More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1827 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  100 
 
 		 386 aa  751    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  44.91 
 
 		 389 aa  317  3e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  43.68 
 
 		 375 aa  300  2e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  46.01 
 
 		 379 aa  298  9e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  40.84 
 
 		 375 aa  276  7e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  39.95 
 
 		 375 aa  272  7e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  40.16 
 
 		 375 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  39.9 
 
 		 375 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  39.9 
 
 		 375 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  39.9 
 
 		 375 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  39.9 
 
 		 375 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  38.34 
 
 		 385 aa  270  4e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  39.95 
 
 		 375 aa  269  7e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  39.15 
 
 		 387 aa  265  7e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  39.42 
 
 		 387 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  38.89 
 
 		 387 aa  263  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  39.15 
 
 		 387 aa  263  3e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  38.89 
 
 		 387 aa  263  4e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  38.89 
 
 		 387 aa  263  4e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  40.16 
 
 		 375 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  40.16 
 
 		 375 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  38.89 
 
 		 387 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  38.89 
 
 		 387 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  39.9 
 
 		 375 aa  261  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  41.14 
 
 		 352 aa  260  3e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  38.62 
 
 		 387 aa  257  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  38.62 
 
 		 387 aa  257  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  37.47 
 
 		 389 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  36.32 
 
 		 396 aa  230  3e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  38.48 
 
 		 399 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  35.83 
 
 		 445 aa  203  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  33.6 
 
 		 382 aa  199  6e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  36.97 
 
 		 400 aa  195  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  37.4 
 
 		 399 aa  186  5e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  33.25 
 
 		 397 aa  177  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  32.6 
 
 		 416 aa  176  5e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  32.74 
 
 		 404 aa  176  8e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  32.54 
 
 		 412 aa  174  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  33.25 
 
 		 399 aa  170  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  31.39 
 
 		 423 aa  159  6e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2594  sodium/hydrogen exchanger  31.14 
 
 		 491 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3964  sodium/hydrogen exchanger  29.8 
 
 		 402 aa  155  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0770173  normal  0.0859803 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.79 
 
 		 418 aa  154  2e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0706  sodium/hydrogen exchanger  32.89 
 
 		 404 aa  150  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.584868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  30.32 
 
 		 395 aa  149  6e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  31.79 
 
 		 385 aa  149  6e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4724  sodium/hydrogen exchanger  28.74 
 
 		 473 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1282  sodium/hydrogen exchanger  27.41 
 
 		 406 aa  145  2e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0499  NaH antiporter protein  27.48 
 
 		 389 aa  142  7e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  29.84 
 
 		 390 aa  142  8e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1631  sodium/hydrogen exchanger  29.33 
 
 		 474 aa  142  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.599529 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3668  Sodium/hydrogen exchanger  29.87 
 
 		 415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  28.71 
 
 		 467 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  30.12 
 
 		 424 aa  140  3e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  28.71 
 
 		 467 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.35 
 
 		 427 aa  139  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1576  sodium/hydrogen exchanger  30.17 
 
 		 392 aa  138  1e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.000000405712  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0325  sodium/hydrogen exchanger  30.87 
 
 		 398 aa  137  2e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1099  sodium/hydrogen exchanger  29.97 
 
 		 392 aa  138  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0847  sodium/hydrogen exchanger  29.6 
 
 		 392 aa  138  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.461656  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  32.71 
 
 		 398 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  29.86 
 
 		 424 aa  135  8e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1868  sodium/hydrogen exchanger  29.02 
 
 		 469 aa  136  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3809  sodium/hydrogen exchanger  27.71 
 
 		 413 aa  135  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.397158  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3726  sodium/hydrogen exchanger  29.43 
 
 		 413 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  26.17 
 
 		 412 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3029  Sodium/hydrogen exchanger  29.26 
 
 		 453 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1464  Sodium/hydrogen exchanger  31.04 
 
 		 485 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000329156  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0863  sodium/hydrogen exchanger  27.45 
 
 		 513 aa  130  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0750424  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  26.17 
 
 		 414 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6352  sodium/hydrogen exchanger  28.35 
 
 		 436 aa  129  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105497 
 
 
-
 
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  27.64 
 
 		 767 aa  129  1.0000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  25.96 
 
 		 748 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0839  hypothetical protein  28.69 
 
 		 479 aa  127  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  25.78 
 
 		 741 aa  126  5e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2295  sodium/hydrogen exchanger  25.67 
 
 		 386 aa  126  8.000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.784703 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17221  CPA2 family Na+/H+ antiporter  30.09 
 
 		 457 aa  126  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.597221 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0606  sodium/hydrogen exchanger  27.16 
 
 		 414 aa  125  9e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  28.69 
 
 		 388 aa  125  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0454  Na+/H+ antiporter  28.64 
 
 		 701 aa  123  5e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.809076  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0868  hypothetical protein  28.61 
 
 		 479 aa  123  7e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0743  sodium/hydrogen exchanger  27.85 
 
 		 395 aa  123  7e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.286808  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  26.06 
 
 		 650 aa  122  7e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3950  sodium/hydrogen exchanger  27.4 
 
 		 414 aa  122  8e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.387419 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  28.86 
 
 		 750 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  27.3 
 
 		 586 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0153  CPA2 family Na+/H+ antiporter  29.19 
 
 		 458 aa  120  3e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.430918  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2359  Na+/H+ antiporter  28.5 
 
 		 460 aa  121  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18091  CPA2 family Na+/H+ antiporter  29.25 
 
 		 455 aa  119  6e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  25.98 
 
 		 749 aa  119  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17921  CPA2 family Na+/H+ antiporter  28.77 
 
 		 455 aa  119  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1175  Na+/H+ antiporter  29.98 
 
 		 457 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0183  CPA2 family Na+/H+ antiporter  28.3 
 
 		 458 aa  118  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2098  sodium/hydrogen exchanger  26.68 
 
 		 584 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20501  CPA2 family Na+/H+ antiporter  29.98 
 
 		 457 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0786073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  25.25 
 
 		 756 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1692  CPA2 family Na+/H+ antiporter  28.77 
 
 		 455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25931  putative Na+/H+ antiporter, CPA2 family  30 
 
 		 457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A26  Kef-type K+ transport systems, membrane component  40 
 
 		 320 aa  117  3.9999999999999997e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0433  sodium/hydrogen exchanger  26.58 
 
 		 387 aa  117  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.129504  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>