247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0913 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0913  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 413 aa  811    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5813  sodium/hydrogen exchanger  38.04 
 
 		 414 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4038  sodium/hydrogen exchanger  38.29 
 
 		 406 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6043  sodium/hydrogen exchanger  37.59 
 
 		 414 aa  240  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3484  sodium/hydrogen exchanger  37.78 
 
 		 406 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.861174  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1229  sodium/hydrogen exchanger  36.3 
 
 		 410 aa  220  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.440766  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0143  sodium/hydrogen exchanger  36.95 
 
 		 410 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1572  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  36.54 
 
 		 410 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1654  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  36.69 
 
 		 410 aa  213  7e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148564  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3561  sodium/hydrogen exchanger  32.92 
 
 		 420 aa  186  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  29.97 
 
 		 756 aa  184  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2104  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  33.42 
 
 		 444 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.134319  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1004  sodium/hydrogen exchanger  33.42 
 
 		 444 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0864919  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2241  sodium/hydrogen exchanger  33.42 
 
 		 444 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310432  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2049  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  33.42 
 
 		 444 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  31.9 
 
 		 482 aa  180  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  32.28 
 
 		 767 aa  178  2e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2332  sodium/hydrogen exchanger  32.9 
 
 		 444 aa  177  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  29.93 
 
 		 764 aa  172  6.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1107  sodium/hydrogen exchanger  30.23 
 
 		 775 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112633  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0928  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.16 
 
 		 430 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0736  sodium/hydrogen exchanger  30.6 
 
 		 495 aa  166  5e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2552  sodium/hydrogen exchanger  30.79 
 
 		 747 aa  161  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.803467  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1281  sodium/hydrogen exchanger  30.83 
 
 		 460 aa  158  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345739  normal  0.428465 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04834  transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family  28.67 
 
 		 421 aa  157  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0791  Na+/H+ antiporter, putative  29.82 
 
 		 448 aa  155  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0935  sodium/hydrogen exchanger  29.82 
 
 		 448 aa  155  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3828  sodium/hydrogen exchanger  28.78 
 
 		 715 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0546  Na+/H+ antiporter  32.65 
 
 		 715 aa  151  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3878  sodium/hydrogen exchanger  29.03 
 
 		 715 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.267583  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1632  Sodium/hydrogen exchanger  29.52 
 
 		 723 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.531828 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2757  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.82 
 
 		 442 aa  150  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.224799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3558  sodium/hydrogen exchanger  28.78 
 
 		 455 aa  149  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1474  sodium/hydrogen exchanger  33.85 
 
 		 703 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00326365  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3445  sodium/hydrogen exchanger  33.75 
 
 		 427 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243488 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1396  sodium/hydrogen exchanger  31.28 
 
 		 689 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0052164  normal  0.118619 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2302  sodium/hydrogen exchanger  29.8 
 
 		 423 aa  145  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4342  sodium/hydrogen exchanger  32.41 
 
 		 416 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.322852  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43795  K(+)/H(+) antiporter  30.67 
 
 		 816 aa  144  3e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00004515  normal  0.344688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4109  sodium/hydrogen exchanger  30.62 
 
 		 425 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.478962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  29.3 
 
 		 460 aa  139  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5898  Kef-type K+ transport systems membrane components-like protein  34.35 
 
 		 683 aa  136  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103243  normal  0.0297868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4159  sodium/hydrogen exchanger  29.72 
 
 		 446 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2667  sodium/hydrogen exchanger  29.29 
 
 		 435 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1098  sodium/hydrogen exchanger  30.38 
 
 		 419 aa  131  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000276702  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  30.41 
 
 		 750 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6352  sodium/hydrogen exchanger  29 
 
 		 436 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105497 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  26.12 
 
 		 749 aa  125  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01670  potassium:hydrogen antiporter, putative  27.39 
 
 		 951 aa  123  5e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  24.82 
 
 		 748 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  26.33 
 
 		 414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4036  sodium/hydrogen exchanger  27.84 
 
 		 422 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554914  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3440  sodium/hydrogen exchanger  30.61 
 
 		 573 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01290  potassium ion/proton antiporter (Eurofung)  27.01 
 
 		 883 aa  111  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.721044  normal  0.960342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3175  sodium/hydrogen exchanger  32.24 
 
 		 416 aa  107  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  24.23 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3562  sodium/hydrogen exchanger  27.72 
 
 		 429 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  24.23 
 
 		 375 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  24.23 
 
 		 375 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2132  sodium/hydrogen exchanger  29.06 
 
 		 425 aa  105  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  24.23 
 
 		 375 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  24.23 
 
 		 375 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  27.93 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  24.23 
 
 		 375 aa  104  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  23.97 
 
 		 375 aa  102  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.23 
 
 		 418 aa  102  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  24.48 
 
 		 375 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  28.64 
 
 		 385 aa  99  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2714  sodium/hydrogen exchanger  27.46 
 
 		 439 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  25.19 
 
 		 385 aa  98.2  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  26.52 
 
 		 445 aa  96.7  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  24.23 
 
 		 375 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  24.23 
 
 		 375 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  28.39 
 
 		 412 aa  95.9  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  24.23 
 
 		 375 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  24.37 
 
 		 387 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1208  sodium/hydrogen exchanger  27.95 
 
 		 410 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0581239  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  24.18 
 
 		 387 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1412  sodium/hydrogen exchanger  25.87 
 
 		 424 aa  94.7  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0173  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  27.95 
 
 		 410 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.661692  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1126  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  27.95 
 
 		 410 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.251778  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  24.62 
 
 		 387 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  24.62 
 
 		 387 aa  94  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  24.62 
 
 		 387 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  24.62 
 
 		 387 aa  93.6  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3230  sodium/hydrogen exchanger  27.15 
 
 		 401 aa  93.6  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  24.37 
 
 		 387 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1391  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.22 
 
 		 547 aa  93.2  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2617  sodium/hydrogen exchanger  28.22 
 
 		 592 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.129932  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  26.05 
 
 		 389 aa  92  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  24.37 
 
 		 387 aa  91.3  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0450  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.22 
 
 		 625 aa  91.3  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.26198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  23.62 
 
 		 387 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  23.62 
 
 		 387 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1476  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  27.95 
 
 		 547 aa  90.9  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0269203  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  25.12 
 
 		 382 aa  89.7  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4191  Sodium/hydrogen exchanger  24.93 
 
 		 399 aa  90.1  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3950  sodium/hydrogen exchanger  25.55 
 
 		 414 aa  88.2  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.387419 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0606  sodium/hydrogen exchanger  26.29 
 
 		 414 aa  87  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  26.05 
 
 		 399 aa  86.7  7e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>