More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2295 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2295  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
386 aa  716    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.784703 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0433  sodium/hydrogen exchanger  32.1 
 
 
387 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.129504  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  32.73 
 
 
400 aa  166  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  30.16 
 
 
375 aa  160  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  32.27 
 
 
389 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  32.19 
 
 
390 aa  157  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  29.62 
 
 
375 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  31 
 
 
375 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  31 
 
 
375 aa  155  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0499  NaH antiporter protein  31.22 
 
 
389 aa  155  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  31 
 
 
375 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  31 
 
 
375 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  30.73 
 
 
375 aa  153  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  31.87 
 
 
445 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  28.53 
 
 
375 aa  152  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  30.14 
 
 
387 aa  150  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  29.86 
 
 
387 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  29.86 
 
 
387 aa  149  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  29.86 
 
 
387 aa  149  8e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  29.86 
 
 
387 aa  149  8e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  29.86 
 
 
387 aa  149  8e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  29.86 
 
 
387 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  29.86 
 
 
387 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  29.86 
 
 
387 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  29.86 
 
 
387 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  29.35 
 
 
414 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  31 
 
 
375 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  28.03 
 
 
385 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  30.73 
 
 
375 aa  143  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  30.73 
 
 
375 aa  143  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  31.27 
 
 
412 aa  139  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  30.68 
 
 
382 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  29.1 
 
 
404 aa  134  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  29.19 
 
 
399 aa  134  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  27.13 
 
 
399 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  31.38 
 
 
412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  25.67 
 
 
386 aa  129  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0960  Sodium/hydrogen exchanger  30.12 
 
 
425 aa  127  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848142  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  27.89 
 
 
397 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  29.25 
 
 
388 aa  126  6e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1792  sodium/hydrogen exchanger  29.25 
 
 
388 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.906777  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  29 
 
 
388 aa  123  6e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  28.5 
 
 
748 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2594  sodium/hydrogen exchanger  31.08 
 
 
491 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  29.28 
 
 
398 aa  120  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  27.09 
 
 
388 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.34 
 
 
418 aa  120  6e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0325  sodium/hydrogen exchanger  26.19 
 
 
398 aa  119  7.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3950  sodium/hydrogen exchanger  28.46 
 
 
414 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.387419 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  27.68 
 
 
396 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  26.69 
 
 
375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  30.11 
 
 
423 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  25.56 
 
 
756 aa  115  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  26.56 
 
 
389 aa  113  6e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  28.27 
 
 
587 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  29.85 
 
 
385 aa  112  9e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0706  sodium/hydrogen exchanger  29 
 
 
404 aa  112  9e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.584868  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3964  sodium/hydrogen exchanger  29.29 
 
 
402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0770173  normal  0.0859803 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  25.82 
 
 
416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  26.52 
 
 
750 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0606  sodium/hydrogen exchanger  29.95 
 
 
414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  26.72 
 
 
379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  27.2 
 
 
585 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  29.02 
 
 
467 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  29.02 
 
 
467 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3828  sodium/hydrogen exchanger  25.5 
 
 
715 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3878  sodium/hydrogen exchanger  25.25 
 
 
715 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.267583  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3809  sodium/hydrogen exchanger  32.8 
 
 
413 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.397158  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1576  sodium/hydrogen exchanger  30.56 
 
 
392 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.000000405712  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  27.2 
 
 
585 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  29.41 
 
 
460 aa  109  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  28.42 
 
 
586 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1099  sodium/hydrogen exchanger  28.49 
 
 
392 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  31.2 
 
 
395 aa  108  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3726  sodium/hydrogen exchanger  31.42 
 
 
413 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  27.89 
 
 
586 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3668  Sodium/hydrogen exchanger  31.5 
 
 
415 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  28.16 
 
 
586 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  25.5 
 
 
352 aa  107  4e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43795  K(+)/H(+) antiporter  25.58 
 
 
816 aa  106  6e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00004515  normal  0.344688 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  28.46 
 
 
586 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0847  sodium/hydrogen exchanger  29.2 
 
 
392 aa  106  8e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.461656  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.76 
 
 
587 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  26.1 
 
 
764 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.44 
 
 
587 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  28.04 
 
 
399 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  28.3 
 
 
424 aa  103  7e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4036  sodium/hydrogen exchanger  27.58 
 
 
422 aa  102  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554914  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.92 
 
 
427 aa  102  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1474  sodium/hydrogen exchanger  27.93 
 
 
703 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00326365  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  28.38 
 
 
585 aa  101  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4724  sodium/hydrogen exchanger  27.15 
 
 
473 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1799  sodium/hydrogen exchanger  30.28 
 
 
462 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0791  Na+/H+ antiporter, putative  26.3 
 
 
448 aa  100  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0935  sodium/hydrogen exchanger  26.3 
 
 
448 aa  100  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2667  sodium/hydrogen exchanger  27.23 
 
 
435 aa  100  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01290  potassium ion/proton antiporter (Eurofung)  26.65 
 
 
883 aa  99.8  7e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.721044  normal  0.960342 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  27.06 
 
 
749 aa  99.4  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  27.86 
 
 
424 aa  99  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1868  sodium/hydrogen exchanger  28.28 
 
 
469 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>