271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2241 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA1004  sodium/hydrogen exchanger  99.77 
 
 
444 aa  853    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0864919  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2241  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
444 aa  853    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310432  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2332  sodium/hydrogen exchanger  88.74 
 
 
444 aa  738    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2104  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  99.77 
 
 
444 aa  853    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.134319  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2049  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  99.55 
 
 
444 aa  852    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1229  sodium/hydrogen exchanger  40.88 
 
 
410 aa  280  5e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.440766  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0143  sodium/hydrogen exchanger  41.36 
 
 
410 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1572  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  41.36 
 
 
410 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1654  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  41.36 
 
 
410 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148564  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6043  sodium/hydrogen exchanger  41.5 
 
 
414 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5813  sodium/hydrogen exchanger  41.26 
 
 
414 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4038  sodium/hydrogen exchanger  36.65 
 
 
406 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3484  sodium/hydrogen exchanger  36.65 
 
 
406 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.861174  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  32.06 
 
 
767 aa  187  3e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  29.31 
 
 
756 aa  182  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0928  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.21 
 
 
430 aa  178  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0791  Na+/H+ antiporter, putative  30.05 
 
 
448 aa  176  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0935  sodium/hydrogen exchanger  30.05 
 
 
448 aa  176  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0913  sodium/hydrogen exchanger  33.42 
 
 
413 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  30.51 
 
 
764 aa  162  8.000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2757  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.02 
 
 
442 aa  158  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.224799  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  28.19 
 
 
482 aa  156  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2552  sodium/hydrogen exchanger  28.79 
 
 
747 aa  154  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.803467  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1632  Sodium/hydrogen exchanger  30.4 
 
 
723 aa  154  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.531828 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01670  potassium:hydrogen antiporter, putative  28 
 
 
951 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3558  sodium/hydrogen exchanger  30.65 
 
 
455 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790544  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3828  sodium/hydrogen exchanger  27.5 
 
 
715 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3878  sodium/hydrogen exchanger  27.5 
 
 
715 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.267583  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1396  sodium/hydrogen exchanger  32.41 
 
 
689 aa  151  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0052164  normal  0.118619 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2302  sodium/hydrogen exchanger  28.61 
 
 
423 aa  150  6e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4109  sodium/hydrogen exchanger  31.49 
 
 
425 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.478962 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0546  Na+/H+ antiporter  31 
 
 
715 aa  145  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1281  sodium/hydrogen exchanger  32.39 
 
 
460 aa  144  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345739  normal  0.428465 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04834  transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family  30.05 
 
 
421 aa  143  8e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1107  sodium/hydrogen exchanger  27.16 
 
 
775 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112633  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5898  Kef-type K+ transport systems membrane components-like protein  33.68 
 
 
683 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103243  normal  0.0297868 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6352  sodium/hydrogen exchanger  32.83 
 
 
436 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105497 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1474  sodium/hydrogen exchanger  29.52 
 
 
703 aa  135  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00326365  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2667  sodium/hydrogen exchanger  33.67 
 
 
435 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  31.77 
 
 
460 aa  134  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1098  sodium/hydrogen exchanger  30.02 
 
 
419 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000276702  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2714  sodium/hydrogen exchanger  32.46 
 
 
439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4159  sodium/hydrogen exchanger  32.05 
 
 
446 aa  131  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3561  sodium/hydrogen exchanger  33.5 
 
 
420 aa  130  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4036  sodium/hydrogen exchanger  29.1 
 
 
422 aa  129  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554914  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  31.78 
 
 
750 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0330875 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01290  potassium ion/proton antiporter (Eurofung)  26.63 
 
 
883 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.721044  normal  0.960342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4342  sodium/hydrogen exchanger  31.38 
 
 
416 aa  127  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.322852  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3445  sodium/hydrogen exchanger  28.47 
 
 
427 aa  126  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243488 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0736  sodium/hydrogen exchanger  26.73 
 
 
495 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43795  K(+)/H(+) antiporter  27.43 
 
 
816 aa  125  2e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00004515  normal  0.344688 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0995  sodium/hydrogen exchanger  30.73 
 
 
452 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3562  sodium/hydrogen exchanger  30.43 
 
 
429 aa  120  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  28.86 
 
 
748 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3440  sodium/hydrogen exchanger  29.44 
 
 
573 aa  112  9e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  30.3 
 
 
412 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  28.17 
 
 
749 aa  103  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1391  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.95 
 
 
547 aa  103  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1476  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.95 
 
 
547 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0269203  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0450  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.95 
 
 
625 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.26198  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2617  sodium/hydrogen exchanger  28.95 
 
 
592 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.129932  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1208  sodium/hydrogen exchanger  28.95 
 
 
410 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0581239  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1126  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.95 
 
 
410 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.251778  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0173  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.95 
 
 
410 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.661692  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  26.62 
 
 
445 aa  99.8  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.44 
 
 
418 aa  93.2  9e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  26.32 
 
 
385 aa  92.8  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  25 
 
 
386 aa  92.4  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  26.38 
 
 
387 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  26.38 
 
 
387 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  26.63 
 
 
387 aa  90.1  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2132  sodium/hydrogen exchanger  29.9 
 
 
425 aa  88.2  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  26.13 
 
 
387 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  26.12 
 
 
390 aa  87.8  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  25.37 
 
 
414 aa  87.4  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  26.13 
 
 
387 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  26.13 
 
 
387 aa  86.7  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  26.13 
 
 
387 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  26.13 
 
 
387 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  26.13 
 
 
387 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  25.2 
 
 
399 aa  86.3  9e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  26.13 
 
 
387 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  26.88 
 
 
412 aa  85.5  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  24.94 
 
 
399 aa  85.1  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2295  sodium/hydrogen exchanger  28.93 
 
 
386 aa  85.5  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.784703 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  28.54 
 
 
400 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  24.11 
 
 
375 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3175  sodium/hydrogen exchanger  32.89 
 
 
416 aa  83.6  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3809  sodium/hydrogen exchanger  31.88 
 
 
413 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.397158  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0163  sodium/hydrogen exchanger  29.25 
 
 
435 aa  83.2  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0515868 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  24.37 
 
 
375 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  24.37 
 
 
375 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  26.93 
 
 
382 aa  81.6  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  24.06 
 
 
375 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  24.06 
 
 
375 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  24.06 
 
 
375 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  24.06 
 
 
375 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  24.06 
 
 
375 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3950  sodium/hydrogen exchanger  26.7 
 
 
414 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.387419 
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.06 
 
 
427 aa  79.3  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>