More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2201 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2201  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 708 aa  1422    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3830  sodium/hydrogen exchanger  71.59 
 
 		 706 aa  964    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.417332  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1862  sodium/hydrogen exchanger  46.68 
 
 		 751 aa  633  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1258  sodium/hydrogen exchanger  46.87 
 
 		 721 aa  607  9.999999999999999e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105109  normal  0.138872 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1103  sodium/hydrogen exchanger  45.89 
 
 		 716 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.554768  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1681  sodium/hydrogen exchanger  47.49 
 
 		 732 aa  597  1e-169  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1475  putative Na+/H+ antiporter  44.28 
 
 		 727 aa  559  1e-158  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1205  Na+/H+ anti-porter  42.2 
 
 		 716 aa  528  1e-148  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6580  sodium/hydrogen exchanger  40.37 
 
 		 719 aa  513  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.070036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4708  sodium/hydrogen exchanger  39.31 
 
 		 715 aa  471  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1978  sodium/hydrogen exchanger  35.09 
 
 		 709 aa  398  1e-109  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0979  sodium/hydrogen exchanger  35.72 
 
 		 688 aa  382  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4481  sodium/hydrogen exchanger  37.86 
 
 		 679 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1869  sodium/hydrogen exchanger  34.07 
 
 		 689 aa  333  9e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3545  Sodium/hydrogen exchanger  38.71 
 
 		 681 aa  318  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3051  sodium/hydrogen exchanger  31.47 
 
 		 686 aa  316  8e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0038  sodium/hydrogen exchanger  29.81 
 
 		 692 aa  280  7e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4587  Sodium/hydrogen exchanger  28.47 
 
 		 712 aa  257  5e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1732  sodium/hydrogen exchanger  30.12 
 
 		 698 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1707  sodium/hydrogen exchanger  29.95 
 
 		 698 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4722  sodium/hydrogen exchanger  28.81 
 
 		 692 aa  234  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2626  sodium/hydrogen exchanger  26.4 
 
 		 722 aa  226  8e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1401  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  28.38 
 
 		 699 aa  182  1e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.972731  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1642  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  28.41 
 
 		 699 aa  178  2e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0307  Na+/H+ antiporter  34.4 
 
 		 408 aa  150  8e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0743  sodium/hydrogen exchanger  29.9 
 
 		 395 aa  104  7e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.286808  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  25.53 
 
 		 386 aa  100  9e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  28.08 
 
 		 396 aa  95.5  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1008  sodium/hydrogen exchanger  23.45 
 
 		 614 aa  94.7  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000272114  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1027  sodium/hydrogen exchanger  23.45 
 
 		 614 aa  94.7  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000401836  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0590  Na+/H+ exchanger family protein, putative  23.46 
 
 		 614 aa  91.7  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104046  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1963  sodium/hydrogen exchanger  28.16 
 
 		 611 aa  85.1  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000117586  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  26.88 
 
 		 767 aa  83.2  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  26.67 
 
 		 385 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0733  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  24.49 
 
 		 609 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2552  sodium/hydrogen exchanger  25.21 
 
 		 747 aa  82.8  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.803467  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0826  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  23.57 
 
 		 609 aa  82.4  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381657  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  27.65 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0754  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  23.7 
 
 		 609 aa  81.3  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133818 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0665  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.7 
 
 		 609 aa  81.3  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0609  Na+/H+ antiporter  23.7 
 
 		 609 aa  81.3  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0610  Na+/H+ antiporter  23.7 
 
 		 609 aa  81.3  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0699  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.7 
 
 		 609 aa  81.3  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0587  sodium/hydrogen exchanger  27.89 
 
 		 609 aa  81.3  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.013374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0768  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.29 
 
 		 609 aa  81.3  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4604  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  25.77 
 
 		 609 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  28.08 
 
 		 387 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  28.08 
 
 		 387 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  27.65 
 
 		 387 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  28.08 
 
 		 387 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0614  sodium/hydrogen exchanger  24.23 
 
 		 609 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  27.69 
 
 		 387 aa  79  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  24.17 
 
 		 756 aa  79  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  26.76 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  28.08 
 
 		 387 aa  79  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1608  sodium/hydrogen exchanger  35.46 
 
 		 387 aa  79  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0247605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  28.08 
 
 		 387 aa  79  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  27.69 
 
 		 387 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  26.83 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  26.83 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1020  sodium/hydrogen exchanger  27.56 
 
 		 389 aa  78.6  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.259417  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  26.83 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  26.83 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0867  sodium/hydrogen exchanger  24.46 
 
 		 530 aa  78.6  0.0000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.638156  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  26.83 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  27.38 
 
 		 387 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  25.45 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  24.51 
 
 		 482 aa  78.2  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  23.36 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  26.92 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  26.5 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0306  sodium/hydrogen exchanger  27.56 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  26.83 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  24.91 
 
 		 398 aa  75.9  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  24.1 
 
 		 399 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  26.57 
 
 		 375 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2667  sodium/hydrogen exchanger  29.08 
 
 		 767 aa  75.5  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0162  Kef-type K+ transport system, membrane component  26.76 
 
 		 608 aa  75.1  0.000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000463033  unclonable  1.19367e-27 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  24.01 
 
 		 423 aa  73.6  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  26.97 
 
 		 412 aa  73.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  24.57 
 
 		 352 aa  72.8  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0296  sodium/hydrogen exchanger  22.7 
 
 		 659 aa  72  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5295  sodium/hydrogen exchanger  25.74 
 
 		 661 aa  72  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1868  sodium/hydrogen exchanger  26.56 
 
 		 469 aa  72  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1067  sodium/hydrogen exchanger  24.62 
 
 		 609 aa  71.2  0.00000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000397977  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4724  sodium/hydrogen exchanger  27.99 
 
 		 473 aa  71.2  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3828  sodium/hydrogen exchanger  21.25 
 
 		 715 aa  70.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1632  Sodium/hydrogen exchanger  26.2 
 
 		 723 aa  70.1  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.531828 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3878  sodium/hydrogen exchanger  21.06 
 
 		 715 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.267583  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.53 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  26.83 
 
 		 375 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  26.83 
 
 		 375 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  24.45 
 
 		 399 aa  69.7  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  26.83 
 
 		 375 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  26.62 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  25.07 
 
 		 467 aa  68.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  26.42 
 
 		 665 aa  68.2  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  25.07 
 
 		 467 aa  68.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  24.3 
 
 		 416 aa  66.6  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1519  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.99 
 
 		 579 aa  66.6  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.49267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>