More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1368 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  100 
 
 
662 aa  1330    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  38.93 
 
 
657 aa  496  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  41.4 
 
 
667 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  40.56 
 
 
668 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  40.85 
 
 
649 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  41.45 
 
 
661 aa  489  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2796  sodium/hydrogen exchanger  40.83 
 
 
668 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0879164 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  39.12 
 
 
649 aa  491  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2171  sodium/hydrogen exchanger  40.83 
 
 
668 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2785  sodium/hydrogen exchanger  40.83 
 
 
668 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0657605  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  41.45 
 
 
661 aa  489  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000235169 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  40.56 
 
 
678 aa  486  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  40.4 
 
 
663 aa  486  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  40 
 
 
649 aa  486  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  39.3 
 
 
720 aa  485  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  39.42 
 
 
659 aa  484  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  40.06 
 
 
663 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  40.37 
 
 
669 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  40.79 
 
 
666 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  40.25 
 
 
669 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  40.18 
 
 
667 aa  481  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  40.25 
 
 
669 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1520  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  40.25 
 
 
669 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418182  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1976  sodium/hydrogen exchanger  39.45 
 
 
666 aa  479  1e-134  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  38.78 
 
 
674 aa  479  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  40.25 
 
 
669 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  40.25 
 
 
669 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  40 
 
 
648 aa  480  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  40.15 
 
 
648 aa  476  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  40.85 
 
 
653 aa  477  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  39.66 
 
 
660 aa  472  1e-132  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  36.82 
 
 
650 aa  473  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2845  sodium/hydrogen exchanger  39.47 
 
 
670 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0613147  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2703  sodium/hydrogen exchanger  39.63 
 
 
670 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  39.33 
 
 
649 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  41.4 
 
 
658 aa  467  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  39.85 
 
 
648 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  39.85 
 
 
648 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000490638 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  40.79 
 
 
648 aa  464  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  38.02 
 
 
648 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3810  sodium/hydrogen exchanger family protein  39.06 
 
 
680 aa  462  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.162531 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3417  potassium efflux system protein  38.78 
 
 
652 aa  458  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00166015  normal  0.19535 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  37.71 
 
 
648 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4238  sodium/hydrogen exchanger  38.16 
 
 
656 aa  458  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  37.86 
 
 
648 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  39.24 
 
 
660 aa  457  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5295  sodium/hydrogen exchanger  38.69 
 
 
661 aa  454  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  37.86 
 
 
648 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0181  sodium/hydrogen exchanger  38.73 
 
 
665 aa  451  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1593  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  40.52 
 
 
655 aa  447  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0296  sodium/hydrogen exchanger  38.72 
 
 
659 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  38.22 
 
 
654 aa  442  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1760  sodium/hydrogen exchanger family protein  38.56 
 
 
654 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303253  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0414  putative glutathione-regulated potassium-efflux system K+/H+ antiporter transmembrane protein  38.22 
 
 
659 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4900  potassium efflux system protein  37.63 
 
 
664 aa  440  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0269  sodium/hydrogen exchanger  38.37 
 
 
659 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0155  sodium/hydrogen exchanger  36.46 
 
 
661 aa  436  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4133  potassium efflux system protein  38.43 
 
 
661 aa  437  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.477795 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4786  potassium efflux system protein  38.44 
 
 
661 aa  426  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4109  sodium/hydrogen exchanger  37.36 
 
 
661 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.324646  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0880  sodium/hydrogen exchanger  38.03 
 
 
655 aa  414  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.19448  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3491  potassium efflux system protein  38.58 
 
 
661 aa  414  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1519  sodium/hydrogen exchanger family protein  40.78 
 
 
579 aa  394  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.49267  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3967  Sodium/hydrogen exchanger  41.37 
 
 
570 aa  379  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2952  Sodium/hydrogen exchanger, TrkA-N  37.86 
 
 
568 aa  357  3.9999999999999996e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1249  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  34.93 
 
 
572 aa  342  2e-92  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2194  potassium efflux system protein  36.69 
 
 
574 aa  341  2.9999999999999998e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1457  K+ efflux antiporter, putative (KEA1)  36.3 
 
 
583 aa  340  2.9999999999999998e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  32.72 
 
 
666 aa  340  4e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0885  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  37.18 
 
 
578 aa  340  4e-92  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  29.76 
 
 
671 aa  340  5.9999999999999996e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0802  sodium/hydrogen exchanger  34.79 
 
 
583 aa  337  5e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0095  TrkA-N  35.83 
 
 
569 aa  333  4e-90  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0146  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.22 
 
 
568 aa  332  1e-89  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1943  sodium/hydrogen exchanger  33.88 
 
 
629 aa  332  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409828  normal  0.0242024 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11843  predicted protein  37.95 
 
 
533 aa  330  6e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  31.07 
 
 
636 aa  330  7e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1067  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  37.08 
 
 
541 aa  322  9.999999999999999e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000268693  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.28 
 
 
697 aa  319  9e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  31.94 
 
 
666 aa  319  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0254  sodium/hydrogen exchanger  34.12 
 
 
595 aa  319  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.711555  normal  0.0321516 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  29.12 
 
 
665 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1380  sodium/hydrogen exchanger  37.42 
 
 
540 aa  315  2.9999999999999996e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.034971  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  31.13 
 
 
672 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4634  sodium/hydrogen exchanger  34.36 
 
 
630 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0136405 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2011  potassium efflux system protein  35.5 
 
 
628 aa  311  2e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.425988  normal  0.0999325 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  30.11 
 
 
658 aa  311  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5097  sodium/hydrogen exchanger  34 
 
 
630 aa  311  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1729  glutathione-regulated K+ efflux antiporter  35.6 
 
 
628 aa  311  2.9999999999999997e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.282335  normal  0.367731 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  27.36 
 
 
674 aa  310  6.999999999999999e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1861  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.11 
 
 
540 aa  307  5.0000000000000004e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000013758  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5461  sodium/hydrogen exchanger  34.73 
 
 
597 aa  307  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0395  potassium efflux system protein  35.13 
 
 
577 aa  305  1.0000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0377  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  31.52 
 
 
602 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5173  sodium/hydrogen exchanger  34.18 
 
 
632 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1866  hypothetical protein  32 
 
 
601 aa  305  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  29.66 
 
 
682 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1861  hypothetical protein  32 
 
 
601 aa  304  3.0000000000000004e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  31.11 
 
 
663 aa  302  1e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  31.31 
 
 
656 aa  302  1e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.230483 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>