More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4159 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4159  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 446 aa  849    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  62.56 
 
 		 460 aa  472  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2667  sodium/hydrogen exchanger  61.63 
 
 		 435 aa  454  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0995  sodium/hydrogen exchanger  59.95 
 
 		 452 aa  431  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3440  sodium/hydrogen exchanger  59.73 
 
 		 573 aa  414  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6352  sodium/hydrogen exchanger  52.44 
 
 		 436 aa  376  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105497 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  45.02 
 
 		 750 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  40.33 
 
 		 748 aa  259  8e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  39.25 
 
 		 749 aa  244  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  30.02 
 
 		 756 aa  204  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0546  Na+/H+ antiporter  34.67 
 
 		 715 aa  192  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04834  transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family  33.01 
 
 		 421 aa  186  5e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3878  sodium/hydrogen exchanger  30.38 
 
 		 715 aa  186  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.267583  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3828  sodium/hydrogen exchanger  30.38 
 
 		 715 aa  186  8e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  31.02 
 
 		 764 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1098  sodium/hydrogen exchanger  33.65 
 
 		 419 aa  184  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000276702  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0736  sodium/hydrogen exchanger  31.53 
 
 		 495 aa  181  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0791  Na+/H+ antiporter, putative  29.56 
 
 		 448 aa  181  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0935  sodium/hydrogen exchanger  29.56 
 
 		 448 aa  181  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  29.31 
 
 		 482 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  28.18 
 
 		 767 aa  180  4e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2552  sodium/hydrogen exchanger  30.93 
 
 		 747 aa  176  5e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.803467  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1474  sodium/hydrogen exchanger  34.38 
 
 		 703 aa  176  5e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00326365  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1107  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 		 775 aa  176  6e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112633  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1632  Sodium/hydrogen exchanger  32.51 
 
 		 723 aa  173  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.531828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4109  sodium/hydrogen exchanger  36.54 
 
 		 425 aa  173  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.478962 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0928  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.66 
 
 		 430 aa  169  6e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3558  sodium/hydrogen exchanger  29.9 
 
 		 455 aa  169  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1396  sodium/hydrogen exchanger  35.75 
 
 		 689 aa  169  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0052164  normal  0.118619 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1572  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  33.5 
 
 		 410 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0143  sodium/hydrogen exchanger  33.5 
 
 		 410 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1229  sodium/hydrogen exchanger  32.13 
 
 		 410 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.440766  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1654  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  33.5 
 
 		 410 aa  166  9e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148564  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1281  sodium/hydrogen exchanger  32.3 
 
 		 460 aa  162  9e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345739  normal  0.428465 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2302  sodium/hydrogen exchanger  28.78 
 
 		 423 aa  161  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113166  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6043  sodium/hydrogen exchanger  30.83 
 
 		 414 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5813  sodium/hydrogen exchanger  30.1 
 
 		 414 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4342  sodium/hydrogen exchanger  35.58 
 
 		 416 aa  158  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.322852  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2757  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.66 
 
 		 442 aa  157  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.224799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3561  sodium/hydrogen exchanger  31.37 
 
 		 420 aa  156  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3562  sodium/hydrogen exchanger  34.09 
 
 		 429 aa  153  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43795  K(+)/H(+) antiporter  26.51 
 
 		 816 aa  150  3e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00004515  normal  0.344688 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01290  potassium ion/proton antiporter (Eurofung)  31.4 
 
 		 883 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.721044  normal  0.960342 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4038  sodium/hydrogen exchanger  29.78 
 
 		 406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5898  Kef-type K+ transport systems membrane components-like protein  33.5 
 
 		 683 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103243  normal  0.0297868 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3484  sodium/hydrogen exchanger  29.54 
 
 		 406 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.861174  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01670  potassium:hydrogen antiporter, putative  25.39 
 
 		 951 aa  145  1e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  28.33 
 
 		 389 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  28.81 
 
 		 414 aa  145  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4036  sodium/hydrogen exchanger  35.46 
 
 		 422 aa  144  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554914  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2332  sodium/hydrogen exchanger  31.12 
 
 		 444 aa  143  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0163  sodium/hydrogen exchanger  32.16 
 
 		 435 aa  141  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0515868 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.39 
 
 		 399 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3445  sodium/hydrogen exchanger  31.24 
 
 		 427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243488 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  31.96 
 
 		 385 aa  137  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2104  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  31.54 
 
 		 444 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.134319  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2241  sodium/hydrogen exchanger  31.54 
 
 		 444 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310432  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2049  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  31.54 
 
 		 444 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.53 
 
 		 427 aa  136  8e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1004  sodium/hydrogen exchanger  31.54 
 
 		 444 aa  136  8e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0864919  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  26.76 
 
 		 424 aa  136  9e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0913  sodium/hydrogen exchanger  30.36 
 
 		 413 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  26.7 
 
 		 424 aa  133  6e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  28.43 
 
 		 412 aa  133  7.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  28.12 
 
 		 382 aa  132  9e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  27.98 
 
 		 445 aa  132  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  26.15 
 
 		 396 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  30.58 
 
 		 400 aa  127  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  24.94 
 
 		 375 aa  127  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  25.3 
 
 		 375 aa  126  7e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  25.19 
 
 		 375 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  25.19 
 
 		 375 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  25.19 
 
 		 375 aa  125  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  25.19 
 
 		 375 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  25.19 
 
 		 375 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  24.69 
 
 		 375 aa  124  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1476  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  29.81 
 
 		 547 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0269203  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1126  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.48 
 
 		 410 aa  123  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.251778  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1208  sodium/hydrogen exchanger  30.48 
 
 		 410 aa  123  7e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0581239  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0173  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.48 
 
 		 410 aa  123  7e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.661692  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1391  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  29.81 
 
 		 547 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2617  sodium/hydrogen exchanger  29.81 
 
 		 592 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.129932  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  24.11 
 
 		 385 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0450  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  29.81 
 
 		 625 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.26198  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  27.56 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  26.08 
 
 		 386 aa  122  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.3 
 
 		 418 aa  119  9.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1868  sodium/hydrogen exchanger  29.4 
 
 		 469 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  25.18 
 
 		 387 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1631  sodium/hydrogen exchanger  29.4 
 
 		 474 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.599529 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  24.64 
 
 		 387 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  25.18 
 
 		 387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  28.27 
 
 		 397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  25.18 
 
 		 387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  25.18 
 
 		 387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  25.18 
 
 		 387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0433  sodium/hydrogen exchanger  27.36 
 
 		 387 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  24.94 
 
 		 387 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  25.19 
 
 		 375 aa  116  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  25.19 
 
 		 375 aa  116  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>