.22 
 
 		 375 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  31.22 
 
 		 375 aa  166  8e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  31.22 
 
 		 375 aa  166  8e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  31.22 
 
 		 375 aa  166  8e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  31.22 
 
 		 375 aa  166  8e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  30.71 
 
 		 375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  30.96 
 
 		 375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  31.22 
 
 		 375 aa  164  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  31.25 
 
 		 396 aa  161  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  29.74 
 
 		 386 aa  160  4e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  32.57 
 
 		 399 aa  160  5e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1799  sodium/hydrogen exchanger  33.14 
 
 		 462 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  30.53 
 
 		 389 aa  158  2e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20501  CPA2 family Na+/H+ antiporter  31.07 
 
 		 457 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0786073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1175  Na+/H+ antiporter  31.07 
 
 		 457 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3668  Sodium/hydrogen exchanger  33.08 
 
 		 415 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3809  sodium/hydrogen exchanger  34.26 
 
 		 413 aa  155  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.397158  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  31.22 
 
 		 375 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  31.22 
 
 		 375 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  31.22 
 
 		 375 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17221  CPA2 family Na+/H+ antiporter  31.26 
 
 		 457 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.597221 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1464  Sodium/hydrogen exchanger  32.28 
 
 		 485 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000329156  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0839  hypothetical protein  32.99 
 
 		 479 aa  153  4e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3726  sodium/hydrogen exchanger  33.84 
 
 		 413 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2359  Na+/H+ antiporter  31.85 
 
 		 460 aa  152  7e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0868  hypothetical protein  33.25 
 
 		 479 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  31.51 
 
 		 385 aa  151  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  30.19 
 
 		 416 aa  150  4e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  31.04 
 
 		 389 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  31.75 
 
 		 423 aa  147  3e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  28.39 
 
 		 412 aa  147  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18091  CPA2 family Na+/H+ antiporter  31.55 
 
 		 455 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  31.28 
 
 		 445 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17871  CPA2 family Na+/H+ antiporter  31.55 
 
 		 455 aa  144  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25931  putative Na+/H+ antiporter, CPA2 family  32.53 
 
 		 457 aa  143  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17921  CPA2 family Na+/H+ antiporter  32.02 
 
 		 455 aa  143  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  32.64 
 
 		 395 aa  143  5e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  30.05 
 
 		 398 aa  143  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0863  sodium/hydrogen exchanger  31.46 
 
 		 513 aa  142  7e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0750424  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1692  CPA2 family Na+/H+ antiporter  31.79 
 
 		 455 aa  142  9e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0153  CPA2 family Na+/H+ antiporter  28.37 
 
 		 458 aa  139  8.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.430918  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.99 
 
 		 399 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.51 
 
 		 418 aa  138  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  26.89 
 
 		 382 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0183  CPA2 family Na+/H+ antiporter  30 
 
 		 458 aa  134  3e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0706  sodium/hydrogen exchanger  30.86 
 
 		 404 aa  133  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.584868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  29 
 
 		 424 aa  133  6e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  29.97 
 
 		 400 aa  133  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  29 
 
 		 427 aa  132  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  28.77 
 
 		 424 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  29.87 
 
 		 390 aa  126  6e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  32.65 
 
 		 412 aa  126  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  28.3 
 
 		 352 aa  122  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  26.51 
 
 		 748 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  27.05 
 
 		 749 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  30.05 
 
 		 750 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2295  sodium/hydrogen exchanger  29.92 
 
 		 386 aa  116  6e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.784703 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2098  sodium/hydrogen exchanger  29.49 
 
 		 584 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0668  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  28.39 
 
 		 584 aa  114  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.457032  normal  0.0419012 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  27.45 
 
 		 414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  26.92 
 
 		 586 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  26.92 
 
 		 586 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  26.67 
 
 		 586 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  29.78 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  26.92 
 
 		 586 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0736  sodium/hydrogen exchanger  26.9 
 
 		 495 aa  111  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1645  sodium/hydrogen exchanger  28.61 
 
 		 586 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1099  sodium/hydrogen exchanger  29.31 
 
 		 392 aa  111  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0847  sodium/hydrogen exchanger  30.19 
 
 		 392 aa  110  5e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.461656  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1576  sodium/hydrogen exchanger  29.23 
 
 		 392 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.000000405712  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1550  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  28.28 
 
 		 582 aa  108  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00125081  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  27.66 
 
 		 741 aa  108  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  28.36 
 
 		 482 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  26.58 
 
 		 587 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1853  sodium/hydrogen exchanger  28.34 
 
 		 688 aa  107  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000204486  normal  0.40293 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0433  sodium/hydrogen exchanger  26.7 
 
 		 387 aa  107  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  26.46 
 
 		 460 aa  106  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>