More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1692 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_25931  putative Na+/H+ antiporter, CPA2 family  86.34 
 
 
457 aa  715    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17871  CPA2 family Na+/H+ antiporter  97.58 
 
 
455 aa  781    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1175  Na+/H+ antiporter  88.55 
 
 
457 aa  754    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18091  CPA2 family Na+/H+ antiporter  99.12 
 
 
455 aa  853    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1692  CPA2 family Na+/H+ antiporter  100 
 
 
455 aa  863    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20501  CPA2 family Na+/H+ antiporter  88.55 
 
 
457 aa  754    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0786073  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17921  CPA2 family Na+/H+ antiporter  99.34 
 
 
455 aa  854    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17221  CPA2 family Na+/H+ antiporter  90.31 
 
 
457 aa  757    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.597221 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0183  CPA2 family Na+/H+ antiporter  72.89 
 
 
458 aa  607  9.999999999999999e-173  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0153  CPA2 family Na+/H+ antiporter  72.61 
 
 
458 aa  605  9.999999999999999e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.430918  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1868  sodium/hydrogen exchanger  45.97 
 
 
469 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4724  sodium/hydrogen exchanger  45.95 
 
 
473 aa  335  7.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2594  sodium/hydrogen exchanger  46.19 
 
 
491 aa  335  7.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  45.01 
 
 
467 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  45.01 
 
 
467 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1631  sodium/hydrogen exchanger  44.37 
 
 
474 aa  328  2.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.599529 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3029  Sodium/hydrogen exchanger  43.95 
 
 
453 aa  325  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75325  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1799  sodium/hydrogen exchanger  43.22 
 
 
462 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2359  Na+/H+ antiporter  45.76 
 
 
460 aa  290  5.0000000000000004e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1464  Sodium/hydrogen exchanger  45.26 
 
 
485 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000329156  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0863  sodium/hydrogen exchanger  43.81 
 
 
513 aa  282  7.000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0750424  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  32.24 
 
 
404 aa  196  9e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0839  hypothetical protein  32.3 
 
 
479 aa  181  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0868  hypothetical protein  32.3 
 
 
479 aa  180  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3668  Sodium/hydrogen exchanger  36.89 
 
 
415 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3809  sodium/hydrogen exchanger  37.68 
 
 
413 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.397158  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3726  sodium/hydrogen exchanger  37.72 
 
 
413 aa  173  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  34.05 
 
 
385 aa  169  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.8 
 
 
427 aa  162  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  30.34 
 
 
424 aa  160  3e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3964  sodium/hydrogen exchanger  31.79 
 
 
402 aa  159  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0770173  normal  0.0859803 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  32.09 
 
 
397 aa  158  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  29.79 
 
 
424 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  31.66 
 
 
398 aa  153  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  29.85 
 
 
416 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  29.95 
 
 
749 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  31.35 
 
 
748 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  29.33 
 
 
387 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  28.85 
 
 
387 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  28.85 
 
 
387 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  29.09 
 
 
387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  29.09 
 
 
387 aa  141  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  29.09 
 
 
387 aa  141  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  28.85 
 
 
387 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  28.85 
 
 
387 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  28.61 
 
 
385 aa  140  6e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  28.57 
 
 
387 aa  140  7e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  28.61 
 
 
387 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  28.99 
 
 
386 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  29.91 
 
 
396 aa  134  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  27.43 
 
 
375 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  28.19 
 
 
389 aa  132  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  26.94 
 
 
375 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  26.7 
 
 
375 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  26.94 
 
 
375 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  26.94 
 
 
375 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  26.94 
 
 
375 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  26.94 
 
 
375 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  32.68 
 
 
382 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  30.68 
 
 
389 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  26.46 
 
 
375 aa  127  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  29.44 
 
 
399 aa  126  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  27.64 
 
 
379 aa  125  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  29.29 
 
 
750 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  28.92 
 
 
375 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  28.92 
 
 
375 aa  124  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  28.92 
 
 
375 aa  123  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  28.88 
 
 
445 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  31.78 
 
 
412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.57 
 
 
418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  30.16 
 
 
423 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  27.77 
 
 
756 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  31.05 
 
 
399 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  29.3 
 
 
400 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4036  sodium/hydrogen exchanger  28.37 
 
 
422 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554914  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  27.83 
 
 
375 aa  111  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  27.65 
 
 
399 aa  110  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0706  sodium/hydrogen exchanger  30.2 
 
 
404 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.584868  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  25.77 
 
 
390 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1107  sodium/hydrogen exchanger  27.52 
 
 
775 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112633  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  27.79 
 
 
412 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  27.03 
 
 
388 aa  105  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  28.65 
 
 
352 aa  105  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6352  sodium/hydrogen exchanger  27.96 
 
 
436 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105497 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  30.24 
 
 
395 aa  104  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1412  sodium/hydrogen exchanger  29.48 
 
 
395 aa  102  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.179509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  27.37 
 
 
460 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  28.74 
 
 
764 aa  102  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1576  sodium/hydrogen exchanger  26.96 
 
 
392 aa  101  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.000000405712  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0847  sodium/hydrogen exchanger  26.96 
 
 
392 aa  99.4  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.461656  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  23.94 
 
 
414 aa  99  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2295  sodium/hydrogen exchanger  29.53 
 
 
386 aa  98.2  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.784703 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  26.44 
 
 
585 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1099  sodium/hydrogen exchanger  26.63 
 
 
392 aa  96.7  8e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  26.44 
 
 
585 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4159  sodium/hydrogen exchanger  28.47 
 
 
446 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  24.77 
 
 
767 aa  93.2  9e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50516  predicted protein  25.79 
 
 
806 aa  92.8  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  25.12 
 
 
482 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4708  sodium/hydrogen exchanger  27.61 
 
 
715 aa  92.4  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>