More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2714 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2714  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 439 aa  831    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3562  sodium/hydrogen exchanger  45.97 
 
 		 429 aa  289  7e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1474  sodium/hydrogen exchanger  39.79 
 
 		 703 aa  233  5e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00326365  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3828  sodium/hydrogen exchanger  38.54 
 
 		 715 aa  229  7e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3878  sodium/hydrogen exchanger  38.54 
 
 		 715 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.267583  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  34.23 
 
 		 756 aa  222  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1396  sodium/hydrogen exchanger  40.85 
 
 		 689 aa  218  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0052164  normal  0.118619 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  35.88 
 
 		 482 aa  217  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2552  sodium/hydrogen exchanger  37.56 
 
 		 747 aa  213  4.9999999999999996e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.803467  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  35.44 
 
 		 767 aa  211  1e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4342  sodium/hydrogen exchanger  41.21 
 
 		 416 aa  211  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.322852  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1281  sodium/hydrogen exchanger  39.73 
 
 		 460 aa  206  9e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345739  normal  0.428465 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0546  Na+/H+ antiporter  37.91 
 
 		 715 aa  204  3e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  33 
 
 		 764 aa  202  8e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1107  sodium/hydrogen exchanger  34.27 
 
 		 775 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112633  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0736  sodium/hydrogen exchanger  34.13 
 
 		 495 aa  201  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1632  Sodium/hydrogen exchanger  38.16 
 
 		 723 aa  196  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.531828 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5898  Kef-type K+ transport systems membrane components-like protein  38.96 
 
 		 683 aa  193  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103243  normal  0.0297868 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1098  sodium/hydrogen exchanger  38.19 
 
 		 419 aa  190  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000276702  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3445  sodium/hydrogen exchanger  37.16 
 
 		 427 aa  189  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243488 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3561  sodium/hydrogen exchanger  37.03 
 
 		 420 aa  187  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3175  sodium/hydrogen exchanger  41.47 
 
 		 416 aa  186  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01670  potassium:hydrogen antiporter, putative  33.42 
 
 		 951 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43795  K(+)/H(+) antiporter  34.31 
 
 		 816 aa  181  2e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00004515  normal  0.344688 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01290  potassium ion/proton antiporter (Eurofung)  33.78 
 
 		 883 aa  176  5e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.721044  normal  0.960342 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0791  Na+/H+ antiporter, putative  31.52 
 
 		 448 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0935  sodium/hydrogen exchanger  31.52 
 
 		 448 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3558  sodium/hydrogen exchanger  33.16 
 
 		 455 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04834  transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family  33.08 
 
 		 421 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4109  sodium/hydrogen exchanger  38.07 
 
 		 425 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.478962 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2757  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.67 
 
 		 442 aa  170  4e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.224799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4036  sodium/hydrogen exchanger  38.22 
 
 		 422 aa  169  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554914  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0928  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.9 
 
 		 430 aa  162  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1229  sodium/hydrogen exchanger  34.72 
 
 		 410 aa  153  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.440766  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3484  sodium/hydrogen exchanger  32.22 
 
 		 406 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.861174  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4038  sodium/hydrogen exchanger  31.98 
 
 		 406 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2104  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.05 
 
 		 444 aa  146  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.134319  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2049  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.05 
 
 		 444 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2241  sodium/hydrogen exchanger  32.68 
 
 		 444 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310432  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2332  sodium/hydrogen exchanger  32.29 
 
 		 444 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1004  sodium/hydrogen exchanger  32.68 
 
 		 444 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0864919  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5813  sodium/hydrogen exchanger  34.91 
 
 		 414 aa  143  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6043  sodium/hydrogen exchanger  33.5 
 
 		 414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1572  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.65 
 
 		 410 aa  141  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1654  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.73 
 
 		 410 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148564  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0143  sodium/hydrogen exchanger  32.65 
 
 		 410 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2302  sodium/hydrogen exchanger  31.02 
 
 		 423 aa  137  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113166  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0995  sodium/hydrogen exchanger  34.16 
 
 		 452 aa  130  6e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  28.83 
 
 		 750 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6352  sodium/hydrogen exchanger  33.25 
 
 		 436 aa  127  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105497 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1476  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.6 
 
 		 547 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0269203  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4159  sodium/hydrogen exchanger  33.17 
 
 		 446 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0450  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.68 
 
 		 625 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.26198  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1391  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.6 
 
 		 547 aa  120  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2617  sodium/hydrogen exchanger  30.68 
 
 		 592 aa  120  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.129932  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3440  sodium/hydrogen exchanger  32.51 
 
 		 573 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3203  sodium/hydrogen exchanger  30.36 
 
 		 404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  30.75 
 
 		 460 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1208  sodium/hydrogen exchanger  30.6 
 
 		 410 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0581239  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1126  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.6 
 
 		 410 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.251778  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0173  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.6 
 
 		 410 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.661692  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  31.23 
 
 		 749 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2667  sodium/hydrogen exchanger  32.3 
 
 		 435 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1412  sodium/hydrogen exchanger  29.84 
 
 		 424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2132  sodium/hydrogen exchanger  35.92 
 
 		 425 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  30.85 
 
 		 748 aa  111  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3230  sodium/hydrogen exchanger  31.1 
 
 		 401 aa  107  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  27.25 
 
 		 414 aa  106  9e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0913  sodium/hydrogen exchanger  27.14 
 
 		 413 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4191  Sodium/hydrogen exchanger  30.63 
 
 		 399 aa  103  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 		 399 aa  98.6  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2667  sodium/hydrogen exchanger  31.36 
 
 		 767 aa  93.6  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  24.15 
 
 		 387 aa  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  24.15 
 
 		 387 aa  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  26.89 
 
 		 445 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  24.03 
 
 		 387 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  24.03 
 
 		 387 aa  87.4  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  24.5 
 
 		 385 aa  87.4  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  23.96 
 
 		 387 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  24.76 
 
 		 387 aa  87.4  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  24.51 
 
 		 387 aa  87  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  24.03 
 
 		 387 aa  87  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  24.51 
 
 		 387 aa  87  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  24.03 
 
 		 387 aa  87  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  27.45 
 
 		 412 aa  86.7  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3668  Sodium/hydrogen exchanger  30.86 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  27.54 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  26.1 
 
 		 412 aa  83.2  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2295  sodium/hydrogen exchanger  26.88 
 
 		 386 aa  82.8  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.784703 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  22.9 
 
 		 396 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0706  sodium/hydrogen exchanger  26.54 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.584868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  28.46 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3809  sodium/hydrogen exchanger  31.82 
 
 		 413 aa  81.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.397158  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  26.65 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  25.95 
 
 		 389 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  27.25 
 
 		 424 aa  80.5  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  23.13 
 
 		 375 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  23.13 
 
 		 375 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  30.05 
 
 		 400 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  23.13 
 
 		 375 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>