More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1107 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  58.5 
 
 		 756 aa  935    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1107  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 775 aa  1574    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112633  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  59.07 
 
 		 764 aa  907    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  56.69 
 
 		 482 aa  496  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  37.77 
 
 		 767 aa  485  1e-135  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3878  sodium/hydrogen exchanger  37.72 
 
 		 715 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.267583  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3828  sodium/hydrogen exchanger  37.72 
 
 		 715 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0546  Na+/H+ antiporter  40.26 
 
 		 715 aa  377  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1632  Sodium/hydrogen exchanger  40.93 
 
 		 723 aa  363  6e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.531828 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2552  sodium/hydrogen exchanger  38.57 
 
 		 747 aa  360  5e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.803467  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0736  sodium/hydrogen exchanger  44.29 
 
 		 495 aa  335  2e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1281  sodium/hydrogen exchanger  43.17 
 
 		 460 aa  317  7e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345739  normal  0.428465 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1396  sodium/hydrogen exchanger  41.89 
 
 		 689 aa  307  6e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0052164  normal  0.118619 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3561  sodium/hydrogen exchanger  41.46 
 
 		 420 aa  295  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01670  potassium:hydrogen antiporter, putative  38.06 
 
 		 951 aa  282  1e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2302  sodium/hydrogen exchanger  39.7 
 
 		 423 aa  274  5.000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1474  sodium/hydrogen exchanger  44.18 
 
 		 703 aa  273  1e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00326365  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3558  sodium/hydrogen exchanger  36.09 
 
 		 455 aa  262  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0791  Na+/H+ antiporter, putative  38.85 
 
 		 448 aa  258  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0935  sodium/hydrogen exchanger  38.85 
 
 		 448 aa  258  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4342  sodium/hydrogen exchanger  39.66 
 
 		 416 aa  257  6e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.322852  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04834  transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family  36 
 
 		 421 aa  256  9e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3562  sodium/hydrogen exchanger  42.97 
 
 		 429 aa  252  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01290  potassium ion/proton antiporter (Eurofung)  36.8 
 
 		 883 aa  248  3e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.721044  normal  0.960342 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1098  sodium/hydrogen exchanger  38.33 
 
 		 419 aa  248  4e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000276702  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5898  Kef-type K+ transport systems membrane components-like protein  36.78 
 
 		 683 aa  243  7e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103243  normal  0.0297868 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43795  K(+)/H(+) antiporter  36.17 
 
 		 816 aa  243  9e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00004515  normal  0.344688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4109  sodium/hydrogen exchanger  36.32 
 
 		 425 aa  241  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.478962 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0928  sodium/hydrogen exchanger family protein  40 
 
 		 430 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4036  sodium/hydrogen exchanger  36.5 
 
 		 422 aa  221  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554914  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2757  sodium/hydrogen exchanger family protein  37.91 
 
 		 442 aa  219  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.224799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3175  sodium/hydrogen exchanger  41.93 
 
 		 416 aa  215  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3445  sodium/hydrogen exchanger  36.34 
 
 		 427 aa  214  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243488 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1229  sodium/hydrogen exchanger  34.67 
 
 		 410 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.440766  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  27.06 
 
 		 748 aa  192  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1654  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  34.76 
 
 		 410 aa  187  7e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148564  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1572  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  34.76 
 
 		 410 aa  187  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2714  sodium/hydrogen exchanger  35.43 
 
 		 439 aa  186  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0143  sodium/hydrogen exchanger  34.76 
 
 		 410 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6352  sodium/hydrogen exchanger  29.41 
 
 		 436 aa  185  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105497 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5813  sodium/hydrogen exchanger  32.08 
 
 		 414 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  30.77 
 
 		 750 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  31.18 
 
 		 749 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2132  sodium/hydrogen exchanger  33.99 
 
 		 425 aa  180  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2667  sodium/hydrogen exchanger  31.41 
 
 		 435 aa  179  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6043  sodium/hydrogen exchanger  31.58 
 
 		 414 aa  177  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4159  sodium/hydrogen exchanger  29.02 
 
 		 446 aa  175  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4038  sodium/hydrogen exchanger  31.99 
 
 		 406 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3484  sodium/hydrogen exchanger  31.82 
 
 		 406 aa  171  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.861174  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  29.88 
 
 		 460 aa  171  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0995  sodium/hydrogen exchanger  32.26 
 
 		 452 aa  164  7e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0913  sodium/hydrogen exchanger  30.23 
 
 		 413 aa  164  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1476  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  31.25 
 
 		 547 aa  159  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0269203  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0450  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  31.88 
 
 		 625 aa  159  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.26198  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2617  sodium/hydrogen exchanger  31.88 
 
 		 592 aa  158  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.129932  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1391  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  31.79 
 
 		 547 aa  157  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1208  sodium/hydrogen exchanger  31.79 
 
 		 410 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0581239  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1126  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  31.79 
 
 		 410 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.251778  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0173  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  31.79 
 
 		 410 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.661692  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1412  sodium/hydrogen exchanger  28 
 
 		 424 aa  147  9e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2332  sodium/hydrogen exchanger  27.71 
 
 		 444 aa  145  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2104  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  27.01 
 
 		 444 aa  143  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.134319  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2049  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  27.01 
 
 		 444 aa  144  9e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1004  sodium/hydrogen exchanger  27.01 
 
 		 444 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0864919  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2241  sodium/hydrogen exchanger  27.01 
 
 		 444 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310432  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  27.78 
 
 		 412 aa  142  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3440  sodium/hydrogen exchanger  28.46 
 
 		 573 aa  140  7.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3203  sodium/hydrogen exchanger  27.2 
 
 		 404 aa  137  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  28.88 
 
 		 389 aa  137  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  28.11 
 
 		 400 aa  136  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  27.46 
 
 		 382 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  28.5 
 
 		 414 aa  134  7.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  27.81 
 
 		 385 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4191  Sodium/hydrogen exchanger  26.81 
 
 		 399 aa  128  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  28.4 
 
 		 396 aa  128  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  26.54 
 
 		 387 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  26.54 
 
 		 387 aa  126  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  27.93 
 
 		 467 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  27.93 
 
 		 467 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  28.57 
 
 		 424 aa  125  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  26.54 
 
 		 387 aa  125  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  26.54 
 
 		 387 aa  125  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  26.54 
 
 		 387 aa  125  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.48 
 
 		 427 aa  124  6e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  27.59 
 
 		 424 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  27.3 
 
 		 385 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  28.01 
 
 		 445 aa  122  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1868  sodium/hydrogen exchanger  29.05 
 
 		 469 aa  122  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  26.04 
 
 		 387 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  26.53 
 
 		 387 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2667  sodium/hydrogen exchanger  28.47 
 
 		 767 aa  121  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  26.29 
 
 		 387 aa  120  9e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  26.29 
 
 		 387 aa  120  9e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3230  sodium/hydrogen exchanger  26.77 
 
 		 401 aa  119  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.42 
 
 		 399 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  26.16 
 
 		 387 aa  119  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  27.27 
 
 		 375 aa  117  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4587  Sodium/hydrogen exchanger  23.12 
 
 		 712 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.71 
 
 		 418 aa  116  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2594  sodium/hydrogen exchanger  27.8 
 
 		 491 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.15214 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>