More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0544 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00429  predicted transporter with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  94.78 
 
 
558 aa  1001    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3229  putative cation:proton antiport protein  79.82 
 
 
561 aa  884    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.177126  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6319  putative potassium efflux transporter  62.52 
 
 
568 aa  669    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.168195  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3132  potassium efflux system protein  94.6 
 
 
558 aa  999    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00434  hypothetical protein  94.78 
 
 
558 aa  1001    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0410  putative cation:proton antiport protein  94.6 
 
 
558 aa  1025    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3034  putative cation:proton antiport protein  79.74 
 
 
563 aa  878    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0496878  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0522  putative cation:proton antiport protein  94.6 
 
 
558 aa  999    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4112  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0554  putative cation:proton antiport protein  100 
 
 
558 aa  1093    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.556541  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0538  putative cation:proton antiport protein  100 
 
 
558 aa  1093    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1145  putative cation:proton antiport protein  81.2 
 
 
563 aa  901    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176983  unclonable  0.0000000402209 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0517  putative cation:proton antiport protein  94.96 
 
 
558 aa  1002    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0957  putative cation:proton antiport protein  91.73 
 
 
558 aa  969    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0555  putative cation:proton antiport protein  94.78 
 
 
558 aa  1001    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0570  putative cation:proton antiport protein  94.96 
 
 
558 aa  1002    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.861339  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1082  putative cation:proton antiport protein  80.18 
 
 
561 aa  885    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0544  putative cation:proton antiport protein  100 
 
 
558 aa  1093    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.890116  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3733  potassium efflux system protein  61.38 
 
 
575 aa  635    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1259  putative cation:proton antiport protein  79.56 
 
 
562 aa  870    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00350207  hitchhiker  0.0000131586 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0599  putative cation:proton antiport protein  100 
 
 
558 aa  1093    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.18338  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1736  potassium efflux system protein  62.03 
 
 
556 aa  650    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3033  putative cation:proton antiport protein  76.21 
 
 
561 aa  830    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3175  putative cation:proton antiport protein  79.74 
 
 
563 aa  877    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.47283  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72800  putative potassium efflux transporter  63.06 
 
 
567 aa  673    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0539  putative cation:proton antiport protein  100 
 
 
558 aa  1093    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1026  putative cation:proton antiport protein  77.19 
 
 
562 aa  846    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3138  putative cation:proton antiport protein  94.78 
 
 
558 aa  1001    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000511667 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3670  potassium efflux system protein  59.33 
 
 
576 aa  629  1e-179  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.663125  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3140  potassium efflux system protein  58.42 
 
 
566 aa  625  1e-178  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138229  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4368  potassium efflux system protein  60.62 
 
 
583 aa  618  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22742  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0658  potassium efflux system protein  59.41 
 
 
555 aa  608  1e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0292  sodium/hydrogen exchanger  56.65 
 
 
606 aa  605  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0323  sodium/hydrogen exchanger  56.6 
 
 
606 aa  600  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.569683 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1573  potassium efflux system protein  61.13 
 
 
574 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.566024  hitchhiker  0.00174372 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3563  putative potassium efflux transporter (ybaL)  56.91 
 
 
585 aa  585  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0455  potassium efflux system protein  58.91 
 
 
541 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269969  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1325  potassium efflux system family protein  56.54 
 
 
619 aa  573  1.0000000000000001e-162  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.113614  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1285  potassium efflux system family protein  56.54 
 
 
619 aa  573  1.0000000000000001e-162  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433895  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1859  potassium efflux system protein  56.51 
 
 
615 aa  569  1e-161  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1345  cation:proton antiporter  55.48 
 
 
572 aa  571  1e-161  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.267602  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01936  cation:proton antiporter  57.32 
 
 
569 aa  569  1e-161  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1208  potassium efflux system protein  55.88 
 
 
678 aa  568  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1858  sodium/hydrogen exchanger  50.5 
 
 
613 aa  565  1e-160  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1281  sodium/hydrogen exchanger  55.3 
 
 
572 aa  568  1e-160  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.330977  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4672  potassium efflux system protein  56.79 
 
 
549 aa  559  1e-158  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2112  potassium efflux system protein  54.45 
 
 
624 aa  545  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521521  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2469  putative efflux pump/antiporter  54.36 
 
 
569 aa  529  1e-149  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0878577  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0814  sodium/hydrogen exchanger  54.15 
 
 
577 aa  528  1e-148  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0542248  normal  0.0778993 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2149  sodium/hydrogen exchanger  53.76 
 
 
567 aa  527  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4976  potassium efflux system protein  56.37 
 
 
607 aa  522  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3287  potassium efflux system protein  53.86 
 
 
605 aa  524  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15318  normal  0.307272 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2033  sodium/hydrogen exchanger  54.15 
 
 
565 aa  524  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0402  sodium/hydrogen exchanger  51.09 
 
 
562 aa  522  1e-147  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3853  sodium/hydrogen exchanger  53.33 
 
 
583 aa  522  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3414  sodium/hydrogen exchanger  53.5 
 
 
605 aa  519  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.399905  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3094  sodium/hydrogen exchanger  53.5 
 
 
605 aa  519  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4947  potassium efflux system protein  57.55 
 
 
607 aa  520  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1156  TrkA-N:Sodium/hydrogen exchanger  52.33 
 
 
595 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.269314  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3064  Sodium/hydrogen exchanger  50.63 
 
 
565 aa  515  1e-144  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2285  sodium/hydrogen exchanger  66.5 
 
 
408 aa  513  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0100423  hitchhiker  0.000500098 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0633  sodium/hydrogen exchanger  53.89 
 
 
572 aa  495  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1132  hypothetical protein  49.09 
 
 
564 aa  496  1e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0567  hypothetical protein  50.72 
 
 
564 aa  494  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4742  TrkA-N:Sodium/hydrogen exchanger  53.87 
 
 
579 aa  495  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1796  sodium/hydrogen exchanger  53.58 
 
 
585 aa  487  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.240603 
 
 
-
 
NC_003296  RS03045  cation-efflux system transmembrane protein  67.09 
 
 
405 aa  485  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.21868  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10490  potassium proton antiporter  52.06 
 
 
564 aa  486  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3169  TrkA-N:Sodium/hydrogen exchanger  50.26 
 
 
567 aa  480  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4142  sodium/hydrogen exchanger  66.58 
 
 
405 aa  472  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807914  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1791  TrkA-N family protein  50.99 
 
 
572 aa  473  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345818  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4030  sodium/hydrogen exchanger  66.58 
 
 
405 aa  472  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4140  sodium/hydrogen exchanger  51.17 
 
 
571 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435228  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3648  sodium/hydrogen exchanger  50.99 
 
 
571 aa  472  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279447  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3291  sodium/hydrogen exchanger  51.17 
 
 
571 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.99669  normal  0.66857 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4226  sodium/hydrogen exchanger  51.17 
 
 
571 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.646549  normal  0.336088 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4122  sodium/hydrogen exchanger  50.63 
 
 
571 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.75928  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4379  sodium/hydrogen exchanger  50.27 
 
 
571 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1194  potassium efflux system protein, putative  50.71 
 
 
581 aa  450  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0077476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1723  transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  50.27 
 
 
580 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.254074  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1635  transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  50 
 
 
583 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1736  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1059  putative potassium efflux system protein  49.73 
 
 
577 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.414119  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1216  putative potassium efflux system protein  49.73 
 
 
577 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0754  sodium/hydrogen exchanger  45.19 
 
 
598 aa  436  1e-121  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835162  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0220  potassium-efflux system protein  50.09 
 
 
695 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.559394  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0369  putative potassium efflux system protein  49.56 
 
 
577 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0048  putative potassium efflux system protein  49.73 
 
 
689 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0261  sodium/hydrogen exchanger family protein  47.2 
 
 
588 aa  431  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3842  cyclic nucleotide-binding protein  57.92 
 
 
582 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306863  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0505  sodium/hydrogen exchanger  45.55 
 
 
584 aa  423  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0711  sodium/hydrogen exchanger  43.43 
 
 
581 aa  422  1e-117  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  45.24 
 
 
667 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3549  cyclic nucleotide-binding protein  55.86 
 
 
582 aa  411  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.864417 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  45.1 
 
 
684 aa  391  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0543  sodium/hydrogen exchanger  47.89 
 
 
631 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.015433 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  42.35 
 
 
674 aa  360  3e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2030  sodium/hydrogen exchanger family protein  43.06 
 
 
509 aa  345  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.203566  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2272  sodium/hydrogen exchanger  39.37 
 
 
578 aa  333  3e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.668389  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0258  sodium/hydrogen exchanger  34.07 
 
 
573 aa  296  9e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  34.52 
 
 
650 aa  283  8.000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  35.95 
 
 
652 aa  280  4e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.455645 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>