More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2576 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3551  sodium/hydrogen exchanger  53.84 
 
 		 741 aa  795    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.994377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3333  sodium/hydrogen exchanger  52.46 
 
 		 747 aa  733    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.7052  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5016  sodium/hydrogen exchanger  51.21 
 
 		 745 aa  743    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  50.13 
 
 		 741 aa  729    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2576  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 757 aa  1526    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1390  sodium/hydrogen exchanger  35.58 
 
 		 782 aa  410  1e-113  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  42.32 
 
 		 587 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  43.64 
 
 		 585 aa  375  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  41.91 
 
 		 586 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  43.64 
 
 		 585 aa  372  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  46.29 
 
 		 585 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  41.49 
 
 		 586 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  41.49 
 
 		 586 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  41.49 
 
 		 586 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  41.49 
 
 		 587 aa  366  1e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1614  sodium/hydrogen exchanger  41.83 
 
 		 710 aa  362  1e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.051901  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  43.61 
 
 		 587 aa  361  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  42.57 
 
 		 585 aa  361  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  42.34 
 
 		 585 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1130  sodium/hydrogen exchanger  45.77 
 
 		 586 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.496723 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4597  sodium/hydrogen exchanger  31.22 
 
 		 777 aa  313  1e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1810  sodium/hydrogen exchanger  26.93 
 
 		 771 aa  278  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4574  sodium/hydrogen exchanger  26.19 
 
 		 764 aa  254  5.000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  34.2 
 
 		 762 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  34.03 
 
 		 671 aa  209  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  33.07 
 
 		 673 aa  206  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  33.42 
 
 		 773 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  25.7 
 
 		 771 aa  202  1.9999999999999998e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  35.41 
 
 		 652 aa  195  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  31.87 
 
 		 775 aa  195  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  32.8 
 
 		 567 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  32.8 
 
 		 567 aa  191  4e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0446  sodium/hydrogen exchanger  32.68 
 
 		 441 aa  191  5e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000379549 
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.29 
 
 		 567 aa  187  7e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  30.02 
 
 		 666 aa  186  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  28.97 
 
 		 667 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  33.51 
 
 		 662 aa  182  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  29.44 
 
 		 658 aa  179  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  33.41 
 
 		 684 aa  179  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  29.34 
 
 		 741 aa  179  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  28.87 
 
 		 674 aa  178  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1853  sodium/hydrogen exchanger  29.56 
 
 		 688 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000204486  normal  0.40293 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  29.12 
 
 		 666 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1076  sodium/hydrogen exchanger  32.29 
 
 		 665 aa  174  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  32.29 
 
 		 665 aa  174  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  31.03 
 
 		 650 aa  174  7.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  29.56 
 
 		 665 aa  172  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2112  potassium efflux system protein  32.9 
 
 		 624 aa  172  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  29.72 
 
 		 666 aa  171  5e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  29.46 
 
 		 666 aa  170  7e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  30.53 
 
 		 664 aa  170  9e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  31.18 
 
 		 670 aa  170  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119547  potassium:hydrogen antiporter, putative  30.73 
 
 		 671 aa  170  1e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.2676  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3733  potassium efflux system protein  31.27 
 
 		 575 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0543  sodium/hydrogen exchanger  32 
 
 		 631 aa  167  9e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.015433 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  29.66 
 
 		 682 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0323  sodium/hydrogen exchanger  31.02 
 
 		 606 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.569683 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  33.07 
 
 		 663 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  29.38 
 
 		 672 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2098  sodium/hydrogen exchanger  30.46 
 
 		 584 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  30 
 
 		 697 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0292  sodium/hydrogen exchanger  31.02 
 
 		 606 aa  165  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0258  sodium/hydrogen exchanger  27.54 
 
 		 573 aa  162  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  29.73 
 
 		 664 aa  162  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  27.96 
 
 		 671 aa  162  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3169  TrkA-N:Sodium/hydrogen exchanger  30.34 
 
 		 567 aa  161  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  29.48 
 
 		 674 aa  160  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0668  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  32.64 
 
 		 584 aa  160  7e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.457032  normal  0.0419012 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1026  putative cation:proton antiport protein  29.58 
 
 		 562 aa  160  8e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0917  sodium/hydrogen exchanger  30.79 
 
 		 585 aa  160  8e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10490  potassium proton antiporter  29.67 
 
 		 564 aa  160  9e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1858  sodium/hydrogen exchanger  28.81 
 
 		 613 aa  159  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  29.08 
 
 		 648 aa  159  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1736  potassium efflux system protein  31.88 
 
 		 556 aa  159  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72800  putative potassium efflux transporter  30.96 
 
 		 567 aa  159  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1645  sodium/hydrogen exchanger  30.31 
 
 		 586 aa  158  3e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3853  sodium/hydrogen exchanger  27.86 
 
 		 583 aa  158  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1132  hypothetical protein  27.77 
 
 		 564 aa  157  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1550  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  29.98 
 
 		 582 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00125081  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4368  potassium efflux system protein  30.77 
 
 		 583 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22742  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1156  TrkA-N:Sodium/hydrogen exchanger  30.64 
 
 		 595 aa  157  9e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.269314  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  30.56 
 
 		 656 aa  156  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2033  sodium/hydrogen exchanger  29.4 
 
 		 565 aa  155  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6319  putative potassium efflux transporter  30.96 
 
 		 568 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.168195  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0402  sodium/hydrogen exchanger  28.87 
 
 		 562 aa  155  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1593  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  29.26 
 
 		 655 aa  155  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1519  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.33 
 
 		 579 aa  154  5e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.49267  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  29.41 
 
 		 667 aa  154  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  29.74 
 
 		 665 aa  154  5e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  27.82 
 
 		 648 aa  154  7e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  25.85 
 
 		 668 aa  152  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1861  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.41 
 
 		 540 aa  152  3e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000013758  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3287  potassium efflux system protein  30.79 
 
 		 605 aa  152  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15318  normal  0.307272 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0814  sodium/hydrogen exchanger  31.6 
 
 		 577 aa  151  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0542248  normal  0.0778993 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  29.8 
 
 		 666 aa  152  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1345  cation:proton antiporter  28.42 
 
 		 572 aa  150  6e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.267602  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  27.93 
 
 		 659 aa  150  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3563  putative potassium efflux transporter (ybaL)  27.38 
 
 		 585 aa  150  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1281  sodium/hydrogen exchanger  28.42 
 
 		 572 aa  150  6e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.330977  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  30.23 
 
 		 667 aa  150  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>