More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1475 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1681  sodium/hydrogen exchanger  61.4 
 
 
732 aa  847    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1862  sodium/hydrogen exchanger  66.33 
 
 
751 aa  917    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1258  sodium/hydrogen exchanger  46.51 
 
 
721 aa  639    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105109  normal  0.138872 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1475  putative Na+/H+ antiporter  100 
 
 
727 aa  1446    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1205  Na+/H+ anti-porter  53.99 
 
 
716 aa  719    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1103  sodium/hydrogen exchanger  63.6 
 
 
716 aa  903    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.554768  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3830  sodium/hydrogen exchanger  43.91 
 
 
706 aa  561  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.417332  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2201  sodium/hydrogen exchanger  44.1 
 
 
708 aa  553  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260378  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6580  sodium/hydrogen exchanger  40.38 
 
 
719 aa  535  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.070036  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4708  sodium/hydrogen exchanger  37.85 
 
 
715 aa  496  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1978  sodium/hydrogen exchanger  34.15 
 
 
709 aa  375  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0979  sodium/hydrogen exchanger  34.54 
 
 
688 aa  355  2e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4481  sodium/hydrogen exchanger  37.44 
 
 
679 aa  348  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1869  sodium/hydrogen exchanger  34.55 
 
 
689 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3545  Sodium/hydrogen exchanger  35.88 
 
 
681 aa  306  9.000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3051  sodium/hydrogen exchanger  30.87 
 
 
686 aa  303  8.000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0038  sodium/hydrogen exchanger  31.63 
 
 
692 aa  281  3e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1707  sodium/hydrogen exchanger  30.69 
 
 
698 aa  253  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1732  sodium/hydrogen exchanger  30.52 
 
 
698 aa  250  8e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4587  Sodium/hydrogen exchanger  29.47 
 
 
712 aa  249  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4722  sodium/hydrogen exchanger  32.89 
 
 
692 aa  239  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2626  sodium/hydrogen exchanger  29.37 
 
 
722 aa  231  4e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1642  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  30.35 
 
 
699 aa  181  2.9999999999999997e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1401  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  30.38 
 
 
699 aa  174  3.9999999999999995e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.972731  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0307  Na+/H+ antiporter  32.13 
 
 
408 aa  159  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0733  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  25.13 
 
 
609 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4604  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  25.71 
 
 
609 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0826  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  26.38 
 
 
609 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381657  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0614  sodium/hydrogen exchanger  25.76 
 
 
609 aa  115  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0665  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.98 
 
 
609 aa  114  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0609  Na+/H+ antiporter  25.98 
 
 
609 aa  114  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0610  Na+/H+ antiporter  25.98 
 
 
609 aa  114  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0754  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  25.98 
 
 
609 aa  114  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133818 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0699  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.98 
 
 
609 aa  114  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0743  sodium/hydrogen exchanger  29.41 
 
 
395 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.286808  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0587  sodium/hydrogen exchanger  26.24 
 
 
609 aa  112  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.013374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0768  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.92 
 
 
609 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  28.7 
 
 
386 aa  108  5e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0867  sodium/hydrogen exchanger  25.78 
 
 
530 aa  91.7  5e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.638156  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1963  sodium/hydrogen exchanger  29.37 
 
 
611 aa  90.1  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000117586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1027  sodium/hydrogen exchanger  26.74 
 
 
614 aa  85.9  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000401836  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  26.21 
 
 
387 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1008  sodium/hydrogen exchanger  26.74 
 
 
614 aa  85.9  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000272114  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  25.89 
 
 
387 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  25.57 
 
 
387 aa  84.7  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  25.48 
 
 
387 aa  84.3  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  25.48 
 
 
387 aa  84.3  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  25.57 
 
 
387 aa  84.3  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1020  sodium/hydrogen exchanger  24.35 
 
 
389 aa  84  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.259417  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  25.48 
 
 
387 aa  84  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  25.48 
 
 
387 aa  84  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  24.33 
 
 
396 aa  83.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  26.15 
 
 
387 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  26.15 
 
 
387 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  24.55 
 
 
379 aa  82.8  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0590  Na+/H+ exchanger family protein, putative  24.78 
 
 
614 aa  81.6  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104046  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0306  sodium/hydrogen exchanger  23.82 
 
 
389 aa  81.3  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  26.32 
 
 
385 aa  80.9  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  26.5 
 
 
416 aa  79.3  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1608  sodium/hydrogen exchanger  24.41 
 
 
387 aa  79  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0247605  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  25.77 
 
 
586 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0162  Kef-type K+ transport system, membrane component  24.75 
 
 
608 aa  75.9  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000463033  unclonable  1.19367e-27 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  24.57 
 
 
375 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  25.76 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  25.76 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  25.76 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  25.76 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  25.76 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  25.15 
 
 
586 aa  75.1  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  25.76 
 
 
375 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  25.46 
 
 
586 aa  74.3  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.55 
 
 
587 aa  73.9  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  25.15 
 
 
586 aa  73.9  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  25.31 
 
 
399 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  21.94 
 
 
756 aa  73.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  24.44 
 
 
389 aa  73.2  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  31.7 
 
 
388 aa  73.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  27.27 
 
 
389 aa  73.2  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  24.23 
 
 
375 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1067  sodium/hydrogen exchanger  23.48 
 
 
609 aa  72  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000397977  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1282  sodium/hydrogen exchanger  22.5 
 
 
406 aa  71.6  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  29.27 
 
 
388 aa  70.9  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1792  sodium/hydrogen exchanger  31.05 
 
 
388 aa  69.3  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.906777  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  22.36 
 
 
404 aa  69.3  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  23.91 
 
 
445 aa  68.9  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  21.49 
 
 
764 aa  68.9  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  24.74 
 
 
567 aa  67.8  0.0000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.66 
 
 
587 aa  68.2  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1177  sodium/hydrogen exchanger  24.55 
 
 
392 aa  67.8  0.0000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1519  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.12 
 
 
579 aa  67.8  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.49267  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  27.94 
 
 
585 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2576  sodium/hydrogen exchanger  27.27 
 
 
757 aa  66.6  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3653  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  24.76 
 
 
601 aa  67  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155191  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  25.44 
 
 
567 aa  67.4  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  27.55 
 
 
662 aa  66.6  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  23.53 
 
 
636 aa  67  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  24.19 
 
 
390 aa  67  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  25.87 
 
 
375 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3762  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  24.44 
 
 
601 aa  66.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.581986  normal  0.282948 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  28.38 
 
 
585 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>