More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0307 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0307  Na+/H+ antiporter  100 
 
 		 408 aa  788    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1707  sodium/hydrogen exchanger  49.23 
 
 		 698 aa  352  8e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1732  sodium/hydrogen exchanger  48.72 
 
 		 698 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4722  sodium/hydrogen exchanger  49.22 
 
 		 692 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4587  Sodium/hydrogen exchanger  44.84 
 
 		 712 aa  317  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2626  sodium/hydrogen exchanger  42.67 
 
 		 722 aa  274  2.0000000000000002e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1401  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  39.8 
 
 		 699 aa  223  4.9999999999999996e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.972731  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4481  sodium/hydrogen exchanger  36.25 
 
 		 679 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1642  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  39.95 
 
 		 699 aa  216  5.9999999999999996e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1978  sodium/hydrogen exchanger  34.08 
 
 		 709 aa  208  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0979  sodium/hydrogen exchanger  35.78 
 
 		 688 aa  207  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6580  sodium/hydrogen exchanger  31.87 
 
 		 719 aa  205  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.070036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1869  sodium/hydrogen exchanger  36.32 
 
 		 689 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4708  sodium/hydrogen exchanger  34.52 
 
 		 715 aa  201  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3545  Sodium/hydrogen exchanger  34.56 
 
 		 681 aa  200  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1862  sodium/hydrogen exchanger  34 
 
 		 751 aa  199  6e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1258  sodium/hydrogen exchanger  33.17 
 
 		 721 aa  196  6e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105109  normal  0.138872 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1205  Na+/H+ anti-porter  33.98 
 
 		 716 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1103  sodium/hydrogen exchanger  33.25 
 
 		 716 aa  181  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.554768  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3830  sodium/hydrogen exchanger  33.98 
 
 		 706 aa  176  7e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.417332  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1475  putative Na+/H+ antiporter  33.5 
 
 		 727 aa  176  9.999999999999999e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1681  sodium/hydrogen exchanger  31.16 
 
 		 732 aa  172  7.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3051  sodium/hydrogen exchanger  32.66 
 
 		 686 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2201  sodium/hydrogen exchanger  32.29 
 
 		 708 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0038  sodium/hydrogen exchanger  32.34 
 
 		 692 aa  140  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  26.63 
 
 		 386 aa  117  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  30 
 
 		 389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  26.42 
 
 		 387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  26.32 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  26.06 
 
 		 387 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  25.88 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  25.88 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  26.15 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  26.15 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  25.88 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  26.33 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  26.15 
 
 		 387 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  25.88 
 
 		 385 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  25.88 
 
 		 387 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0743  sodium/hydrogen exchanger  24.23 
 
 		 395 aa  106  7e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.286808  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  27.42 
 
 		 375 aa  105  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  25.79 
 
 		 389 aa  103  7e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  32.01 
 
 		 667 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  26.39 
 
 		 375 aa  99  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  26.39 
 
 		 375 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  26.39 
 
 		 375 aa  97.8  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  26.39 
 
 		 375 aa  97.8  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  26.39 
 
 		 375 aa  97.8  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  26.39 
 
 		 375 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  26.39 
 
 		 375 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  25.63 
 
 		 375 aa  97.4  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  31.95 
 
 		 412 aa  96.3  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0867  sodium/hydrogen exchanger  28.32 
 
 		 530 aa  96.3  8e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.638156  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  25.14 
 
 		 352 aa  94.4  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0614  sodium/hydrogen exchanger  27.16 
 
 		 609 aa  94  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0733  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  26.13 
 
 		 609 aa  94  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  27.94 
 
 		 667 aa  93.6  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  27.57 
 
 		 399 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0826  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  26.87 
 
 		 609 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381657  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  27.94 
 
 		 666 aa  92  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  28.24 
 
 		 445 aa  91.3  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0296  sodium/hydrogen exchanger  32.24 
 
 		 659 aa  91.3  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  23.59 
 
 		 396 aa  91.3  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4604  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  25.88 
 
 		 609 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0665  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.88 
 
 		 609 aa  90.5  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0609  Na+/H+ antiporter  25.88 
 
 		 609 aa  90.5  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0610  Na+/H+ antiporter  25.88 
 
 		 609 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0699  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.88 
 
 		 609 aa  90.5  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0754  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  25.88 
 
 		 609 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133818 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0768  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.41 
 
 		 609 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  30.96 
 
 		 668 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  31.08 
 
 		 674 aa  89  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  27.69 
 
 		 767 aa  88.2  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  28.54 
 
 		 678 aa  88.6  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  26.39 
 
 		 375 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  26.39 
 
 		 375 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  30.82 
 
 		 659 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  26.39 
 
 		 375 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  27.09 
 
 		 400 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2295  sodium/hydrogen exchanger  28.69 
 
 		 386 aa  87.8  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.784703 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  30 
 
 		 663 aa  87  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  29.27 
 
 		 649 aa  86.7  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  27.78 
 
 		 395 aa  86.7  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  30.11 
 
 		 669 aa  86.3  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.11 
 
 		 669 aa  86.3  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.11 
 
 		 669 aa  86.3  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1520  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.11 
 
 		 669 aa  86.3  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418182  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.11 
 
 		 669 aa  86.3  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.1 
 
 		 418 aa  86.3  9e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  29.07 
 
 		 648 aa  86.3  9e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.11 
 
 		 669 aa  86.3  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0414  putative glutathione-regulated potassium-efflux system K+/H+ antiporter transmembrane protein  31.4 
 
 		 659 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  30.34 
 
 		 663 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0269  sodium/hydrogen exchanger  31.72 
 
 		 659 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0587  sodium/hydrogen exchanger  24.62 
 
 		 609 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.013374  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1027  sodium/hydrogen exchanger  24.32 
 
 		 614 aa  83.6  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000401836  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  27.46 
 
 		 404 aa  84  0.000000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1008  sodium/hydrogen exchanger  24.32 
 
 		 614 aa  83.6  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000272114  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0590  Na+/H+ exchanger family protein, putative  25 
 
 		 614 aa  83.6  0.000000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104046  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  23.5 
 
 		 399 aa  83.2  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.278715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>