More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1258 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1258  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 721 aa  1448    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105109  normal  0.138872 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1862  sodium/hydrogen exchanger  48.34 
 
 		 751 aa  652    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1103  sodium/hydrogen exchanger  46.67 
 
 		 716 aa  627  1e-178  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.554768  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1475  putative Na+/H+ antiporter  46.37 
 
 		 727 aa  615  9.999999999999999e-175  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6580  sodium/hydrogen exchanger  43.53 
 
 		 719 aa  613  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.070036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1681  sodium/hydrogen exchanger  45.76 
 
 		 732 aa  611  1e-173  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1205  Na+/H+ anti-porter  42.56 
 
 		 716 aa  587  1e-166  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2201  sodium/hydrogen exchanger  46.87 
 
 		 708 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3830  sodium/hydrogen exchanger  44.69 
 
 		 706 aa  556  1e-157  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.417332  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4708  sodium/hydrogen exchanger  44.97 
 
 		 715 aa  545  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1978  sodium/hydrogen exchanger  35.36 
 
 		 709 aa  417  9.999999999999999e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0979  sodium/hydrogen exchanger  35.29 
 
 		 688 aa  403  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4481  sodium/hydrogen exchanger  34.65 
 
 		 679 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1869  sodium/hydrogen exchanger  35.78 
 
 		 689 aa  362  1e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3545  Sodium/hydrogen exchanger  38.93 
 
 		 681 aa  347  6e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3051  sodium/hydrogen exchanger  32.11 
 
 		 686 aa  342  1e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0038  sodium/hydrogen exchanger  31.02 
 
 		 692 aa  306  9.000000000000001e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4587  Sodium/hydrogen exchanger  29.65 
 
 		 712 aa  249  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2626  sodium/hydrogen exchanger  27.72 
 
 		 722 aa  240  6.999999999999999e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1707  sodium/hydrogen exchanger  27.9 
 
 		 698 aa  239  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4722  sodium/hydrogen exchanger  34.24 
 
 		 692 aa  236  8e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1732  sodium/hydrogen exchanger  27.61 
 
 		 698 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1642  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  30.24 
 
 		 699 aa  186  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0307  Na+/H+ antiporter  35.09 
 
 		 408 aa  169  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1401  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  27.15 
 
 		 699 aa  163  8.000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.972731  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  27.97 
 
 		 386 aa  120  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0743  sodium/hydrogen exchanger  29.27 
 
 		 395 aa  103  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.286808  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0590  Na+/H+ exchanger family protein, putative  26.11 
 
 		 614 aa  99.4  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104046  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  28.82 
 
 		 379 aa  99.4  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0587  sodium/hydrogen exchanger  25.13 
 
 		 609 aa  98.6  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.013374  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0733  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  23.93 
 
 		 609 aa  99  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1008  sodium/hydrogen exchanger  25.61 
 
 		 614 aa  98.6  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000272114  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1027  sodium/hydrogen exchanger  25.61 
 
 		 614 aa  98.6  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000401836  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0826  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  23.91 
 
 		 609 aa  97.8  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381657  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0665  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.46 
 
 		 609 aa  96.7  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0609  Na+/H+ antiporter  23.46 
 
 		 609 aa  96.7  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0610  Na+/H+ antiporter  23.46 
 
 		 609 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0699  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.46 
 
 		 609 aa  96.7  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0754  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  23.46 
 
 		 609 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133818 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4604  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  23.66 
 
 		 609 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0614  sodium/hydrogen exchanger  23.43 
 
 		 609 aa  96.3  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  25.44 
 
 		 396 aa  94  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1608  sodium/hydrogen exchanger  34 
 
 		 387 aa  93.6  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0247605  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0768  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.66 
 
 		 609 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  21.89 
 
 		 756 aa  92  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0306  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 389 aa  91.7  4e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  27.65 
 
 		 416 aa  92  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.78 
 
 		 399 aa  90.9  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  26.42 
 
 		 389 aa  90.9  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1020  sodium/hydrogen exchanger  32.67 
 
 		 389 aa  90.5  9e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.259417  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  25.47 
 
 		 389 aa  89.7  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  29.29 
 
 		 674 aa  89  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1963  sodium/hydrogen exchanger  25.18 
 
 		 611 aa  89  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000117586  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  25.07 
 
 		 445 aa  87.4  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  28.42 
 
 		 375 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  23.87 
 
 		 671 aa  85.9  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0162  Kef-type K+ transport system, membrane component  27.48 
 
 		 608 aa  85.1  0.000000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000463033  unclonable  1.19367e-27 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  24.93 
 
 		 482 aa  84.3  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  25.56 
 
 		 387 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  25.56 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5295  sodium/hydrogen exchanger  25.08 
 
 		 661 aa  82  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  25.56 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  25.56 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  25.56 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  25.56 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  25.56 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  25.56 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  25.56 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  26.59 
 
 		 385 aa  80.9  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  27.05 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0867  sodium/hydrogen exchanger  26.5 
 
 		 530 aa  80.5  0.00000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.638156  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  21.28 
 
 		 764 aa  80.5  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  25.26 
 
 		 662 aa  80.1  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  23.9 
 
 		 423 aa  80.5  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  25 
 
 		 387 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  27.15 
 
 		 375 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1221  sodium/hydrogen exchanger  26.29 
 
 		 565 aa  79.7  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.082268  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  22.26 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  27.3 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  27.3 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  27.3 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  27.3 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  27.3 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1107  sodium/hydrogen exchanger  21.79 
 
 		 775 aa  77.4  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112633  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  22.49 
 
 		 375 aa  76.6  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1145  sodium/hydrogen exchanger  24.91 
 
 		 566 aa  76.3  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.021897  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1795  sodium/hydrogen exchanger  25.27 
 
 		 566 aa  75.9  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315073  unclonable  0.0000000110445 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  24.16 
 
 		 666 aa  75.5  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  26.77 
 
 		 388 aa  75.1  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  26.17 
 
 		 741 aa  75.1  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  25.48 
 
 		 658 aa  74.3  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0413  sodium/hydrogen exchanger  24.55 
 
 		 566 aa  73.9  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.706339  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1166  potassium efflux system protein  25.09 
 
 		 585 aa  73.9  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  26.62 
 
 		 388 aa  73.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1792  sodium/hydrogen exchanger  26.77 
 
 		 388 aa  73.9  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.906777  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  22.54 
 
 		 665 aa  73.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  24.16 
 
 		 399 aa  72.8  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4238  sodium/hydrogen exchanger  23.99 
 
 		 656 aa  72.8  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1067  sodium/hydrogen exchanger  24.79 
 
 		 609 aa  72.4  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000397977  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0546  Na+/H+ antiporter  20.51 
 
 		 715 aa  72  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>