More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0200 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 389 aa  768    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  45.21 
 
 		 386 aa  306  4.0000000000000004e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  41.93 
 
 		 352 aa  297  2e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  41.4 
 
 		 375 aa  295  7e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  38.29 
 
 		 385 aa  281  1e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  38.94 
 
 		 387 aa  277  3e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  39.64 
 
 		 387 aa  276  5e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  39.64 
 
 		 387 aa  276  5e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  39.64 
 
 		 387 aa  276  5e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  39.64 
 
 		 387 aa  276  5e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  40.67 
 
 		 379 aa  276  6e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  39.38 
 
 		 387 aa  275  7e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  39.38 
 
 		 387 aa  275  9e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  39.38 
 
 		 387 aa  275  9e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  39.38 
 
 		 387 aa  273  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  37.4 
 
 		 387 aa  270  4e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  37.57 
 
 		 375 aa  260  3e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  37.57 
 
 		 375 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  37.57 
 
 		 375 aa  260  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  37.57 
 
 		 375 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  37.57 
 
 		 375 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  38.11 
 
 		 375 aa  259  4e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  38.71 
 
 		 375 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  37.57 
 
 		 375 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  37.2 
 
 		 375 aa  249  5e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  37.3 
 
 		 375 aa  249  5e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  37.2 
 
 		 375 aa  249  5e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  37.7 
 
 		 389 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  33.15 
 
 		 399 aa  204  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  33.51 
 
 		 396 aa  202  8e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  32.03 
 
 		 382 aa  190  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  33.78 
 
 		 445 aa  185  9e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  34.46 
 
 		 400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  34.15 
 
 		 412 aa  179  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  31.84 
 
 		 399 aa  179  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  32.81 
 
 		 385 aa  167  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A26  Kef-type K+ transport systems, membrane component  29.97 
 
 		 320 aa  164  3e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  31.89 
 
 		 416 aa  161  2e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.29 
 
 		 418 aa  160  5e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  29.31 
 
 		 397 aa  151  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0706  sodium/hydrogen exchanger  30 
 
 		 404 aa  151  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.584868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  29.82 
 
 		 399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  31.6 
 
 		 423 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  31.7 
 
 		 404 aa  146  5e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  29.93 
 
 		 467 aa  145  9e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.5 
 
 		 427 aa  145  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  29.93 
 
 		 467 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  33.5 
 
 		 424 aa  144  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2594  sodium/hydrogen exchanger  30.05 
 
 		 491 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3964  sodium/hydrogen exchanger  30.53 
 
 		 402 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0770173  normal  0.0859803 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  32.75 
 
 		 424 aa  142  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  25.7 
 
 		 414 aa  140  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0325  sodium/hydrogen exchanger  30.69 
 
 		 398 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1576  sodium/hydrogen exchanger  28.94 
 
 		 392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.000000405712  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4724  sodium/hydrogen exchanger  28.83 
 
 		 473 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1390  sodium/hydrogen exchanger  30.25 
 
 		 782 aa  136  8e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1631  sodium/hydrogen exchanger  31.25 
 
 		 474 aa  135  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.599529 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1099  sodium/hydrogen exchanger  27.87 
 
 		 392 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0847  sodium/hydrogen exchanger  28.21 
 
 		 392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.461656  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3726  sodium/hydrogen exchanger  30.81 
 
 		 413 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3668  Sodium/hydrogen exchanger  30 
 
 		 415 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  28.72 
 
 		 395 aa  131  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  25.79 
 
 		 741 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1282  sodium/hydrogen exchanger  26.22 
 
 		 406 aa  130  5.0000000000000004e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3809  sodium/hydrogen exchanger  30.29 
 
 		 413 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.397158  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1868  sodium/hydrogen exchanger  27.95 
 
 		 469 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  28.35 
 
 		 388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  30.03 
 
 		 398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  27.68 
 
 		 586 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  27.94 
 
 		 586 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  27.94 
 
 		 586 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  27.25 
 
 		 390 aa  125  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  27.94 
 
 		 587 aa  125  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0454  Na+/H+ antiporter  26.21 
 
 		 701 aa  124  3e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.809076  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  27.68 
 
 		 586 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  28.61 
 
 		 388 aa  124  3e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1792  sodium/hydrogen exchanger  28.09 
 
 		 388 aa  124  3e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.906777  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.94 
 
 		 587 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  28.05 
 
 		 388 aa  122  8e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0839  hypothetical protein  25.83 
 
 		 479 aa  122  9e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.68 
 
 		 587 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3029  Sodium/hydrogen exchanger  28.1 
 
 		 453 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  27.49 
 
 		 585 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  27.49 
 
 		 585 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0868  hypothetical protein  26.49 
 
 		 479 aa  119  7e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1799  sodium/hydrogen exchanger  26.9 
 
 		 462 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1130  sodium/hydrogen exchanger  28.83 
 
 		 586 aa  117  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.496723 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1464  Sodium/hydrogen exchanger  31.25 
 
 		 485 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000329156  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3950  sodium/hydrogen exchanger  27.21 
 
 		 414 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.387419 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0153  CPA2 family Na+/H+ antiporter  29.65 
 
 		 458 aa  116  7.999999999999999e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.430918  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0499  NaH antiporter protein  26.75 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17871  CPA2 family Na+/H+ antiporter  28.74 
 
 		 455 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2302  sodium/hydrogen exchanger  26.95 
 
 		 423 aa  113  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113166  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  25.82 
 
 		 674 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17921  CPA2 family Na+/H+ antiporter  28.03 
 
 		 455 aa  113  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1692  CPA2 family Na+/H+ antiporter  28.19 
 
 		 455 aa  113  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18091  CPA2 family Na+/H+ antiporter  28.03 
 
 		 455 aa  113  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17221  CPA2 family Na+/H+ antiporter  29.02 
 
 		 457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.597221 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1175  Na+/H+ antiporter  28.02 
 
 		 457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20501  CPA2 family Na+/H+ antiporter  28.02 
 
 		 457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0786073  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>