155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1412 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1412  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 424 aa  847    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4191  Sodium/hydrogen exchanger  76.63 
 
 		 399 aa  622  1e-177  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3203  sodium/hydrogen exchanger  66.75 
 
 		 404 aa  526  1e-148  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3230  sodium/hydrogen exchanger  65.31 
 
 		 401 aa  526  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  26.67 
 
 		 756 aa  143  7e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1476  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  29.1 
 
 		 547 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0269203  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1391  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  29.1 
 
 		 547 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2617  sodium/hydrogen exchanger  29.1 
 
 		 592 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.129932  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  28.02 
 
 		 764 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  29.06 
 
 		 482 aa  136  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0450  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  29.1 
 
 		 625 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.26198  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1208  sodium/hydrogen exchanger  29.17 
 
 		 410 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0581239  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0173  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  29.17 
 
 		 410 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.661692  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1126  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  29.17 
 
 		 410 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.251778  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0736  sodium/hydrogen exchanger  28.61 
 
 		 495 aa  134  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1107  sodium/hydrogen exchanger  28 
 
 		 775 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112633  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0546  Na+/H+ antiporter  28.53 
 
 		 715 aa  132  9e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2552  sodium/hydrogen exchanger  26.4 
 
 		 747 aa  127  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.803467  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3828  sodium/hydrogen exchanger  26.54 
 
 		 715 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3878  sodium/hydrogen exchanger  26.27 
 
 		 715 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.267583  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1632  Sodium/hydrogen exchanger  27.85 
 
 		 723 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.531828 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1474  sodium/hydrogen exchanger  27.39 
 
 		 703 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00326365  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2302  sodium/hydrogen exchanger  27.6 
 
 		 423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113166  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1281  sodium/hydrogen exchanger  27.73 
 
 		 460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345739  normal  0.428465 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04834  transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family  26.02 
 
 		 421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3562  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 		 429 aa  113  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  22.64 
 
 		 767 aa  112  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0935  sodium/hydrogen exchanger  26.82 
 
 		 448 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0791  Na+/H+ antiporter, putative  26.82 
 
 		 448 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01670  potassium:hydrogen antiporter, putative  26.74 
 
 		 951 aa  111  3e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3561  sodium/hydrogen exchanger  27.15 
 
 		 420 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1396  sodium/hydrogen exchanger  28.09 
 
 		 689 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0052164  normal  0.118619 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3558  sodium/hydrogen exchanger  23.92 
 
 		 455 aa  106  9e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790544  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0928  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.13 
 
 		 430 aa  105  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1098  sodium/hydrogen exchanger  24.74 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000276702  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2757  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.5 
 
 		 442 aa  102  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.224799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6352  sodium/hydrogen exchanger  25.87 
 
 		 436 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105497 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1122  sodium/hydrogen exchanger  29.03 
 
 		 402 aa  100  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.555721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3445  sodium/hydrogen exchanger  27.73 
 
 		 427 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243488 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4342  sodium/hydrogen exchanger  27.58 
 
 		 416 aa  98.2  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.322852  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43795  K(+)/H(+) antiporter  24.75 
 
 		 816 aa  97.4  5e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00004515  normal  0.344688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  23.74 
 
 		 460 aa  97.1  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4109  sodium/hydrogen exchanger  25.87 
 
 		 425 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.478962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5898  Kef-type K+ transport systems membrane components-like protein  28.49 
 
 		 683 aa  93.6  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103243  normal  0.0297868 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2667  sodium/hydrogen exchanger  25.65 
 
 		 435 aa  92.8  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2714  sodium/hydrogen exchanger  29.57 
 
 		 439 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4159  sodium/hydrogen exchanger  24.48 
 
 		 446 aa  91.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0143  sodium/hydrogen exchanger  24.17 
 
 		 410 aa  89.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1572  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  24.17 
 
 		 410 aa  89.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1229  sodium/hydrogen exchanger  23.92 
 
 		 410 aa  89  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.440766  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1654  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  23.92 
 
 		 410 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148564  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0913  sodium/hydrogen exchanger  25.33 
 
 		 413 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0995  sodium/hydrogen exchanger  25.78 
 
 		 452 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6043  sodium/hydrogen exchanger  25.4 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5813  sodium/hydrogen exchanger  25.4 
 
 		 414 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  24.88 
 
 		 414 aa  83.2  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4036  sodium/hydrogen exchanger  24.86 
 
 		 422 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554914  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3484  sodium/hydrogen exchanger  24.56 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.861174  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3440  sodium/hydrogen exchanger  24.24 
 
 		 573 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4038  sodium/hydrogen exchanger  24.48 
 
 		 406 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  25.25 
 
 		 749 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01290  potassium ion/proton antiporter (Eurofung)  26.49 
 
 		 883 aa  77  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.721044  normal  0.960342 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  26.51 
 
 		 399 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0163  sodium/hydrogen exchanger  24.73 
 
 		 435 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0515868 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.62 
 
 		 418 aa  71.6  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  23.3 
 
 		 387 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  23.84 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  23.84 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  23.84 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  23.84 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  23.56 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  23.56 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  24.67 
 
 		 445 aa  70.1  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  23.56 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  22.65 
 
 		 750 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  23.56 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2332  sodium/hydrogen exchanger  25.42 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  23.56 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  23.93 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2667  sodium/hydrogen exchanger  31.95 
 
 		 767 aa  66.6  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  24.35 
 
 		 386 aa  65.1  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  24.11 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  23.22 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3175  sodium/hydrogen exchanger  25.4 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  24.86 
 
 		 385 aa  63.5  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  21.53 
 
 		 748 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2104  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  25 
 
 		 444 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.134319  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  24.68 
 
 		 388 aa  63.5  0.000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2241  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 		 444 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310432  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2049  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  25 
 
 		 444 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1004  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 		 444 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0864919  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0606  sodium/hydrogen exchanger  23.59 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  22.81 
 
 		 382 aa  59.7  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0960  Sodium/hydrogen exchanger  23.7 
 
 		 425 aa  57.8  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848142  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  24.61 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  22.83 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  23.26 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  23.18 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3950  sodium/hydrogen exchanger  22.75 
 
 		 414 aa  57  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.387419 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>