More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2359 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2359  Na+/H+ antiporter  100 
 
 		 460 aa  864    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  68.13 
 
 		 467 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  68.13 
 
 		 467 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4724  sodium/hydrogen exchanger  62.75 
 
 		 473 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1799  sodium/hydrogen exchanger  65.21 
 
 		 462 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1868  sodium/hydrogen exchanger  61.17 
 
 		 469 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2594  sodium/hydrogen exchanger  65.14 
 
 		 491 aa  488  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3029  Sodium/hydrogen exchanger  60.27 
 
 		 453 aa  482  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1631  sodium/hydrogen exchanger  56.54 
 
 		 474 aa  462  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.599529 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0863  sodium/hydrogen exchanger  59.91 
 
 		 513 aa  444  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0750424  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1464  Sodium/hydrogen exchanger  62.42 
 
 		 485 aa  437  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000329156  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17221  CPA2 family Na+/H+ antiporter  46.73 
 
 		 457 aa  328  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.597221 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1175  Na+/H+ antiporter  45.19 
 
 		 457 aa  322  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20501  CPA2 family Na+/H+ antiporter  45.19 
 
 		 457 aa  322  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0786073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18091  CPA2 family Na+/H+ antiporter  45.41 
 
 		 455 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17921  CPA2 family Na+/H+ antiporter  44.47 
 
 		 455 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25931  putative Na+/H+ antiporter, CPA2 family  45.25 
 
 		 457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1692  CPA2 family Na+/H+ antiporter  44.27 
 
 		 455 aa  306  4.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17871  CPA2 family Na+/H+ antiporter  45.65 
 
 		 455 aa  306  5.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0183  CPA2 family Na+/H+ antiporter  45.73 
 
 		 458 aa  295  1e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0153  CPA2 family Na+/H+ antiporter  45.15 
 
 		 458 aa  294  3e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.430918  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3668  Sodium/hydrogen exchanger  40.19 
 
 		 415 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3809  sodium/hydrogen exchanger  40.72 
 
 		 413 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.397158  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3726  sodium/hydrogen exchanger  40.96 
 
 		 413 aa  223  6e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0839  hypothetical protein  35.02 
 
 		 479 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0868  hypothetical protein  34.22 
 
 		 479 aa  211  3e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  34.57 
 
 		 404 aa  211  3e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.64 
 
 		 427 aa  201  3e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  32.27 
 
 		 424 aa  196  5.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  32.27 
 
 		 424 aa  191  2e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  37.26 
 
 		 385 aa  186  6e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  32.63 
 
 		 397 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  34.51 
 
 		 398 aa  180  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  31.72 
 
 		 375 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  31.72 
 
 		 375 aa  178  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  31.72 
 
 		 375 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  31.72 
 
 		 375 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  31.72 
 
 		 375 aa  178  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  31.48 
 
 		 375 aa  177  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3964  sodium/hydrogen exchanger  31.85 
 
 		 402 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0770173  normal  0.0859803 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  31.1 
 
 		 385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  31.23 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  30.5 
 
 		 387 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  30.99 
 
 		 387 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  30.99 
 
 		 387 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  31.22 
 
 		 387 aa  172  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  31.72 
 
 		 375 aa  170  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  31.72 
 
 		 375 aa  170  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  30.99 
 
 		 387 aa  170  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  30.07 
 
 		 375 aa  170  6e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  30.75 
 
 		 387 aa  169  8e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  31.72 
 
 		 375 aa  169  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  30.75 
 
 		 387 aa  169  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  30.75 
 
 		 387 aa  169  9e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  30.75 
 
 		 387 aa  169  9e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  30.14 
 
 		 396 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  29.83 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  33.5 
 
 		 399 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  32.44 
 
 		 416 aa  166  5e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  33.87 
 
 		 382 aa  162  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  34.45 
 
 		 389 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  34.12 
 
 		 412 aa  160  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  30.77 
 
 		 389 aa  160  6e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  34.54 
 
 		 399 aa  159  9e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.01 
 
 		 418 aa  153  5e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  29.98 
 
 		 386 aa  152  1e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  34.14 
 
 		 445 aa  152  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  29.85 
 
 		 399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  29.71 
 
 		 375 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  33.18 
 
 		 400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1576  sodium/hydrogen exchanger  31.69 
 
 		 392 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.000000405712  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0847  sodium/hydrogen exchanger  31.73 
 
 		 392 aa  144  4e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.461656  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  29.59 
 
 		 379 aa  144  4e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  31.64 
 
 		 423 aa  143  6e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1099  sodium/hydrogen exchanger  31.25 
 
 		 392 aa  140  3e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  26.96 
 
 		 390 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  30.41 
 
 		 388 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  30.86 
 
 		 395 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0706  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 404 aa  136  8e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.584868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  31.06 
 
 		 748 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  28.1 
 
 		 388 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  31.22 
 
 		 750 aa  130  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  29.91 
 
 		 749 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  28.27 
 
 		 388 aa  126  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1792  sodium/hydrogen exchanger  27.86 
 
 		 388 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.906777  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2302  sodium/hydrogen exchanger  29.24 
 
 		 423 aa  123  6e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2667  sodium/hydrogen exchanger  31.03 
 
 		 435 aa  121  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6352  sodium/hydrogen exchanger  31.97 
 
 		 436 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105497 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  29.88 
 
 		 352 aa  120  3.9999999999999996e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  27.31 
 
 		 756 aa  120  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.45 
 
 		 587 aa  120  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  29.46 
 
 		 460 aa  119  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  29.79 
 
 		 587 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.45 
 
 		 587 aa  118  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  29.88 
 
 		 586 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  28.99 
 
 		 741 aa  116  8.999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  29.67 
 
 		 586 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  28.99 
 
 		 585 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  28.99 
 
 		 585 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  29.38 
 
 		 586 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>