More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2667 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2667  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 767 aa  1501    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  47.16 
 
 		 412 aa  329  1.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  33.33 
 
 		 387 aa  168  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  33.06 
 
 		 387 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  33.06 
 
 		 387 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  33.06 
 
 		 387 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  33.33 
 
 		 387 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  33.06 
 
 		 387 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  32.8 
 
 		 387 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  33.06 
 
 		 387 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  32.8 
 
 		 387 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  33.06 
 
 		 387 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  31.5 
 
 		 375 aa  161  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  31.72 
 
 		 385 aa  161  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3180  TrkA domain-containing protein  50.33 
 
 		 838 aa  159  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  32.38 
 
 		 414 aa  159  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  31.66 
 
 		 399 aa  157  7e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  31.07 
 
 		 375 aa  156  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  31.07 
 
 		 375 aa  156  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  31.07 
 
 		 375 aa  156  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  31.07 
 
 		 375 aa  156  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  31.07 
 
 		 375 aa  156  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  32.56 
 
 		 750 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  30.18 
 
 		 375 aa  155  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  30.18 
 
 		 375 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  32.37 
 
 		 389 aa  154  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  30.15 
 
 		 767 aa  148  4.0000000000000006e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  31.07 
 
 		 375 aa  148  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  31.07 
 
 		 375 aa  148  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  30.18 
 
 		 375 aa  147  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0960  Sodium/hydrogen exchanger  29.76 
 
 		 425 aa  147  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848142  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  28.61 
 
 		 398 aa  146  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0606  sodium/hydrogen exchanger  31.14 
 
 		 414 aa  145  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3950  sodium/hydrogen exchanger  30.48 
 
 		 414 aa  145  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.387419 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  30.89 
 
 		 382 aa  144  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  30.25 
 
 		 445 aa  143  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  28.08 
 
 		 749 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  30.03 
 
 		 396 aa  142  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  29.04 
 
 		 756 aa  141  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  30.59 
 
 		 423 aa  141  4.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  30.32 
 
 		 400 aa  140  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  31.76 
 
 		 385 aa  136  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  29.58 
 
 		 379 aa  136  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0706  sodium/hydrogen exchanger  31.69 
 
 		 404 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.584868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  31.32 
 
 		 412 aa  133  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  31.82 
 
 		 395 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  29.59 
 
 		 460 aa  128  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  27.31 
 
 		 748 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  28.46 
 
 		 482 aa  127  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2552  sodium/hydrogen exchanger  28.16 
 
 		 747 aa  126  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.803467  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04834  transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family  29.24 
 
 		 421 aa  125  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  28.23 
 
 		 375 aa  125  4e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1632  Sodium/hydrogen exchanger  29.78 
 
 		 723 aa  124  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.531828 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0424  sodium/hydrogen exchanger  30.99 
 
 		 852 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1107  sodium/hydrogen exchanger  28.54 
 
 		 775 aa  123  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112633  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  27.96 
 
 		 764 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.61 
 
 		 399 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3828  sodium/hydrogen exchanger  27.57 
 
 		 715 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  27.7 
 
 		 390 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3878  sodium/hydrogen exchanger  27.57 
 
 		 715 aa  121  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.267583  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  28.39 
 
 		 416 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3964  sodium/hydrogen exchanger  28.8 
 
 		 402 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0770173  normal  0.0859803 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1631  sodium/hydrogen exchanger  27.9 
 
 		 474 aa  118  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.599529 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  27.7 
 
 		 386 aa  119  3e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0546  Na+/H+ antiporter  30.05 
 
 		 715 aa  117  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  26.29 
 
 		 404 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1281  sodium/hydrogen exchanger  31.51 
 
 		 460 aa  117  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345739  normal  0.428465 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.15 
 
 		 697 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0499  NaH antiporter protein  27.76 
 
 		 389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0995  sodium/hydrogen exchanger  30.81 
 
 		 452 aa  115  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3809  sodium/hydrogen exchanger  32.98 
 
 		 413 aa  115  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.397158  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1474  sodium/hydrogen exchanger  29.06 
 
 		 703 aa  114  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00326365  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  27.52 
 
 		 671 aa  114  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  27.54 
 
 		 424 aa  114  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01670  potassium:hydrogen antiporter, putative  27.31 
 
 		 951 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  26.15 
 
 		 666 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4342  sodium/hydrogen exchanger  30.38 
 
 		 416 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.322852  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4159  sodium/hydrogen exchanger  29.4 
 
 		 446 aa  112  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50516  predicted protein  26.39 
 
 		 806 aa  112  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.23 
 
 		 427 aa  111  6e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  27.46 
 
 		 424 aa  111  6e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  26.4 
 
 		 665 aa  110  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3726  sodium/hydrogen exchanger  32.2 
 
 		 413 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3668  Sodium/hydrogen exchanger  33.59 
 
 		 415 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3445  sodium/hydrogen exchanger  29.02 
 
 		 427 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243488 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3558  sodium/hydrogen exchanger  29.01 
 
 		 455 aa  109  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  29.95 
 
 		 585 aa  109  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2667  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 		 435 aa  109  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3561  sodium/hydrogen exchanger  30.81 
 
 		 420 aa  108  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  26.84 
 
 		 667 aa  108  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6043  sodium/hydrogen exchanger  30.1 
 
 		 414 aa  108  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0261  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.98 
 
 		 588 aa  106  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  28.75 
 
 		 397 aa  107  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  26.32 
 
 		 587 aa  107  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6352  sodium/hydrogen exchanger  29.59 
 
 		 436 aa  106  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105497 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3029  Sodium/hydrogen exchanger  28.2 
 
 		 453 aa  106  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1130  sodium/hydrogen exchanger  26.2 
 
 		 586 aa  105  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.496723 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5813  sodium/hydrogen exchanger  29.61 
 
 		 414 aa  105  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  26.99 
 
 		 352 aa  105  3e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0716  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  25.93 
 
 		 617 aa  105  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.32849 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>