More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1145 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1221  sodium/hydrogen exchanger  79.82 
 
 
565 aa  914    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.082268  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1795  sodium/hydrogen exchanger  98.23 
 
 
566 aa  1085    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315073  unclonable  0.0000000110445 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0413  sodium/hydrogen exchanger  96.11 
 
 
566 aa  1053    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.706339  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1145  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
566 aa  1102    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.021897  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1863  sodium/hydrogen exchanger  39.28 
 
 
558 aa  377  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0930  sodium/hydrogen exchanger  36.52 
 
 
575 aa  368  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2094  sodium/hydrogen exchanger  40.69 
 
 
541 aa  357  5e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4337  carbonic anhydrase  38.46 
 
 
572 aa  356  6.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0331967 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2284  sodium/hydrogen exchanger  38.82 
 
 
572 aa  355  1e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.608384  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1614  sodium/hydrogen exchanger  38.69 
 
 
566 aa  353  4e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1095  sodium/hydrogen exchanger  39.44 
 
 
562 aa  349  7e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129654  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1199  sodium/hydrogen exchanger  37.97 
 
 
546 aa  348  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.399558  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0835  sodium/hydrogen exchanger  39.09 
 
 
561 aa  347  3e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2771  sodium/hydrogen exchanger  35.04 
 
 
595 aa  344  2e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4612  sodium/hydrogen exchanger  36.19 
 
 
548 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180321 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3552  sodium/hydrogen exchanger  36.4 
 
 
551 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.341909  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2917  sodium/hydrogen exchanger  37.97 
 
 
561 aa  326  6e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.862337  hitchhiker  0.00347673 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  33.97 
 
 
720 aa  297  3e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3158  sodium/hydrogen exchanger  35.29 
 
 
547 aa  296  7e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.833464  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2938  sodium/hydrogen exchanger  35.29 
 
 
547 aa  296  8e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3972  sodium/hydrogen exchanger  42.74 
 
 
424 aa  295  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.806764  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1424  sodium/hydrogen exchanger  36.33 
 
 
566 aa  288  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2772  sodium/hydrogen exchanger  31.18 
 
 
571 aa  255  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48581  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0191  sodium/hydrogen exchanger  28.34 
 
 
577 aa  244  3.9999999999999997e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.912103  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1997  sodium/hydrogen exchanger  28.28 
 
 
576 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3569  Sodium/hydrogen exchanger  26.83 
 
 
592 aa  229  9e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.278233 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1895  sodium/hydrogen exchanger  27.03 
 
 
574 aa  229  9e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4196  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  29.13 
 
 
575 aa  227  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2433  sodium/hydrogen exchanger  30 
 
 
578 aa  226  9e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0606  TrkA-N, Sodium/hydrogen exchanger  27.66 
 
 
574 aa  221  3e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  29.2 
 
 
650 aa  211  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0751  sodium/hydrogen exchanger  26.94 
 
 
581 aa  207  6e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0193  sodium/hydrogen exchanger  28.63 
 
 
598 aa  204  4e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  26.29 
 
 
567 aa  194  4e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  26 
 
 
567 aa  194  5e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.08 
 
 
567 aa  193  7e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  26.29 
 
 
775 aa  191  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4125  sodium/hydrogen exchanger  25.57 
 
 
584 aa  188  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.688995  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0188  sodium/hydrogen exchanger  27.05 
 
 
624 aa  184  3e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261815  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  26.33 
 
 
636 aa  181  4e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  27.05 
 
 
762 aa  180  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0668  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  26.62 
 
 
584 aa  179  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.457032  normal  0.0419012 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  23.89 
 
 
649 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  23.88 
 
 
674 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  25.23 
 
 
660 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  25.42 
 
 
652 aa  173  6.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  25.33 
 
 
660 aa  173  7.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  24.77 
 
 
658 aa  172  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  23.09 
 
 
649 aa  173  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  24.07 
 
 
649 aa  172  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1076  sodium/hydrogen exchanger  25.81 
 
 
665 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  25.81 
 
 
665 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  25.52 
 
 
673 aa  171  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  23.02 
 
 
648 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  23.22 
 
 
648 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  23.16 
 
 
648 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  24.42 
 
 
666 aa  167  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2098  sodium/hydrogen exchanger  25.61 
 
 
584 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  26.24 
 
 
672 aa  166  9e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0155  sodium/hydrogen exchanger  23.58 
 
 
661 aa  166  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  22.52 
 
 
648 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  23.52 
 
 
670 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  23.04 
 
 
648 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  23.04 
 
 
648 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000490638 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  25.49 
 
 
771 aa  165  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1271  sodium/hydrogen exchanger  26.78 
 
 
457 aa  164  3e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  24.44 
 
 
671 aa  164  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1132  hypothetical protein  25.9 
 
 
564 aa  164  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  23.02 
 
 
648 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5295  sodium/hydrogen exchanger  23.94 
 
 
661 aa  164  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  25.05 
 
 
664 aa  163  7e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0181  sodium/hydrogen exchanger  22.76 
 
 
665 aa  163  8.000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4238  sodium/hydrogen exchanger  23.51 
 
 
656 aa  163  8.000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  21.43 
 
 
667 aa  162  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  25.05 
 
 
669 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  23.84 
 
 
741 aa  161  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  24.55 
 
 
659 aa  162  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  24.82 
 
 
663 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0917  sodium/hydrogen exchanger  25.43 
 
 
585 aa  161  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  25.05 
 
 
669 aa  161  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  25.05 
 
 
669 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  23.99 
 
 
648 aa  161  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  25.05 
 
 
669 aa  161  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  25.19 
 
 
663 aa  161  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  25.05 
 
 
669 aa  161  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1520  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  25.05 
 
 
669 aa  161  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418182  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  22.83 
 
 
674 aa  161  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  26.35 
 
 
666 aa  160  4e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  24.96 
 
 
773 aa  160  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  26.31 
 
 
663 aa  160  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  22.29 
 
 
664 aa  160  6e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  23.68 
 
 
653 aa  159  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0258  sodium/hydrogen exchanger  26.93 
 
 
573 aa  159  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  22.16 
 
 
648 aa  159  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  24.68 
 
 
678 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3064  Sodium/hydrogen exchanger  26.24 
 
 
565 aa  159  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  23.83 
 
 
666 aa  159  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  26.24 
 
 
671 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  26 
 
 
697 aa  157  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  23.06 
 
 
649 aa  157  6e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>