More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3520 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1107  sodium/hydrogen exchanger  59.07 
 
 		 775 aa  907    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112633  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  68.3 
 
 		 756 aa  1101    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  100 
 
 		 764 aa  1538    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  37.56 
 
 		 767 aa  504  1e-141  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  55.72 
 
 		 482 aa  495  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3878  sodium/hydrogen exchanger  36.17 
 
 		 715 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.267583  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3828  sodium/hydrogen exchanger  36.31 
 
 		 715 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1632  Sodium/hydrogen exchanger  42.24 
 
 		 723 aa  393  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.531828 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2552  sodium/hydrogen exchanger  40.39 
 
 		 747 aa  389  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.803467  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0546  Na+/H+ antiporter  40.44 
 
 		 715 aa  374  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0736  sodium/hydrogen exchanger  45.71 
 
 		 495 aa  341  2.9999999999999998e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1396  sodium/hydrogen exchanger  43.1 
 
 		 689 aa  325  2e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0052164  normal  0.118619 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1281  sodium/hydrogen exchanger  44.33 
 
 		 460 aa  319  1e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345739  normal  0.428465 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2302  sodium/hydrogen exchanger  41.92 
 
 		 423 aa  297  6e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1474  sodium/hydrogen exchanger  46.15 
 
 		 703 aa  294  4e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00326365  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3561  sodium/hydrogen exchanger  39.69 
 
 		 420 aa  288  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04834  transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family  38.88 
 
 		 421 aa  285  2.0000000000000002e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3558  sodium/hydrogen exchanger  37.97 
 
 		 455 aa  280  5e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790544  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01670  potassium:hydrogen antiporter, putative  37.41 
 
 		 951 aa  280  1e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01290  potassium ion/proton antiporter (Eurofung)  29.83 
 
 		 883 aa  274  4.0000000000000004e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.721044  normal  0.960342 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0935  sodium/hydrogen exchanger  39.06 
 
 		 448 aa  270  1e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0791  Na+/H+ antiporter, putative  39.06 
 
 		 448 aa  270  1e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1098  sodium/hydrogen exchanger  38.39 
 
 		 419 aa  259  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000276702  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3562  sodium/hydrogen exchanger  40.58 
 
 		 429 aa  256  8e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4342  sodium/hydrogen exchanger  38.71 
 
 		 416 aa  253  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.322852  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5898  Kef-type K+ transport systems membrane components-like protein  34.6 
 
 		 683 aa  251  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103243  normal  0.0297868 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43795  K(+)/H(+) antiporter  34.39 
 
 		 816 aa  248  4e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00004515  normal  0.344688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4109  sodium/hydrogen exchanger  36.8 
 
 		 425 aa  247  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.478962 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0928  sodium/hydrogen exchanger family protein  39.64 
 
 		 430 aa  244  6e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4036  sodium/hydrogen exchanger  36.59 
 
 		 422 aa  240  9e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554914  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2757  sodium/hydrogen exchanger family protein  39.53 
 
 		 442 aa  233  7.000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.224799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3445  sodium/hydrogen exchanger  34.16 
 
 		 427 aa  229  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243488 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3175  sodium/hydrogen exchanger  39.04 
 
 		 416 aa  208  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5813  sodium/hydrogen exchanger  33.66 
 
 		 414 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6352  sodium/hydrogen exchanger  29.45 
 
 		 436 aa  197  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105497 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  28.9 
 
 		 748 aa  197  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  27.3 
 
 		 750 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  26.64 
 
 		 749 aa  196  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6043  sodium/hydrogen exchanger  32.26 
 
 		 414 aa  190  9e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1229  sodium/hydrogen exchanger  32.08 
 
 		 410 aa  189  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.440766  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2132  sodium/hydrogen exchanger  36.83 
 
 		 425 aa  188  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2667  sodium/hydrogen exchanger  31.46 
 
 		 435 aa  187  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2714  sodium/hydrogen exchanger  34.57 
 
 		 439 aa  187  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  29.2 
 
 		 460 aa  186  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4159  sodium/hydrogen exchanger  30.45 
 
 		 446 aa  178  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0995  sodium/hydrogen exchanger  32.75 
 
 		 452 aa  175  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1572  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.73 
 
 		 410 aa  174  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0143  sodium/hydrogen exchanger  31.69 
 
 		 410 aa  172  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1654  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  31.69 
 
 		 410 aa  172  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148564  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1476  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  33.88 
 
 		 547 aa  171  6e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0269203  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0450  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  33.7 
 
 		 625 aa  170  7e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.26198  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2617  sodium/hydrogen exchanger  33.98 
 
 		 592 aa  170  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.129932  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1391  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  33.98 
 
 		 547 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4038  sodium/hydrogen exchanger  30.53 
 
 		 406 aa  169  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3484  sodium/hydrogen exchanger  30.2 
 
 		 406 aa  168  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.861174  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0173  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  33.7 
 
 		 410 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.661692  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1208  sodium/hydrogen exchanger  33.7 
 
 		 410 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0581239  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1126  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  33.7 
 
 		 410 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.251778  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2104  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.27 
 
 		 444 aa  163  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.134319  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2049  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.27 
 
 		 444 aa  163  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1004  sodium/hydrogen exchanger  30.27 
 
 		 444 aa  162  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0864919  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0913  sodium/hydrogen exchanger  29.31 
 
 		 413 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2241  sodium/hydrogen exchanger  30.27 
 
 		 444 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310432  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2332  sodium/hydrogen exchanger  32.13 
 
 		 444 aa  155  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3440  sodium/hydrogen exchanger  30.13 
 
 		 573 aa  155  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  29.93 
 
 		 389 aa  153  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3203  sodium/hydrogen exchanger  26.87 
 
 		 404 aa  151  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1412  sodium/hydrogen exchanger  28.02 
 
 		 424 aa  150  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  29.34 
 
 		 382 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  29.7 
 
 		 375 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  28.61 
 
 		 445 aa  142  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  28.46 
 
 		 412 aa  143  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  30.62 
 
 		 414 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  29.19 
 
 		 375 aa  141  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  29.19 
 
 		 375 aa  141  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  29.19 
 
 		 375 aa  141  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  29.19 
 
 		 375 aa  141  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  29.19 
 
 		 375 aa  141  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  29.21 
 
 		 375 aa  140  7e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  29.19 
 
 		 375 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  29.31 
 
 		 387 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  29.31 
 
 		 387 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  29.31 
 
 		 387 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  29.31 
 
 		 387 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  28.75 
 
 		 385 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4587  Sodium/hydrogen exchanger  23.38 
 
 		 712 aa  135  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4191  Sodium/hydrogen exchanger  27.93 
 
 		 399 aa  135  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  29.05 
 
 		 387 aa  135  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  29.74 
 
 		 387 aa  134  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  29.6 
 
 		 387 aa  134  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  28.9 
 
 		 387 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  26.21 
 
 		 400 aa  133  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3230  sodium/hydrogen exchanger  27.76 
 
 		 401 aa  132  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  26.84 
 
 		 424 aa  131  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  28.79 
 
 		 387 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  28.79 
 
 		 387 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  28.5 
 
 		 396 aa  130  8.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0163  sodium/hydrogen exchanger  26.05 
 
 		 435 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0515868 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  29.19 
 
 		 375 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  29.19 
 
 		 375 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>