More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0153 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0183  CPA2 family Na+/H+ antiporter  89.08 
 
 		 458 aa  742    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0153  CPA2 family Na+/H+ antiporter  100 
 
 		 458 aa  874    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.430918  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1175  Na+/H+ antiporter  71.81 
 
 		 457 aa  618  1e-176  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20501  CPA2 family Na+/H+ antiporter  71.81 
 
 		 457 aa  618  1e-176  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0786073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17221  CPA2 family Na+/H+ antiporter  71.96 
 
 		 457 aa  617  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.597221 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18091  CPA2 family Na+/H+ antiporter  72 
 
 		 455 aa  606  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1692  CPA2 family Na+/H+ antiporter  72.61 
 
 		 455 aa  600  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25931  putative Na+/H+ antiporter, CPA2 family  72.91 
 
 		 457 aa  599  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17921  CPA2 family Na+/H+ antiporter  72.16 
 
 		 455 aa  597  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17871  CPA2 family Na+/H+ antiporter  71.56 
 
 		 455 aa  590  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1868  sodium/hydrogen exchanger  47.54 
 
 		 469 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4724  sodium/hydrogen exchanger  47.58 
 
 		 473 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2594  sodium/hydrogen exchanger  50.24 
 
 		 491 aa  342  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3029  Sodium/hydrogen exchanger  46.94 
 
 		 453 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  46.82 
 
 		 467 aa  335  7.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  46.82 
 
 		 467 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1631  sodium/hydrogen exchanger  45.43 
 
 		 474 aa  326  4.0000000000000003e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.599529 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1799  sodium/hydrogen exchanger  45.73 
 
 		 462 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0863  sodium/hydrogen exchanger  46.79 
 
 		 513 aa  286  5e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0750424  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1464  Sodium/hydrogen exchanger  46.99 
 
 		 485 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000329156  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2359  Na+/H+ antiporter  44.24 
 
 		 460 aa  271  2e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  30.56 
 
 		 404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0868  hypothetical protein  33.54 
 
 		 479 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0839  hypothetical protein  32.85 
 
 		 479 aa  180  5.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3668  Sodium/hydrogen exchanger  37.35 
 
 		 415 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  33.1 
 
 		 398 aa  170  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3809  sodium/hydrogen exchanger  37.68 
 
 		 413 aa  167  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.397158  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  32.15 
 
 		 385 aa  166  8e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.11 
 
 		 427 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3726  sodium/hydrogen exchanger  36.7 
 
 		 413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  31.46 
 
 		 397 aa  164  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  30.99 
 
 		 416 aa  160  6e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  32.56 
 
 		 424 aa  157  3e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  32.18 
 
 		 424 aa  157  3e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3964  sodium/hydrogen exchanger  29.74 
 
 		 402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0770173  normal  0.0859803 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  30.98 
 
 		 396 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  27.62 
 
 		 385 aa  145  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  30.71 
 
 		 389 aa  144  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  30.3 
 
 		 748 aa  143  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  29.41 
 
 		 386 aa  143  6e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  26.97 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  26.97 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  26.73 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  26.97 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  29.77 
 
 		 749 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  26.73 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  26.73 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  28.71 
 
 		 375 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  28.71 
 
 		 375 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  28.71 
 
 		 375 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  26.73 
 
 		 387 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  28.71 
 
 		 375 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  26.73 
 
 		 387 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  26.49 
 
 		 387 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  28.47 
 
 		 375 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  27.21 
 
 		 387 aa  140  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  28.22 
 
 		 375 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  29.13 
 
 		 375 aa  139  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  30.12 
 
 		 389 aa  136  6.0000000000000005e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  28.22 
 
 		 375 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  30.73 
 
 		 382 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  27.74 
 
 		 375 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  27.49 
 
 		 375 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  27.49 
 
 		 375 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  30.38 
 
 		 445 aa  128  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  30.48 
 
 		 423 aa  126  9e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  29.66 
 
 		 750 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  29.5 
 
 		 399 aa  121  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  29.29 
 
 		 379 aa  120  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  27.8 
 
 		 399 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  28.29 
 
 		 375 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  30.84 
 
 		 412 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  28.64 
 
 		 585 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.77 
 
 		 418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  28.64 
 
 		 585 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  27.48 
 
 		 587 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  27.78 
 
 		 586 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  27.54 
 
 		 586 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  27.55 
 
 		 586 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  28.7 
 
 		 352 aa  113  7.000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0706  sodium/hydrogen exchanger  31.07 
 
 		 404 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.584868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  31 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  27.29 
 
 		 586 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  24.41 
 
 		 390 aa  111  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  27.71 
 
 		 399 aa  110  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  29.48 
 
 		 388 aa  109  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  31.27 
 
 		 395 aa  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  27.99 
 
 		 585 aa  107  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  28.5 
 
 		 585 aa  106  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  26.58 
 
 		 756 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  27.8 
 
 		 412 aa  102  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.28 
 
 		 587 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.46 
 
 		 587 aa  101  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  27.74 
 
 		 585 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1576  sodium/hydrogen exchanger  28.53 
 
 		 392 aa  100  7e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.000000405712  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1099  sodium/hydrogen exchanger  28.27 
 
 		 392 aa  99  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4036  sodium/hydrogen exchanger  28.34 
 
 		 422 aa  99.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554914  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50516  predicted protein  26.76 
 
 		 806 aa  97.4  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6352  sodium/hydrogen exchanger  28.67 
 
 		 436 aa  97.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105497 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1107  sodium/hydrogen exchanger  26.73 
 
 		 775 aa  97.1  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112633  normal  0.12903 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>