More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1461 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
636 aa  1274    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  51.9 
 
 
674 aa  685    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  48.51 
 
 
671 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  47.5 
 
 
741 aa  588  1e-167  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  47.71 
 
 
666 aa  579  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  47.23 
 
 
663 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  45.74 
 
 
665 aa  571  1e-161  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  46.12 
 
 
697 aa  566  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  45.96 
 
 
672 aa  556  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  47.78 
 
 
666 aa  554  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  46.04 
 
 
665 aa  548  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  44.22 
 
 
658 aa  529  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  44.32 
 
 
666 aa  525  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  43.65 
 
 
656 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  44.21 
 
 
664 aa  494  9.999999999999999e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0988  sodium/hydrogen exchanger  41.96 
 
 
676 aa  489  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0955  sodium/hydrogen exchanger  44.69 
 
 
672 aa  487  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00880864  normal  0.316 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1853  sodium/hydrogen exchanger  40.6 
 
 
688 aa  484  1e-135  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000204486  normal  0.40293 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  41.9 
 
 
666 aa  475  1e-133  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  38.8 
 
 
682 aa  463  1e-129  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  39.75 
 
 
670 aa  458  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  39.15 
 
 
664 aa  451  1e-125  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  39.53 
 
 
668 aa  432  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3434  sodium/hydrogen exchanger  43.66 
 
 
577 aa  400  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106813  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1271  sodium/hydrogen exchanger  50.59 
 
 
457 aa  386  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  36.28 
 
 
693 aa  382  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0917  sodium/hydrogen exchanger  39.35 
 
 
585 aa  370  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1645  sodium/hydrogen exchanger  38.7 
 
 
586 aa  362  1e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0668  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  38.15 
 
 
584 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.457032  normal  0.0419012 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  34.27 
 
 
649 aa  355  2e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  35.64 
 
 
649 aa  353  4e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  35.07 
 
 
773 aa  350  4e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  34.47 
 
 
648 aa  350  7e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2098  sodium/hydrogen exchanger  37.97 
 
 
584 aa  348  1e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  33.44 
 
 
650 aa  347  3e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  33.59 
 
 
648 aa  347  4e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  34.38 
 
 
648 aa  347  4e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  34.38 
 
 
648 aa  347  4e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000490638 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5710  sodium/hydrogen exchanger  36.28 
 
 
679 aa  347  4e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  33.85 
 
 
657 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  33.49 
 
 
648 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  33.33 
 
 
648 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  33.49 
 
 
648 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  34.51 
 
 
567 aa  340  4e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  33.81 
 
 
775 aa  340  5.9999999999999996e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1550  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  38.53 
 
 
582 aa  335  2e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00125081  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  33.49 
 
 
648 aa  334  3e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  33.58 
 
 
567 aa  332  1e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  34.7 
 
 
648 aa  331  2e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.58 
 
 
567 aa  330  5.0000000000000004e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  33.85 
 
 
649 aa  329  7e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  32.71 
 
 
720 aa  329  8e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  34.43 
 
 
649 aa  329  8e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  32.6 
 
 
771 aa  328  2.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  33.39 
 
 
762 aa  327  3e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  31.07 
 
 
662 aa  322  9.999999999999999e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  34.33 
 
 
653 aa  318  2e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  31.14 
 
 
671 aa  317  3e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1076  sodium/hydrogen exchanger  33.44 
 
 
665 aa  317  4e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  33.44 
 
 
665 aa  317  4e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  30.97 
 
 
673 aa  316  9.999999999999999e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  31.85 
 
 
661 aa  314  2.9999999999999996e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  31.85 
 
 
661 aa  314  2.9999999999999996e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000235169 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3417  potassium efflux system protein  32.48 
 
 
652 aa  306  7e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00166015  normal  0.19535 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  32.28 
 
 
654 aa  303  6.000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  31.07 
 
 
662 aa  301  2e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1976  sodium/hydrogen exchanger  29.84 
 
 
666 aa  298  2e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  31.22 
 
 
650 aa  297  3e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  31 
 
 
652 aa  297  5e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3810  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.68 
 
 
680 aa  295  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.162531 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  31.92 
 
 
674 aa  295  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1593  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  33.23 
 
 
655 aa  294  3e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  31.11 
 
 
659 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2194  potassium efflux system protein  35.57 
 
 
574 aa  286  8e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  28.08 
 
 
667 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  31.86 
 
 
660 aa  283  5.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5295  sodium/hydrogen exchanger  31.62 
 
 
661 aa  281  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  32.39 
 
 
668 aa  281  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4133  potassium efflux system protein  32.38 
 
 
661 aa  279  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.477795 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  28.16 
 
 
684 aa  278  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0155  sodium/hydrogen exchanger  32.27 
 
 
661 aa  278  3e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0261  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.64 
 
 
588 aa  277  4e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  28.13 
 
 
674 aa  277  4e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  31.86 
 
 
663 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2796  sodium/hydrogen exchanger  32.24 
 
 
668 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0879164 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2171  sodium/hydrogen exchanger  32.24 
 
 
668 aa  275  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2785  sodium/hydrogen exchanger  32.24 
 
 
668 aa  275  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0657605  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  31.75 
 
 
669 aa  274  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  31.75 
 
 
669 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1520  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  31.75 
 
 
669 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418182  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  31.75 
 
 
669 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0258  sodium/hydrogen exchanger  29.44 
 
 
573 aa  273  8.000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  31.75 
 
 
669 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  31.75 
 
 
669 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  31.75 
 
 
663 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  30.39 
 
 
666 aa  272  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  32.2 
 
 
678 aa  271  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0505  sodium/hydrogen exchanger  30.44 
 
 
584 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0880  sodium/hydrogen exchanger  32.08 
 
 
655 aa  270  4e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.19448  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  29.91 
 
 
667 aa  270  7e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>