More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_5016 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2576  sodium/hydrogen exchanger  51.21 
 
 		 757 aa  736    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3333  sodium/hydrogen exchanger  54.34 
 
 		 747 aa  738    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.7052  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5016  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 745 aa  1495    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3551  sodium/hydrogen exchanger  55.12 
 
 		 741 aa  792    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.994377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  52.62 
 
 		 741 aa  757    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  44.35 
 
 		 586 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  44.13 
 
 		 586 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  44.13 
 
 		 586 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  44.03 
 
 		 585 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  44.1 
 
 		 585 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  45.54 
 
 		 587 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  46.94 
 
 		 586 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  42.65 
 
 		 587 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  46.45 
 
 		 587 aa  375  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  44.25 
 
 		 585 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  44.47 
 
 		 585 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  43.88 
 
 		 585 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1390  sodium/hydrogen exchanger  32.91 
 
 		 782 aa  361  3e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1130  sodium/hydrogen exchanger  46.27 
 
 		 586 aa  357  5.999999999999999e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.496723 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1614  sodium/hydrogen exchanger  40.32 
 
 		 710 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.051901  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1810  sodium/hydrogen exchanger  26.76 
 
 		 771 aa  257  4e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4597  sodium/hydrogen exchanger  27.87 
 
 		 777 aa  251  3e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4574  sodium/hydrogen exchanger  27.43 
 
 		 764 aa  249  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  31.85 
 
 		 671 aa  197  6e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0446  sodium/hydrogen exchanger  34.32 
 
 		 441 aa  192  2e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000379549 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  31.17 
 
 		 673 aa  188  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  32.92 
 
 		 773 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0323  sodium/hydrogen exchanger  32.52 
 
 		 606 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.569683 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0292  sodium/hydrogen exchanger  32.27 
 
 		 606 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  26.4 
 
 		 662 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  34.57 
 
 		 762 aa  184  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  32.76 
 
 		 771 aa  183  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1026  putative cation:proton antiport protein  31.98 
 
 		 562 aa  179  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  32.72 
 
 		 567 aa  178  3e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3733  potassium efflux system protein  31.71 
 
 		 575 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  32.46 
 
 		 567 aa  176  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1858  sodium/hydrogen exchanger  33.25 
 
 		 613 aa  175  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  32.45 
 
 		 775 aa  174  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.46 
 
 		 567 aa  173  7.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4368  potassium efflux system protein  34.09 
 
 		 583 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22742  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3140  potassium efflux system protein  30.82 
 
 		 566 aa  172  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1145  putative cation:proton antiport protein  30.7 
 
 		 563 aa  171  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176983  unclonable  0.0000000402209 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72800  putative potassium efflux transporter  31.51 
 
 		 567 aa  171  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  31.82 
 
 		 665 aa  170  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1076  sodium/hydrogen exchanger  31.82 
 
 		 665 aa  170  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0543  sodium/hydrogen exchanger  31.43 
 
 		 631 aa  170  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.015433 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  30.49 
 
 		 671 aa  169  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  28.37 
 
 		 667 aa  169  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  31.02 
 
 		 684 aa  168  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0258  sodium/hydrogen exchanger  30.27 
 
 		 573 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1853  sodium/hydrogen exchanger  28.68 
 
 		 688 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000204486  normal  0.40293 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6319  putative potassium efflux transporter  32.26 
 
 		 568 aa  168  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.168195  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0544  putative cation:proton antiport protein  34.01 
 
 		 558 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.890116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0538  putative cation:proton antiport protein  34.01 
 
 		 558 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0554  putative cation:proton antiport protein  34.01 
 
 		 558 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.556541  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0539  putative cation:proton antiport protein  34.01 
 
 		 558 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0599  putative cation:proton antiport protein  34.01 
 
 		 558 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.18338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2112  potassium efflux system protein  31.28 
 
 		 624 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0410  putative cation:proton antiport protein  32.13 
 
 		 558 aa  167  9e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1736  potassium efflux system protein  31.31 
 
 		 556 aa  167  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  30.46 
 
 		 666 aa  167  9e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00429  predicted transporter with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  33.42 
 
 		 558 aa  166  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3138  putative cation:proton antiport protein  33.42 
 
 		 558 aa  166  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000511667 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0522  putative cation:proton antiport protein  33.42 
 
 		 558 aa  166  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00434  hypothetical protein  33.42 
 
 		 558 aa  166  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0517  putative cation:proton antiport protein  33.42 
 
 		 558 aa  166  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0555  putative cation:proton antiport protein  33.42 
 
 		 558 aa  166  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0570  putative cation:proton antiport protein  33.42 
 
 		 558 aa  166  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.861339  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3132  potassium efflux system protein  33.42 
 
 		 558 aa  165  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1082  putative cation:proton antiport protein  30.71 
 
 		 561 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3229  putative cation:proton antiport protein  31.12 
 
 		 561 aa  164  6e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.177126  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0957  putative cation:proton antiport protein  34.01 
 
 		 558 aa  163  8.000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  30.75 
 
 		 652 aa  163  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3175  putative cation:proton antiport protein  32.32 
 
 		 563 aa  162  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.47283  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3034  putative cation:proton antiport protein  32.32 
 
 		 563 aa  162  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0496878  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  28.53 
 
 		 648 aa  162  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119547  potassium:hydrogen antiporter, putative  30.18 
 
 		 671 aa  162  3e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.2676  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  29.19 
 
 		 664 aa  161  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  30.49 
 
 		 674 aa  161  5e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  32.9 
 
 		 656 aa  160  6e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0261  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.51 
 
 		 588 aa  160  8e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0658  potassium efflux system protein  31.12 
 
 		 555 aa  160  9e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  28.21 
 
 		 741 aa  160  9e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  28.12 
 
 		 666 aa  159  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  29.08 
 
 		 665 aa  159  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  28.29 
 
 		 666 aa  160  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0455  potassium efflux system protein  34.81 
 
 		 541 aa  160  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3670  potassium efflux system protein  31.62 
 
 		 576 aa  159  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.663125  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1259  putative cation:proton antiport protein  32.32 
 
 		 562 aa  158  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00350207  hitchhiker  0.0000131586 
 
 
-
 
NC_004310  BR1325  potassium efflux system family protein  31.68 
 
 		 619 aa  158  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.113614  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1285  potassium efflux system family protein  31.68 
 
 		 619 aa  158  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433895  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  29.24 
 
 		 674 aa  158  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  30.89 
 
 		 650 aa  158  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  28.57 
 
 		 648 aa  157  8e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  28.57 
 
 		 648 aa  157  9e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3033  putative cation:proton antiport protein  31.44 
 
 		 561 aa  157  9e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  28.57 
 
 		 648 aa  157  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2033  sodium/hydrogen exchanger  31.28 
 
 		 565 aa  156  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  27.18 
 
 		 649 aa  156  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  28.42 
 
 		 648 aa  156  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>