More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1965 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  100 
 
 		 418 aa  826    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  39.29 
 
 		 399 aa  256  4e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  39 
 
 		 399 aa  246  4e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  35.47 
 
 		 396 aa  234  3e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  41.1 
 
 		 382 aa  223  4e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  36.66 
 
 		 445 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  35.05 
 
 		 400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  33 
 
 		 387 aa  192  9e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  32.92 
 
 		 387 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  32.42 
 
 		 387 aa  191  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  32.42 
 
 		 387 aa  192  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  32.92 
 
 		 387 aa  192  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  32.42 
 
 		 387 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  32.92 
 
 		 387 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  32.92 
 
 		 387 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  32.32 
 
 		 385 aa  189  5e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  34.7 
 
 		 375 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  34.7 
 
 		 375 aa  187  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  34.7 
 
 		 375 aa  187  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  34.7 
 
 		 375 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  33.85 
 
 		 375 aa  186  7e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  32.17 
 
 		 387 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  32.17 
 
 		 387 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  34.45 
 
 		 375 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  33.93 
 
 		 375 aa  184  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  34.68 
 
 		 389 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  36.58 
 
 		 375 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  32.74 
 
 		 375 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  36.28 
 
 		 375 aa  182  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  36.28 
 
 		 375 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  32.81 
 
 		 375 aa  168  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  33.67 
 
 		 412 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  33.81 
 
 		 352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  29.29 
 
 		 389 aa  160  5e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1631  sodium/hydrogen exchanger  31.28 
 
 		 474 aa  153  5e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.599529 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0847  sodium/hydrogen exchanger  29.53 
 
 		 392 aa  152  1e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.461656  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  29.18 
 
 		 388 aa  152  1e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1576  sodium/hydrogen exchanger  29.06 
 
 		 392 aa  152  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.000000405712  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  31.41 
 
 		 386 aa  152  1e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  30.14 
 
 		 424 aa  150  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1099  sodium/hydrogen exchanger  29.06 
 
 		 392 aa  149  9e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  29.67 
 
 		 424 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.14 
 
 		 427 aa  147  5e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  31.46 
 
 		 398 aa  146  8.000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1868  sodium/hydrogen exchanger  31.49 
 
 		 469 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  29.1 
 
 		 388 aa  145  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  30.08 
 
 		 379 aa  144  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  31.25 
 
 		 423 aa  144  3e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  28.15 
 
 		 416 aa  144  4e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1792  sodium/hydrogen exchanger  29.1 
 
 		 388 aa  144  4e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.906777  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  29.1 
 
 		 388 aa  144  4e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0706  sodium/hydrogen exchanger  32.64 
 
 		 404 aa  143  7e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.584868  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  31.02 
 
 		 385 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3668  Sodium/hydrogen exchanger  32.15 
 
 		 415 aa  141  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  29.81 
 
 		 395 aa  141  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3809  sodium/hydrogen exchanger  31.22 
 
 		 413 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.397158  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1464  Sodium/hydrogen exchanger  33.15 
 
 		 485 aa  138  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000329156  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  28.67 
 
 		 467 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3726  sodium/hydrogen exchanger  32.23 
 
 		 413 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  28.67 
 
 		 467 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3029  Sodium/hydrogen exchanger  29.63 
 
 		 453 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  30.54 
 
 		 404 aa  137  5e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  30.38 
 
 		 399 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2594  sodium/hydrogen exchanger  30.29 
 
 		 491 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0325  sodium/hydrogen exchanger  31.68 
 
 		 398 aa  134  3.9999999999999996e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1799  sodium/hydrogen exchanger  29.34 
 
 		 462 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4724  sodium/hydrogen exchanger  29.53 
 
 		 473 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  26.55 
 
 		 397 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3964  sodium/hydrogen exchanger  27.51 
 
 		 402 aa  126  7e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0770173  normal  0.0859803 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0606  sodium/hydrogen exchanger  28.97 
 
 		 414 aa  125  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0433  sodium/hydrogen exchanger  27.85 
 
 		 387 aa  123  6e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3950  sodium/hydrogen exchanger  27.64 
 
 		 414 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.387419 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2359  Na+/H+ antiporter  32.69 
 
 		 460 aa  120  6e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0454  Na+/H+ antiporter  31.11 
 
 		 701 aa  119  9.999999999999999e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.809076  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2302  sodium/hydrogen exchanger  27.46 
 
 		 423 aa  118  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113166  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  26.5 
 
 		 390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0935  sodium/hydrogen exchanger  28.34 
 
 		 448 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0791  Na+/H+ antiporter, putative  28.34 
 
 		 448 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  27.86 
 
 		 750 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0863  sodium/hydrogen exchanger  31.52 
 
 		 513 aa  113  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0750424  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25931  putative Na+/H+ antiporter, CPA2 family  27.56 
 
 		 457 aa  113  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  27.14 
 
 		 414 aa  113  8.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0839  hypothetical protein  27.45 
 
 		 479 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1175  Na+/H+ antiporter  27.17 
 
 		 457 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20501  CPA2 family Na+/H+ antiporter  27.17 
 
 		 457 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0786073  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0868  hypothetical protein  27.45 
 
 		 479 aa  111  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  28.29 
 
 		 764 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17221  CPA2 family Na+/H+ antiporter  27.53 
 
 		 457 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.597221 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0743  sodium/hydrogen exchanger  27.83 
 
 		 395 aa  108  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.286808  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0153  CPA2 family Na+/H+ antiporter  28.84 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.430918  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1396  sodium/hydrogen exchanger  27.86 
 
 		 689 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0052164  normal  0.118619 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2295  sodium/hydrogen exchanger  29.05 
 
 		 386 aa  106  8e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.784703 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01670  potassium:hydrogen antiporter, putative  26.54 
 
 		 951 aa  106  9e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  27.52 
 
 		 756 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.75 
 
 		 587 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  26.78 
 
 		 749 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2552  sodium/hydrogen exchanger  27.29 
 
 		 747 aa  105  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.803467  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  28 
 
 		 587 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  25.24 
 
 		 748 aa  104  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1107  sodium/hydrogen exchanger  28.71 
 
 		 775 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112633  normal  0.12903 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>