More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1792 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  100 
 
 		 767 aa  1545    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  39.77 
 
 		 756 aa  512  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  37.56 
 
 		 764 aa  488  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1107  sodium/hydrogen exchanger  37.43 
 
 		 775 aa  466  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112633  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  45.75 
 
 		 482 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3878  sodium/hydrogen exchanger  43.16 
 
 		 715 aa  340  4e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.267583  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3828  sodium/hydrogen exchanger  42.92 
 
 		 715 aa  340  8e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2552  sodium/hydrogen exchanger  43.72 
 
 		 747 aa  318  2e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.803467  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1632  Sodium/hydrogen exchanger  43.83 
 
 		 723 aa  312  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.531828 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0546  Na+/H+ antiporter  40.68 
 
 		 715 aa  298  4e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0736  sodium/hydrogen exchanger  37.47 
 
 		 495 aa  279  1e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1281  sodium/hydrogen exchanger  41.42 
 
 		 460 aa  275  3e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345739  normal  0.428465 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1396  sodium/hydrogen exchanger  40.18 
 
 		 689 aa  271  4e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0052164  normal  0.118619 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3561  sodium/hydrogen exchanger  39.15 
 
 		 420 aa  261  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2302  sodium/hydrogen exchanger  37.28 
 
 		 423 aa  250  8e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113166  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3558  sodium/hydrogen exchanger  35.01 
 
 		 455 aa  244  6e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1098  sodium/hydrogen exchanger  39.59 
 
 		 419 aa  239  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000276702  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0791  Na+/H+ antiporter, putative  38.35 
 
 		 448 aa  238  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0935  sodium/hydrogen exchanger  38.35 
 
 		 448 aa  238  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01670  potassium:hydrogen antiporter, putative  31.84 
 
 		 951 aa  237  5.0000000000000005e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04834  transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family  35.52 
 
 		 421 aa  237  7e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01290  potassium ion/proton antiporter (Eurofung)  37.83 
 
 		 883 aa  236  1.0000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.721044  normal  0.960342 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1474  sodium/hydrogen exchanger  38.68 
 
 		 703 aa  235  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00326365  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4109  sodium/hydrogen exchanger  35.58 
 
 		 425 aa  234  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.478962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4036  sodium/hydrogen exchanger  36.1 
 
 		 422 aa  233  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554914  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5898  Kef-type K+ transport systems membrane components-like protein  38.16 
 
 		 683 aa  227  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103243  normal  0.0297868 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0928  sodium/hydrogen exchanger family protein  36.8 
 
 		 430 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4342  sodium/hydrogen exchanger  37.03 
 
 		 416 aa  213  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.322852  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6043  sodium/hydrogen exchanger  34.65 
 
 		 414 aa  211  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43795  K(+)/H(+) antiporter  29.87 
 
 		 816 aa  211  6e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00004515  normal  0.344688 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5813  sodium/hydrogen exchanger  34.65 
 
 		 414 aa  210  9e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3562  sodium/hydrogen exchanger  38.64 
 
 		 429 aa  208  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1229  sodium/hydrogen exchanger  32.5 
 
 		 410 aa  204  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.440766  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2757  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.97 
 
 		 442 aa  192  2.9999999999999997e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.224799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1572  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.65 
 
 		 410 aa  191  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3445  sodium/hydrogen exchanger  32.75 
 
 		 427 aa  190  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243488 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0143  sodium/hydrogen exchanger  30.4 
 
 		 410 aa  188  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1654  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.15 
 
 		 410 aa  188  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148564  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  32.73 
 
 		 750 aa  183  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2132  sodium/hydrogen exchanger  35.26 
 
 		 425 aa  182  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2714  sodium/hydrogen exchanger  33.78 
 
 		 439 aa  177  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3175  sodium/hydrogen exchanger  35.23 
 
 		 416 aa  176  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3484  sodium/hydrogen exchanger  29.95 
 
 		 406 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.861174  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4038  sodium/hydrogen exchanger  29.95 
 
 		 406 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  29.69 
 
 		 460 aa  169  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2049  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.06 
 
 		 444 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1004  sodium/hydrogen exchanger  32.06 
 
 		 444 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0864919  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2241  sodium/hydrogen exchanger  32.06 
 
 		 444 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310432  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2104  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.06 
 
 		 444 aa  169  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.134319  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2667  sodium/hydrogen exchanger  31.22 
 
 		 435 aa  167  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  30.96 
 
 		 749 aa  164  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6352  sodium/hydrogen exchanger  28.89 
 
 		 436 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105497 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2332  sodium/hydrogen exchanger  31.73 
 
 		 444 aa  161  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4159  sodium/hydrogen exchanger  28.29 
 
 		 446 aa  160  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0913  sodium/hydrogen exchanger  32.28 
 
 		 413 aa  160  8e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  26.67 
 
 		 748 aa  158  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0995  sodium/hydrogen exchanger  33.25 
 
 		 452 aa  156  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2617  sodium/hydrogen exchanger  32.7 
 
 		 592 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.129932  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1476  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.7 
 
 		 547 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0269203  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0450  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.7 
 
 		 625 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.26198  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1391  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.7 
 
 		 547 aa  155  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1208  sodium/hydrogen exchanger  32.97 
 
 		 410 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0581239  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0173  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.97 
 
 		 410 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.661692  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1126  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.97 
 
 		 410 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.251778  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3440  sodium/hydrogen exchanger  29.74 
 
 		 573 aa  144  7e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  29.25 
 
 		 389 aa  137  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  26.59 
 
 		 414 aa  134  5e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  27.16 
 
 		 386 aa  126  2e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  27.46 
 
 		 387 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  26.26 
 
 		 387 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  29.09 
 
 		 445 aa  122  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  26.26 
 
 		 387 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  26.26 
 
 		 387 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  26.01 
 
 		 387 aa  121  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  27.11 
 
 		 387 aa  120  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  27.11 
 
 		 387 aa  120  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  27.11 
 
 		 387 aa  120  9e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  27.36 
 
 		 387 aa  120  9e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  25.82 
 
 		 387 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  26.41 
 
 		 382 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2667  sodium/hydrogen exchanger  28.34 
 
 		 767 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  25.57 
 
 		 375 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  25.57 
 
 		 375 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  25.57 
 
 		 375 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  25.57 
 
 		 375 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  25.57 
 
 		 375 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  26.28 
 
 		 385 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  26.96 
 
 		 412 aa  117  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  25.57 
 
 		 375 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  26.52 
 
 		 375 aa  115  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  25.44 
 
 		 375 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  27.16 
 
 		 400 aa  114  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3203  sodium/hydrogen exchanger  24.73 
 
 		 404 aa  114  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1412  sodium/hydrogen exchanger  22.64 
 
 		 424 aa  112  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4191  Sodium/hydrogen exchanger  24.39 
 
 		 399 aa  109  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1631  sodium/hydrogen exchanger  26.82 
 
 		 474 aa  108  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.599529 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  26.98 
 
 		 375 aa  107  6e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.44 
 
 		 427 aa  107  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  25.57 
 
 		 375 aa  106  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  25.57 
 
 		 375 aa  106  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>