More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_A26 on replicon NC_008496
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008496  LEUM_A26  Kef-type K+ transport systems, membrane component  100 
 
 
320 aa  606  9.999999999999999e-173  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0547  Kef-type K+ transport systems, membrane component  60 
 
 
318 aa  377  1e-103  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.013509  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  35.04 
 
 
375 aa  190  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  29.97 
 
 
389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  29.57 
 
 
387 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  32.59 
 
 
389 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  29.6 
 
 
385 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  28.49 
 
 
387 aa  152  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  28.49 
 
 
387 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  28.49 
 
 
387 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  27.96 
 
 
387 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  27.96 
 
 
387 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  27.96 
 
 
387 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  27.96 
 
 
387 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  27.96 
 
 
387 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  28.23 
 
 
387 aa  143  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  31.75 
 
 
400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  31.47 
 
 
352 aa  136  5e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  28.42 
 
 
375 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  28.42 
 
 
375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  28.42 
 
 
375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  28.42 
 
 
375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  28.42 
 
 
375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  28.93 
 
 
382 aa  130  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  30.08 
 
 
445 aa  129  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  46.53 
 
 
379 aa  126  4.0000000000000003e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  28.42 
 
 
375 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  28.42 
 
 
375 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  28.42 
 
 
375 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  41.56 
 
 
386 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  29.06 
 
 
388 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  38.17 
 
 
396 aa  106  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1576  sodium/hydrogen exchanger  27.11 
 
 
392 aa  106  7e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.000000405712  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0847  sodium/hydrogen exchanger  26.6 
 
 
392 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.461656  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1099  sodium/hydrogen exchanger  27.88 
 
 
392 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  37.13 
 
 
399 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  28.01 
 
 
388 aa  103  5e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1792  sodium/hydrogen exchanger  27.86 
 
 
388 aa  102  9e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.906777  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  39.13 
 
 
375 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  32.04 
 
 
399 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  37.91 
 
 
375 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  38.41 
 
 
375 aa  97.4  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  27.25 
 
 
388 aa  95.9  9e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  35 
 
 
404 aa  93.2  5e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  24.06 
 
 
385 aa  89.7  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  27.98 
 
 
467 aa  85.9  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  27.98 
 
 
467 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  30.57 
 
 
412 aa  83.2  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1282  sodium/hydrogen exchanger  31.58 
 
 
406 aa  82.8  0.000000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  23.82 
 
 
395 aa  81.6  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1799  sodium/hydrogen exchanger  29.03 
 
 
462 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1868  sodium/hydrogen exchanger  34.21 
 
 
469 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  33.8 
 
 
412 aa  80.5  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44889  predicted protein  28.89 
 
 
892 aa  79.7  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.423509  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0325  sodium/hydrogen exchanger  27.6 
 
 
398 aa  79  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  26.44 
 
 
424 aa  78.6  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3964  sodium/hydrogen exchanger  34.85 
 
 
402 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0770173  normal  0.0859803 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0839  hypothetical protein  31.15 
 
 
479 aa  76.3  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  25.14 
 
 
390 aa  76.3  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0868  hypothetical protein  31.15 
 
 
479 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0454  Na+/H+ antiporter  26.63 
 
 
701 aa  75.9  0.000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.809076  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4159  sodium/hydrogen exchanger  22.07 
 
 
446 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.81 
 
 
418 aa  74.3  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  32.21 
 
 
423 aa  74.7  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3029  Sodium/hydrogen exchanger  25.75 
 
 
453 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75325  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  35.42 
 
 
399 aa  74.7  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50516  predicted protein  33.33 
 
 
806 aa  74.3  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  29.38 
 
 
397 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3668  Sodium/hydrogen exchanger  34.03 
 
 
415 aa  73.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1631  sodium/hydrogen exchanger  27.4 
 
 
474 aa  73.2  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.599529 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  23.87 
 
 
398 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3558  sodium/hydrogen exchanger  23.23 
 
 
455 aa  68.9  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790544  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3726  sodium/hydrogen exchanger  31.94 
 
 
413 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  24.04 
 
 
460 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3950  sodium/hydrogen exchanger  25.46 
 
 
414 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.387419 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1464  Sodium/hydrogen exchanger  36.36 
 
 
485 aa  67  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000329156  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  31.52 
 
 
636 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  32.56 
 
 
654 aa  66.2  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0433  sodium/hydrogen exchanger  30.59 
 
 
387 aa  65.1  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.129504  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17221  CPA2 family Na+/H+ antiporter  36.64 
 
 
457 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.597221 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0917  sodium/hydrogen exchanger  29.48 
 
 
585 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  28.43 
 
 
741 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0706  sodium/hydrogen exchanger  34.72 
 
 
404 aa  65.1  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.584868  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3809  sodium/hydrogen exchanger  29.86 
 
 
413 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.397158  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  23.46 
 
 
586 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1175  Na+/H+ antiporter  35.88 
 
 
457 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20501  CPA2 family Na+/H+ antiporter  35.88 
 
 
457 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0786073  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  29.24 
 
 
748 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0913  sodium/hydrogen exchanger  20.92 
 
 
413 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0183  CPA2 family Na+/H+ antiporter  34.59 
 
 
458 aa  62.8  0.000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17871  CPA2 family Na+/H+ antiporter  27.32 
 
 
455 aa  62.4  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18091  CPA2 family Na+/H+ antiporter  27.45 
 
 
455 aa  62.4  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0153  CPA2 family Na+/H+ antiporter  36.65 
 
 
458 aa  62.4  0.000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.430918  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44149  predicted protein  30.29 
 
 
459 aa  62.4  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104122  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25931  putative Na+/H+ antiporter, CPA2 family  36.3 
 
 
457 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  27.16 
 
 
668 aa  62  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1645  sodium/hydrogen exchanger  32.12 
 
 
586 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04834  transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family  21.61 
 
 
421 aa  62.4  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  30.99 
 
 
749 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  30.3 
 
 
567 aa  62  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>