More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0023 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 673 aa  1322    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  87.22 
 
 		 671 aa  1134    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  51.7 
 
 		 652 aa  626  1e-178  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  50.68 
 
 		 662 aa  581  1e-164  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  36.07 
 
 		 667 aa  386  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  36.94 
 
 		 775 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  34.04 
 
 		 666 aa  380  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  34.62 
 
 		 650 aa  376  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  35.81 
 
 		 762 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  34.59 
 
 		 674 aa  372  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  36.88 
 
 		 771 aa  369  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  35.7 
 
 		 773 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  38.46 
 
 		 567 aa  367  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  38.78 
 
 		 567 aa  365  2e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  38.6 
 
 		 567 aa  365  2e-99  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  33.49 
 
 		 666 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  35.16 
 
 		 684 aa  354  2.9999999999999997e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  34.5 
 
 		 674 aa  354  2.9999999999999997e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  34.56 
 
 		 665 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.02 
 
 		 697 aa  346  1e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  34.92 
 
 		 741 aa  346  1e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 666 aa  343  5e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  35.28 
 
 		 666 aa  342  1e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  30.95 
 
 		 672 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  35.67 
 
 		 670 aa  333  4e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  33.87 
 
 		 665 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1076  sodium/hydrogen exchanger  33.87 
 
 		 665 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  34.51 
 
 		 664 aa  327  4.0000000000000003e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  32 
 
 		 665 aa  325  1e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  32.7 
 
 		 658 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  36.33 
 
 		 693 aa  320  7e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  30.97 
 
 		 636 aa  316  9.999999999999999e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  30.24 
 
 		 671 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1132  hypothetical protein  35.77 
 
 		 564 aa  313  7.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  31.01 
 
 		 682 aa  312  1e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  32.42 
 
 		 656 aa  310  5e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  33.49 
 
 		 663 aa  306  7e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2149  sodium/hydrogen exchanger  37.73 
 
 		 567 aa  302  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1736  potassium efflux system protein  38.22 
 
 		 556 aa  302  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72800  putative potassium efflux transporter  36.51 
 
 		 567 aa  301  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3140  potassium efflux system protein  37.21 
 
 		 566 aa  300  5e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4813  sodium/hydrogen exchanger  36.42 
 
 		 666 aa  299  9e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3853  sodium/hydrogen exchanger  36.59 
 
 		 583 aa  299  1e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6319  putative potassium efflux transporter  36.16 
 
 		 568 aa  298  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.168195  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3064  Sodium/hydrogen exchanger  36.48 
 
 		 565 aa  297  4e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3733  potassium efflux system protein  38.48 
 
 		 575 aa  296  7e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1853  sodium/hydrogen exchanger  33.06 
 
 		 688 aa  295  2e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000204486  normal  0.40293 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0402  sodium/hydrogen exchanger  37.08 
 
 		 562 aa  292  1e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1345  cation:proton antiporter  36.73 
 
 		 572 aa  292  1e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.267602  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1281  sodium/hydrogen exchanger  36.73 
 
 		 572 aa  292  2e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.330977  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0292  sodium/hydrogen exchanger  36.01 
 
 		 606 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3229  putative cation:proton antiport protein  35.28 
 
 		 561 aa  290  8e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.177126  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0658  potassium efflux system protein  35.8 
 
 		 555 aa  290  8e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0955  sodium/hydrogen exchanger  34.3 
 
 		 672 aa  289  1e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00880864  normal  0.316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4976  potassium efflux system protein  38.15 
 
 		 607 aa  288  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2033  sodium/hydrogen exchanger  38.28 
 
 		 565 aa  288  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1082  putative cation:proton antiport protein  35.1 
 
 		 561 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2112  potassium efflux system protein  36.68 
 
 		 624 aa  287  4e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  33.85 
 
 		 668 aa  286  7e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1145  putative cation:proton antiport protein  35.47 
 
 		 563 aa  285  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176983  unclonable  0.0000000402209 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10490  potassium proton antiporter  38.63 
 
 		 564 aa  284  4.0000000000000003e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3434  sodium/hydrogen exchanger  35.84 
 
 		 577 aa  283  9e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  31.55 
 
 		 664 aa  281  2e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  32.81 
 
 		 650 aa  281  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3287  potassium efflux system protein  37.18 
 
 		 605 aa  281  3e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15318  normal  0.307272 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0323  sodium/hydrogen exchanger  34.34 
 
 		 606 aa  281  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.569683 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0261  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.04 
 
 		 588 aa  280  5e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3414  sodium/hydrogen exchanger  37.28 
 
 		 605 aa  280  6e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.399905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3094  sodium/hydrogen exchanger  37.28 
 
 		 605 aa  280  6e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  31.44 
 
 		 659 aa  279  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0988  sodium/hydrogen exchanger  28.7 
 
 		 676 aa  279  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  32.1 
 
 		 649 aa  278  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4947  potassium efflux system protein  38.59 
 
 		 607 aa  278  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0567  hypothetical protein  34.01 
 
 		 564 aa  277  4e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2469  putative efflux pump/antiporter  36.94 
 
 		 569 aa  277  5e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0878577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  32.09 
 
 		 648 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3034  putative cation:proton antiport protein  34.77 
 
 		 563 aa  274  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0496878  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1026  putative cation:proton antiport protein  34.38 
 
 		 562 aa  274  4.0000000000000004e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3563  putative potassium efflux transporter (ybaL)  35.51 
 
 		 585 aa  273  7e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1208  potassium efflux system protein  34.62 
 
 		 678 aa  273  8.000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  31.93 
 
 		 648 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  32.09 
 
 		 648 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3175  putative cation:proton antiport protein  34.77 
 
 		 563 aa  273  9e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.47283  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3169  TrkA-N:Sodium/hydrogen exchanger  35.33 
 
 		 567 aa  273  9e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0633  sodium/hydrogen exchanger  37 
 
 		 572 aa  272  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1156  TrkA-N:Sodium/hydrogen exchanger  35.86 
 
 		 595 aa  272  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.269314  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4379  sodium/hydrogen exchanger  36.63 
 
 		 571 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1858  sodium/hydrogen exchanger  32.83 
 
 		 613 aa  270  7e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0258  sodium/hydrogen exchanger  33.16 
 
 		 573 aa  268  2e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1259  putative cation:proton antiport protein  34.77 
 
 		 562 aa  268  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00350207  hitchhiker  0.0000131586 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0505  sodium/hydrogen exchanger  31.96 
 
 		 584 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4742  TrkA-N:Sodium/hydrogen exchanger  36.59 
 
 		 579 aa  267  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  31.73 
 
 		 648 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  32.09 
 
 		 648 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  33.12 
 
 		 649 aa  266  7e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01936  cation:proton antiporter  36.5 
 
 		 569 aa  266  8e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  31.31 
 
 		 649 aa  265  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1796  sodium/hydrogen exchanger  37.98 
 
 		 585 aa  265  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240603 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  30.72 
 
 		 674 aa  265  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  31.82 
 
 		 648 aa  265  3e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.488143 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>