More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1178 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  100 
 
 
650 aa  1291    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  35.66 
 
 
671 aa  405  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  34.86 
 
 
762 aa  399  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  36.82 
 
 
775 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  34.31 
 
 
652 aa  390  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  36.68 
 
 
771 aa  389  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  34.62 
 
 
673 aa  387  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  36.38 
 
 
665 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1076  sodium/hydrogen exchanger  36.38 
 
 
665 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  34.95 
 
 
773 aa  375  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  33.59 
 
 
662 aa  366  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  32.07 
 
 
658 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  33.48 
 
 
682 aa  332  1e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  32.06 
 
 
674 aa  330  6e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  31.22 
 
 
672 aa  324  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  31.36 
 
 
666 aa  318  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  34.01 
 
 
663 aa  317  4e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  31.7 
 
 
741 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  29.95 
 
 
666 aa  311  2e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.45 
 
 
697 aa  310  5.9999999999999995e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  30.47 
 
 
667 aa  310  5.9999999999999995e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4813  sodium/hydrogen exchanger  35.32 
 
 
666 aa  309  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3229  putative cation:proton antiport protein  37.4 
 
 
561 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.177126  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  32.61 
 
 
664 aa  308  2.0000000000000002e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  31.22 
 
 
636 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  31.97 
 
 
665 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3034  putative cation:proton antiport protein  36.63 
 
 
563 aa  307  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0496878  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3175  putative cation:proton antiport protein  36.63 
 
 
563 aa  307  5.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.47283  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  30.96 
 
 
656 aa  306  6e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1082  putative cation:proton antiport protein  37.31 
 
 
561 aa  306  7e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  31.96 
 
 
670 aa  306  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1145  putative cation:proton antiport protein  37.11 
 
 
563 aa  305  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176983  unclonable  0.0000000402209 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  31.97 
 
 
671 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.6 
 
 
567 aa  304  3.0000000000000004e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  33.9 
 
 
693 aa  304  4.0000000000000003e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  31.36 
 
 
666 aa  303  9e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1259  putative cation:proton antiport protein  36.81 
 
 
562 aa  302  1e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00350207  hitchhiker  0.0000131586 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  34.06 
 
 
567 aa  302  1e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  31.87 
 
 
674 aa  302  1e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1026  putative cation:proton antiport protein  37.12 
 
 
562 aa  302  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  34.06 
 
 
567 aa  301  3e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0258  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 
573 aa  298  3e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  32.97 
 
 
684 aa  296  6e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  31.84 
 
 
666 aa  292  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  31.11 
 
 
668 aa  289  1e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3033  putative cation:proton antiport protein  37.31 
 
 
561 aa  289  1e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3140  potassium efflux system protein  35.15 
 
 
566 aa  288  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138229  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3733  potassium efflux system protein  35.78 
 
 
575 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1736  potassium efflux system protein  35.78 
 
 
556 aa  286  8e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  30.03 
 
 
665 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1853  sodium/hydrogen exchanger  31.09 
 
 
688 aa  282  1e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000204486  normal  0.40293 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1132  hypothetical protein  33.27 
 
 
564 aa  282  1e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0261  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.39 
 
 
588 aa  280  4e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0988  sodium/hydrogen exchanger  28.75 
 
 
676 aa  278  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4368  potassium efflux system protein  33.72 
 
 
583 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22742  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0544  putative cation:proton antiport protein  34.52 
 
 
558 aa  276  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.890116  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0554  putative cation:proton antiport protein  34.52 
 
 
558 aa  276  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.556541  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0599  putative cation:proton antiport protein  34.52 
 
 
558 aa  276  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.18338  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0539  putative cation:proton antiport protein  34.52 
 
 
558 aa  276  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0538  putative cation:proton antiport protein  34.52 
 
 
558 aa  276  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0410  putative cation:proton antiport protein  33.96 
 
 
558 aa  276  9e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  31.02 
 
 
674 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6319  putative potassium efflux transporter  35.49 
 
 
568 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.168195  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2149  sodium/hydrogen exchanger  34.81 
 
 
567 aa  275  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0957  putative cation:proton antiport protein  35.11 
 
 
558 aa  275  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72800  putative potassium efflux transporter  35.71 
 
 
567 aa  275  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2112  potassium efflux system protein  33.45 
 
 
624 aa  274  5.000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521521  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3434  sodium/hydrogen exchanger  34.52 
 
 
577 aa  273  6e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106813  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0567  hypothetical protein  33.09 
 
 
564 aa  272  2e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3064  Sodium/hydrogen exchanger  33.7 
 
 
565 aa  272  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  29.78 
 
 
659 aa  270  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0505  sodium/hydrogen exchanger  32.5 
 
 
584 aa  270  5e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3132  potassium efflux system protein  33.77 
 
 
558 aa  269  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0517  putative cation:proton antiport protein  33.96 
 
 
558 aa  269  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1281  sodium/hydrogen exchanger  34 
 
 
572 aa  269  1e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.330977  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1325  potassium efflux system family protein  35.66 
 
 
619 aa  269  1e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.113614  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1345  cation:proton antiporter  34 
 
 
572 aa  269  1e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.267602  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1285  potassium efflux system family protein  35.66 
 
 
619 aa  269  1e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433895  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0522  putative cation:proton antiport protein  33.96 
 
 
558 aa  269  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4112  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0570  putative cation:proton antiport protein  33.96 
 
 
558 aa  269  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.861339  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00429  predicted transporter with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  33.77 
 
 
558 aa  268  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2469  putative efflux pump/antiporter  34.97 
 
 
569 aa  268  2e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0878577  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3138  putative cation:proton antiport protein  33.77 
 
 
558 aa  268  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000511667 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00434  hypothetical protein  33.77 
 
 
558 aa  268  2e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0555  putative cation:proton antiport protein  33.77 
 
 
558 aa  268  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0658  potassium efflux system protein  34.52 
 
 
555 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0323  sodium/hydrogen exchanger  32.73 
 
 
606 aa  266  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.569683 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1156  TrkA-N:Sodium/hydrogen exchanger  34.53 
 
 
595 aa  265  1e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.269314  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01936  cation:proton antiporter  33.4 
 
 
569 aa  266  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3287  potassium efflux system protein  31.85 
 
 
605 aa  264  4e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15318  normal  0.307272 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1859  potassium efflux system protein  33.67 
 
 
615 aa  264  4.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  31.63 
 
 
664 aa  263  6.999999999999999e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3670  potassium efflux system protein  33.58 
 
 
576 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.663125  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3414  sodium/hydrogen exchanger  31.35 
 
 
605 aa  263  8e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.399905  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3094  sodium/hydrogen exchanger  31.35 
 
 
605 aa  263  8e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  31.44 
 
 
661 aa  263  1e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000235169 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  31.44 
 
 
661 aa  263  1e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0402  sodium/hydrogen exchanger  33.77 
 
 
562 aa  262  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2033  sodium/hydrogen exchanger  34.1 
 
 
565 aa  262  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0955  sodium/hydrogen exchanger  30.27 
 
 
672 aa  262  2e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00880864  normal  0.316 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>