220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA1208 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1208  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
410 aa  795    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0581239  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2617  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
592 aa  792    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.129932  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0173  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  100 
 
 
410 aa  795    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.661692  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0450  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  100 
 
 
625 aa  792    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.26198  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1476  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  99.76 
 
 
547 aa  790    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0269203  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1391  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  100 
 
 
547 aa  792    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1126  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  100 
 
 
410 aa  795    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.251778  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  33.58 
 
 
756 aa  184  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  34.81 
 
 
482 aa  182  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3203  sodium/hydrogen exchanger  31.51 
 
 
404 aa  169  9e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3878  sodium/hydrogen exchanger  34.83 
 
 
715 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.267583  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4191  Sodium/hydrogen exchanger  31.3 
 
 
399 aa  169  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  32.69 
 
 
767 aa  168  2e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3828  sodium/hydrogen exchanger  34.56 
 
 
715 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3561  sodium/hydrogen exchanger  35.08 
 
 
420 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  33.96 
 
 
764 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0546  Na+/H+ antiporter  35.34 
 
 
715 aa  164  3e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3230  sodium/hydrogen exchanger  31.65 
 
 
401 aa  164  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1412  sodium/hydrogen exchanger  29.41 
 
 
424 aa  162  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2552  sodium/hydrogen exchanger  33.42 
 
 
747 aa  157  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.803467  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1632  Sodium/hydrogen exchanger  36.2 
 
 
723 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.531828 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0736  sodium/hydrogen exchanger  32.14 
 
 
495 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1107  sodium/hydrogen exchanger  31.32 
 
 
775 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112633  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1281  sodium/hydrogen exchanger  34.38 
 
 
460 aa  146  5e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345739  normal  0.428465 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4342  sodium/hydrogen exchanger  32.6 
 
 
416 aa  142  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.322852  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1474  sodium/hydrogen exchanger  33.85 
 
 
703 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00326365  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3558  sodium/hydrogen exchanger  30.67 
 
 
455 aa  140  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790544  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04834  transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family  31.08 
 
 
421 aa  140  6e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4109  sodium/hydrogen exchanger  31.76 
 
 
425 aa  139  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.478962 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3562  sodium/hydrogen exchanger  32.47 
 
 
429 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4036  sodium/hydrogen exchanger  31.96 
 
 
422 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554914  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2302  sodium/hydrogen exchanger  28.5 
 
 
423 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113166  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01670  potassium:hydrogen antiporter, putative  28.78 
 
 
951 aa  130  3e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2667  sodium/hydrogen exchanger  31.75 
 
 
435 aa  130  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43795  K(+)/H(+) antiporter  31.32 
 
 
816 aa  128  1.0000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00004515  normal  0.344688 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1396  sodium/hydrogen exchanger  35.32 
 
 
689 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0052164  normal  0.118619 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  33.1 
 
 
460 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0928  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.12 
 
 
430 aa  125  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2757  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.22 
 
 
442 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.224799  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5898  Kef-type K+ transport systems membrane components-like protein  32.86 
 
 
683 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103243  normal  0.0297868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4159  sodium/hydrogen exchanger  30.75 
 
 
446 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0791  Na+/H+ antiporter, putative  32.03 
 
 
448 aa  119  7e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0935  sodium/hydrogen exchanger  32.03 
 
 
448 aa  119  7e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5813  sodium/hydrogen exchanger  30.34 
 
 
414 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1229  sodium/hydrogen exchanger  30.18 
 
 
410 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.440766  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6043  sodium/hydrogen exchanger  29.66 
 
 
414 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6352  sodium/hydrogen exchanger  31.97 
 
 
436 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105497 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1572  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.65 
 
 
410 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  31.27 
 
 
750 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0330875 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01290  potassium ion/proton antiporter (Eurofung)  28.88 
 
 
883 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.721044  normal  0.960342 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0143  sodium/hydrogen exchanger  30.39 
 
 
410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2714  sodium/hydrogen exchanger  32 
 
 
439 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3445  sodium/hydrogen exchanger  29.66 
 
 
427 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243488 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1654  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.39 
 
 
410 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148564  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1098  sodium/hydrogen exchanger  27.72 
 
 
419 aa  110  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000276702  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3484  sodium/hydrogen exchanger  29.87 
 
 
406 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.861174  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4038  sodium/hydrogen exchanger  29.35 
 
 
406 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2241  sodium/hydrogen exchanger  28.84 
 
 
444 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310432  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1004  sodium/hydrogen exchanger  28.84 
 
 
444 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0864919  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2049  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.84 
 
 
444 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2104  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.84 
 
 
444 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.134319  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3175  sodium/hydrogen exchanger  33.24 
 
 
416 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0913  sodium/hydrogen exchanger  28.95 
 
 
413 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3440  sodium/hydrogen exchanger  27.78 
 
 
573 aa  99.8  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1122  sodium/hydrogen exchanger  32.86 
 
 
402 aa  98.2  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.555721 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2132  sodium/hydrogen exchanger  31.27 
 
 
425 aa  98.2  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2332  sodium/hydrogen exchanger  28.69 
 
 
444 aa  97.1  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0995  sodium/hydrogen exchanger  32.55 
 
 
452 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  26.48 
 
 
389 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  23.92 
 
 
375 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  24.06 
 
 
375 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  26.84 
 
 
749 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  25.48 
 
 
352 aa  82  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  25.26 
 
 
389 aa  82  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  26.19 
 
 
748 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  22.73 
 
 
375 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3950  sodium/hydrogen exchanger  25.43 
 
 
414 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.387419 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  22.73 
 
 
375 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  22.73 
 
 
375 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  22.73 
 
 
375 aa  79  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  22.73 
 
 
375 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  24.35 
 
 
386 aa  78.6  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  22.73 
 
 
375 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  26.7 
 
 
382 aa  77.4  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  24.33 
 
 
387 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  24.33 
 
 
387 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  24.33 
 
 
387 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  24.33 
 
 
387 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  25.13 
 
 
385 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  24.33 
 
 
387 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  24.33 
 
 
387 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  23.66 
 
 
387 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  25.07 
 
 
445 aa  73.9  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  24.06 
 
 
387 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  24.06 
 
 
387 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  23.66 
 
 
387 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  23.22 
 
 
375 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  23.22 
 
 
375 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  23.22 
 
 
375 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  24 
 
 
414 aa  71.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>