More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1645 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1645  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 586 aa  1155    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0668  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  82.02 
 
 		 584 aa  947    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.457032  normal  0.0419012 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1550  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  75.26 
 
 		 582 aa  837    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00125081  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0917  sodium/hydrogen exchanger  84.26 
 
 		 585 aa  979    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2098  sodium/hydrogen exchanger  83.91 
 
 		 584 aa  953    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  40.55 
 
 		 674 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  39.86 
 
 		 665 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  38.93 
 
 		 741 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  38.89 
 
 		 672 aa  372  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  38.19 
 
 		 697 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  38.7 
 
 		 636 aa  370  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  38.66 
 
 		 665 aa  368  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  38.33 
 
 		 666 aa  362  1e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  37.95 
 
 		 658 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1853  sodium/hydrogen exchanger  38.18 
 
 		 688 aa  353  4e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000204486  normal  0.40293 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  39.18 
 
 		 666 aa  348  1e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  37.3 
 
 		 682 aa  348  2e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  38.79 
 
 		 666 aa  339  9e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  35.88 
 
 		 664 aa  338  1.9999999999999998e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  37.75 
 
 		 671 aa  334  3e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  39.69 
 
 		 668 aa  334  3e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  35.24 
 
 		 670 aa  332  1e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  35.74 
 
 		 663 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0988  sodium/hydrogen exchanger  36.55 
 
 		 676 aa  323  4e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  36.21 
 
 		 666 aa  321  1.9999999999999998e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0955  sodium/hydrogen exchanger  38.5 
 
 		 672 aa  317  5e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00880864  normal  0.316 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  36.43 
 
 		 656 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  33.45 
 
 		 664 aa  303  7.000000000000001e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  35.82 
 
 		 693 aa  301  2e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5710  sodium/hydrogen exchanger  37.02 
 
 		 679 aa  294  3e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3434  sodium/hydrogen exchanger  36.21 
 
 		 577 aa  291  3e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  34.8 
 
 		 666 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  34.01 
 
 		 667 aa  281  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  33.39 
 
 		 668 aa  281  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  34.8 
 
 		 667 aa  281  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  34.25 
 
 		 663 aa  280  5e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  33.57 
 
 		 678 aa  280  7e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2171  sodium/hydrogen exchanger  32.98 
 
 		 668 aa  280  7e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2796  sodium/hydrogen exchanger  32.98 
 
 		 668 aa  280  7e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0879164 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2785  sodium/hydrogen exchanger  32.98 
 
 		 668 aa  280  7e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0657605  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  35.44 
 
 		 659 aa  279  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  34.32 
 
 		 669 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  34.32 
 
 		 669 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  34.32 
 
 		 663 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  34.32 
 
 		 669 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1520  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  34.32 
 
 		 669 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418182  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  34.32 
 
 		 669 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  34.32 
 
 		 669 aa  278  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2703  sodium/hydrogen exchanger  33.27 
 
 		 670 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2845  sodium/hydrogen exchanger  34.08 
 
 		 670 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0613147  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  30.68 
 
 		 775 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  31.42 
 
 		 648 aa  274  3e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  31.42 
 
 		 648 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  31.42 
 
 		 648 aa  273  6e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  34.48 
 
 		 674 aa  273  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  31.71 
 
 		 649 aa  273  7e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.34 
 
 		 567 aa  270  4e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  31.08 
 
 		 648 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  30.59 
 
 		 648 aa  268  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  30.59 
 
 		 648 aa  268  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000490638 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1976  sodium/hydrogen exchanger  31.59 
 
 		 666 aa  268  2.9999999999999995e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  30.87 
 
 		 648 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  33.81 
 
 		 762 aa  267  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  32.11 
 
 		 650 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  31.93 
 
 		 567 aa  265  1e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  31.63 
 
 		 567 aa  265  1e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  30.73 
 
 		 648 aa  265  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  30.78 
 
 		 649 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3417  potassium efflux system protein  33.7 
 
 		 652 aa  262  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00166015  normal  0.19535 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  29.77 
 
 		 662 aa  262  1e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  32.55 
 
 		 648 aa  262  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  31.01 
 
 		 773 aa  261  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  34.31 
 
 		 660 aa  261  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  34 
 
 		 660 aa  261  3e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  32.26 
 
 		 661 aa  259  7e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  32.26 
 
 		 661 aa  259  7e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000235169 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1271  sodium/hydrogen exchanger  36.32 
 
 		 457 aa  259  8e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3810  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.52 
 
 		 680 aa  258  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.162531 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  33.16 
 
 		 673 aa  258  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  31.88 
 
 		 650 aa  258  2e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  31.67 
 
 		 653 aa  258  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  32.24 
 
 		 652 aa  257  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4238  sodium/hydrogen exchanger  32.84 
 
 		 656 aa  257  5e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  29.53 
 
 		 771 aa  250  5e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  32.98 
 
 		 671 aa  249  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0802  sodium/hydrogen exchanger  32.49 
 
 		 583 aa  249  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  32.33 
 
 		 649 aa  249  1e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  31.26 
 
 		 654 aa  249  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  30.89 
 
 		 649 aa  248  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0767  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.26 
 
 		 539 aa  247  4e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000529307  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5295  sodium/hydrogen exchanger  32.33 
 
 		 661 aa  247  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0974  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.61 
 
 		 543 aa  246  9.999999999999999e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.705651  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  33.4 
 
 		 658 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4668  sodium/hydrogen exchanger  31.56 
 
 		 594 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0852287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1761  potassium efflux system protein  31.35 
 
 		 616 aa  243  7e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00639423 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0261  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.53 
 
 		 588 aa  243  9e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  31.23 
 
 		 665 aa  243  9e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1076  sodium/hydrogen exchanger  31.23 
 
 		 665 aa  243  9e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1457  K+ efflux antiporter, putative (KEA1)  30.26 
 
 		 583 aa  242  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  31.28 
 
 		 662 aa  240  4e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>