More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1081 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1081  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 386 aa  743    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2107  sodium/hydrogen exchanger  51.84 
 
 		 391 aa  328  9e-89  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1412  sodium/hydrogen exchanger  45.48 
 
 		 395 aa  263  4.999999999999999e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.179509 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1501  sodium/hydrogen exchanger  38.93 
 
 		 397 aa  233  5e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  29.92 
 
 		 416 aa  125  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  30.56 
 
 		 385 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.03 
 
 		 427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  28.76 
 
 		 424 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  28.76 
 
 		 424 aa  110  3e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  27.99 
 
 		 375 aa  110  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  28.34 
 
 		 375 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  26.97 
 
 		 396 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  27.12 
 
 		 375 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  27.12 
 
 		 375 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  27.12 
 
 		 375 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  27.12 
 
 		 375 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  27.12 
 
 		 375 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  27.12 
 
 		 375 aa  107  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  30.09 
 
 		 352 aa  104  3e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  27.55 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  24.34 
 
 		 404 aa  101  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  27.12 
 
 		 375 aa  101  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  27.12 
 
 		 375 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  27.12 
 
 		 375 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  26.17 
 
 		 387 aa  100  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  26.45 
 
 		 387 aa  99.4  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  24.87 
 
 		 389 aa  98.2  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  29.89 
 
 		 412 aa  97.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  25.9 
 
 		 423 aa  98.2  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  26.17 
 
 		 387 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  26.17 
 
 		 387 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  26.17 
 
 		 387 aa  97.1  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  26.17 
 
 		 387 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  26.17 
 
 		 387 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  25.9 
 
 		 387 aa  96.7  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  26.17 
 
 		 387 aa  96.3  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  26.17 
 
 		 387 aa  96.3  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  27.69 
 
 		 445 aa  96.3  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  25.75 
 
 		 398 aa  96.3  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  25.89 
 
 		 375 aa  95.9  9e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  26.93 
 
 		 399 aa  96.3  9e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  25.94 
 
 		 389 aa  95.1  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.02 
 
 		 418 aa  94.4  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  26.59 
 
 		 382 aa  91.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  28.22 
 
 		 400 aa  92  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0706  sodium/hydrogen exchanger  26.85 
 
 		 404 aa  91.7  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.584868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3668  Sodium/hydrogen exchanger  29.2 
 
 		 415 aa  89.7  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  27.34 
 
 		 395 aa  88.6  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  26.23 
 
 		 397 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3809  sodium/hydrogen exchanger  27.97 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.397158  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  25 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  26.24 
 
 		 386 aa  84.7  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1631  sodium/hydrogen exchanger  28.27 
 
 		 474 aa  82.8  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.599529 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  23.32 
 
 		 379 aa  82.8  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  25.96 
 
 		 748 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  27 
 
 		 767 aa  80.9  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  27.12 
 
 		 482 aa  80.9  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1868  sodium/hydrogen exchanger  26.3 
 
 		 469 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  26.67 
 
 		 467 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0868  hypothetical protein  24.85 
 
 		 479 aa  80.1  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0839  hypothetical protein  26.36 
 
 		 479 aa  80.1  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  26.67 
 
 		 467 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2594  sodium/hydrogen exchanger  27.06 
 
 		 491 aa  79.7  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0446  sodium/hydrogen exchanger  26.94 
 
 		 441 aa  79  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000379549 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5016  sodium/hydrogen exchanger  23.82 
 
 		 745 aa  79  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0454  Na+/H+ antiporter  25.26 
 
 		 701 aa  78.2  0.0000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.809076  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3726  sodium/hydrogen exchanger  27.11 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3333  sodium/hydrogen exchanger  26.49 
 
 		 747 aa  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.7052  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.01 
 
 		 587 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  24.86 
 
 		 585 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.78 
 
 		 587 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  25.42 
 
 		 585 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  25.76 
 
 		 756 aa  77  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3029  Sodium/hydrogen exchanger  25.79 
 
 		 453 aa  77  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3828  sodium/hydrogen exchanger  27.05 
 
 		 715 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3878  sodium/hydrogen exchanger  26.8 
 
 		 715 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.267583  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  22.13 
 
 		 586 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  22.91 
 
 		 587 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  22.13 
 
 		 586 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  22.13 
 
 		 586 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  25.84 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4724  sodium/hydrogen exchanger  27.4 
 
 		 473 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  21.57 
 
 		 586 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2302  sodium/hydrogen exchanger  24.69 
 
 		 423 aa  72.8  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113166  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1464  Sodium/hydrogen exchanger  28.53 
 
 		 485 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000329156  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  26.15 
 
 		 460 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  25.82 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0974  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.91 
 
 		 543 aa  72  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.705651  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  26.58 
 
 		 764 aa  70.9  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  24.01 
 
 		 585 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0546  Na+/H+ antiporter  27.23 
 
 		 715 aa  68.2  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1792  sodium/hydrogen exchanger  25.48 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.906777  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3558  sodium/hydrogen exchanger  24.46 
 
 		 455 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0325  sodium/hydrogen exchanger  26.96 
 
 		 398 aa  67.8  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0935  sodium/hydrogen exchanger  25.9 
 
 		 448 aa  67.8  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0791  Na+/H+ antiporter, putative  25.9 
 
 		 448 aa  67.8  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  24.18 
 
 		 741 aa  67.8  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  24.44 
 
 		 388 aa  67  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  25.27 
 
 		 388 aa  67  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  26.44 
 
 		 749 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>