247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A1476 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1208  sodium/hydrogen exchanger  99.76 
 
 
410 aa  790    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0581239  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2617  sodium/hydrogen exchanger  99.82 
 
 
592 aa  1078    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.129932  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0173  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  99.76 
 
 
410 aa  790    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.661692  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0450  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  99.63 
 
 
625 aa  1074    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.26198  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1476  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  100 
 
 
547 aa  1081    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0269203  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1391  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  99.82 
 
 
547 aa  1080    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1126  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  99.76 
 
 
410 aa  790    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.251778  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  33.58 
 
 
756 aa  192  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  34.81 
 
 
482 aa  184  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  32.44 
 
 
767 aa  176  9e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3878  sodium/hydrogen exchanger  34.83 
 
 
715 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.267583  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3828  sodium/hydrogen exchanger  34.56 
 
 
715 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0546  Na+/H+ antiporter  35.34 
 
 
715 aa  171  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  34.22 
 
 
764 aa  171  4e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3203  sodium/hydrogen exchanger  31.93 
 
 
404 aa  168  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4191  Sodium/hydrogen exchanger  31.17 
 
 
399 aa  168  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2552  sodium/hydrogen exchanger  33.07 
 
 
747 aa  165  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.803467  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1412  sodium/hydrogen exchanger  29.34 
 
 
424 aa  164  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3230  sodium/hydrogen exchanger  31.89 
 
 
401 aa  163  8.000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3561  sodium/hydrogen exchanger  34.82 
 
 
420 aa  163  9e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1632  Sodium/hydrogen exchanger  34.38 
 
 
723 aa  160  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.531828 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0736  sodium/hydrogen exchanger  32.4 
 
 
495 aa  157  5.0000000000000005e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1107  sodium/hydrogen exchanger  31.32 
 
 
775 aa  154  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112633  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1281  sodium/hydrogen exchanger  34.74 
 
 
460 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345739  normal  0.428465 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1474  sodium/hydrogen exchanger  33.85 
 
 
703 aa  145  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00326365  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01670  potassium:hydrogen antiporter, putative  28.78 
 
 
951 aa  143  7e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4342  sodium/hydrogen exchanger  32.6 
 
 
416 aa  143  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.322852  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3562  sodium/hydrogen exchanger  32.47 
 
 
429 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3558  sodium/hydrogen exchanger  30.77 
 
 
455 aa  140  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790544  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4109  sodium/hydrogen exchanger  31.83 
 
 
425 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.478962 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04834  transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family  31.08 
 
 
421 aa  139  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4036  sodium/hydrogen exchanger  32.27 
 
 
422 aa  137  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554914  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43795  K(+)/H(+) antiporter  30.75 
 
 
816 aa  136  9.999999999999999e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00004515  normal  0.344688 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1396  sodium/hydrogen exchanger  34.62 
 
 
689 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0052164  normal  0.118619 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2302  sodium/hydrogen exchanger  28.84 
 
 
423 aa  134  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2667  sodium/hydrogen exchanger  31.75 
 
 
435 aa  132  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  32.32 
 
 
460 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5898  Kef-type K+ transport systems membrane components-like protein  32.86 
 
 
683 aa  128  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103243  normal  0.0297868 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0928  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.12 
 
 
430 aa  126  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01290  potassium ion/proton antiporter (Eurofung)  28.88 
 
 
883 aa  125  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.721044  normal  0.960342 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2757  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.05 
 
 
442 aa  123  8e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.224799  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4159  sodium/hydrogen exchanger  30.75 
 
 
446 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0935  sodium/hydrogen exchanger  32.03 
 
 
448 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0791  Na+/H+ antiporter, putative  32.03 
 
 
448 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  30.91 
 
 
750 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5813  sodium/hydrogen exchanger  30.34 
 
 
414 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1229  sodium/hydrogen exchanger  30.65 
 
 
410 aa  117  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.440766  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6352  sodium/hydrogen exchanger  30.92 
 
 
436 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2714  sodium/hydrogen exchanger  32 
 
 
439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6043  sodium/hydrogen exchanger  29.47 
 
 
414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3445  sodium/hydrogen exchanger  30.1 
 
 
427 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243488 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1572  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.65 
 
 
410 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0143  sodium/hydrogen exchanger  30.39 
 
 
410 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1654  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.39 
 
 
410 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148564  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1098  sodium/hydrogen exchanger  27.72 
 
 
419 aa  109  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000276702  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3484  sodium/hydrogen exchanger  30.13 
 
 
406 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.861174  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4038  sodium/hydrogen exchanger  29.61 
 
 
406 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2241  sodium/hydrogen exchanger  28.84 
 
 
444 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310432  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1004  sodium/hydrogen exchanger  28.84 
 
 
444 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0864919  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3440  sodium/hydrogen exchanger  26.85 
 
 
573 aa  107  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2104  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.84 
 
 
444 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.134319  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2049  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.84 
 
 
444 aa  107  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3175  sodium/hydrogen exchanger  33.24 
 
 
416 aa  103  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0995  sodium/hydrogen exchanger  32.32 
 
 
452 aa  99.8  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2132  sodium/hydrogen exchanger  32.27 
 
 
425 aa  99  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2332  sodium/hydrogen exchanger  29.21 
 
 
444 aa  98.2  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1122  sodium/hydrogen exchanger  29.4 
 
 
402 aa  97.8  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.555721 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0913  sodium/hydrogen exchanger  28.95 
 
 
413 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  26.95 
 
 
749 aa  90.9  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  25.78 
 
 
748 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  26.48 
 
 
389 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  25.07 
 
 
389 aa  82.4  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  23.66 
 
 
375 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  24.6 
 
 
375 aa  82  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  25.34 
 
 
352 aa  79.3  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3950  sodium/hydrogen exchanger  25.78 
 
 
414 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.387419 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  26.7 
 
 
382 aa  77.8  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  24.35 
 
 
386 aa  77.4  0.0000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  23.67 
 
 
375 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  23.26 
 
 
375 aa  77  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  23.67 
 
 
375 aa  77  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  24.35 
 
 
387 aa  77  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  23.67 
 
 
375 aa  77  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  23.67 
 
 
375 aa  77  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  24.35 
 
 
387 aa  77  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  23.67 
 
 
375 aa  77  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  25.07 
 
 
445 aa  75.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  25.33 
 
 
385 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  24.35 
 
 
387 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  24.35 
 
 
387 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  24.35 
 
 
387 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  24.35 
 
 
387 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  23.66 
 
 
387 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2667  sodium/hydrogen exchanger  27.94 
 
 
767 aa  73.9  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  24.08 
 
 
387 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  24.08 
 
 
387 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  23.68 
 
 
387 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  23.68 
 
 
414 aa  71.6  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  23.64 
 
 
375 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  23.64 
 
 
375 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>