More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4587 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4587  Sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
712 aa  1418    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2626  sodium/hydrogen exchanger  61.27 
 
 
722 aa  885    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1707  sodium/hydrogen exchanger  50.86 
 
 
698 aa  692    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4722  sodium/hydrogen exchanger  49.21 
 
 
692 aa  644    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1732  sodium/hydrogen exchanger  51.43 
 
 
698 aa  702    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1401  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  35.36 
 
 
699 aa  372  1e-101  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.972731  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1642  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  35.75 
 
 
699 aa  370  1e-101  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1869  sodium/hydrogen exchanger  35.18 
 
 
689 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4481  sodium/hydrogen exchanger  35.54 
 
 
679 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3545  Sodium/hydrogen exchanger  33.44 
 
 
681 aa  301  4e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6580  sodium/hydrogen exchanger  31.47 
 
 
719 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.070036  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0979  sodium/hydrogen exchanger  33.27 
 
 
688 aa  281  3e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4708  sodium/hydrogen exchanger  29.76 
 
 
715 aa  276  9e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1862  sodium/hydrogen exchanger  31.33 
 
 
751 aa  274  3e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0307  Na+/H+ antiporter  44.84 
 
 
408 aa  270  1e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3051  sodium/hydrogen exchanger  34.1 
 
 
686 aa  259  8e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0038  sodium/hydrogen exchanger  33.28 
 
 
692 aa  259  8e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1103  sodium/hydrogen exchanger  30.58 
 
 
716 aa  257  5e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.554768  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1978  sodium/hydrogen exchanger  29.91 
 
 
709 aa  253  1e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1681  sodium/hydrogen exchanger  28.77 
 
 
732 aa  249  2e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1205  Na+/H+ anti-porter  30.05 
 
 
716 aa  239  1e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1258  sodium/hydrogen exchanger  29.65 
 
 
721 aa  238  3e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105109  normal  0.138872 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1475  putative Na+/H+ antiporter  28.77 
 
 
727 aa  228  2e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2201  sodium/hydrogen exchanger  28.47 
 
 
708 aa  223  7e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260378  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3830  sodium/hydrogen exchanger  26.02 
 
 
706 aa  214  3.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.417332  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  25.11 
 
 
756 aa  142  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3828  sodium/hydrogen exchanger  25.8 
 
 
715 aa  127  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3878  sodium/hydrogen exchanger  25.8 
 
 
715 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.267583  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2552  sodium/hydrogen exchanger  24.49 
 
 
747 aa  124  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.803467  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0546  Na+/H+ antiporter  27.34 
 
 
715 aa  122  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  23.38 
 
 
764 aa  117  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1632  Sodium/hydrogen exchanger  24.37 
 
 
723 aa  114  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.531828 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0743  sodium/hydrogen exchanger  25.61 
 
 
395 aa  110  6e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.286808  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  27.37 
 
 
387 aa  107  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  27.37 
 
 
387 aa  107  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  27.09 
 
 
387 aa  107  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  27.37 
 
 
387 aa  107  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  27.37 
 
 
387 aa  107  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  27.09 
 
 
387 aa  107  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  24.93 
 
 
375 aa  106  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  27.09 
 
 
387 aa  107  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  27.09 
 
 
387 aa  107  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  27.09 
 
 
387 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1020  sodium/hydrogen exchanger  29.03 
 
 
389 aa  106  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.259417  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  26.82 
 
 
385 aa  106  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0306  sodium/hydrogen exchanger  29.07 
 
 
389 aa  105  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  26.82 
 
 
387 aa  104  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  26.12 
 
 
375 aa  104  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  25.14 
 
 
386 aa  103  9e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1608  sodium/hydrogen exchanger  29.17 
 
 
387 aa  103  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0247605  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  26.59 
 
 
352 aa  101  4e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  26.12 
 
 
375 aa  100  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1107  sodium/hydrogen exchanger  22.97 
 
 
775 aa  99.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112633  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  25.07 
 
 
379 aa  99.8  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  26.26 
 
 
375 aa  98.6  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  26.26 
 
 
375 aa  98.6  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  26.26 
 
 
375 aa  98.6  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  26.26 
 
 
375 aa  98.6  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  26.26 
 
 
375 aa  98.6  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  26.26 
 
 
375 aa  98.6  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0867  sodium/hydrogen exchanger  26.09 
 
 
530 aa  98.6  4e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.638156  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  22.98 
 
 
396 aa  95.9  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  25.43 
 
 
399 aa  94.7  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  25.7 
 
 
389 aa  93.2  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  26.03 
 
 
404 aa  91.7  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2594  sodium/hydrogen exchanger  28.41 
 
 
491 aa  90.9  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0590  Na+/H+ exchanger family protein, putative  26.32 
 
 
614 aa  90.9  8e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104046  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3029  Sodium/hydrogen exchanger  25.44 
 
 
453 aa  90.1  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75325  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  26.26 
 
 
375 aa  89.7  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  26.26 
 
 
375 aa  89.7  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  26.26 
 
 
375 aa  89.7  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1868  sodium/hydrogen exchanger  25.59 
 
 
469 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  27.35 
 
 
467 aa  88.2  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  27.35 
 
 
467 aa  87.8  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  26.6 
 
 
767 aa  87  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  24.8 
 
 
399 aa  86.7  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  25.31 
 
 
648 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43795  K(+)/H(+) antiporter  24.43 
 
 
816 aa  86.3  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00004515  normal  0.344688 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  26.51 
 
 
482 aa  85.9  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  26.02 
 
 
395 aa  85.9  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  26.43 
 
 
400 aa  85.1  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  27.92 
 
 
654 aa  85.1  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4724  sodium/hydrogen exchanger  25.81 
 
 
473 aa  85.5  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  23.39 
 
 
389 aa  84.7  0.000000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  27.27 
 
 
423 aa  84.7  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  23.41 
 
 
748 aa  84.3  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  24.88 
 
 
649 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2359  Na+/H+ antiporter  30.86 
 
 
460 aa  83.2  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1799  sodium/hydrogen exchanger  27.7 
 
 
462 aa  82  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  27.11 
 
 
416 aa  82.4  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  26.22 
 
 
663 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2734  UspA domain protein  29.36 
 
 
319 aa  82.4  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.364646  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  27.84 
 
 
649 aa  82  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3562  sodium/hydrogen exchanger  26.99 
 
 
429 aa  82.4  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  27.54 
 
 
745 aa  81.6  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1474  sodium/hydrogen exchanger  24.74 
 
 
703 aa  81.3  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00326365  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01670  potassium:hydrogen antiporter, putative  25 
 
 
951 aa  81.3  0.00000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  23.16 
 
 
665 aa  81.3  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  21.92 
 
 
390 aa  81.3  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  26.22 
 
 
669 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>