More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1205 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1475  putative Na+/H+ antiporter  53.12 
 
 		 727 aa  706    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1205  Na+/H+ anti-porter  100 
 
 		 716 aa  1453    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1681  sodium/hydrogen exchanger  59.85 
 
 		 732 aa  786    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1103  sodium/hydrogen exchanger  61.57 
 
 		 716 aa  840    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.554768  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1862  sodium/hydrogen exchanger  58.43 
 
 		 751 aa  828    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1258  sodium/hydrogen exchanger  42.56 
 
 		 721 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105109  normal  0.138872 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6580  sodium/hydrogen exchanger  39.86 
 
 		 719 aa  522  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.070036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3830  sodium/hydrogen exchanger  42.11 
 
 		 706 aa  518  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.417332  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2201  sodium/hydrogen exchanger  42.2 
 
 		 708 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4708  sodium/hydrogen exchanger  37.41 
 
 		 715 aa  472  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1869  sodium/hydrogen exchanger  35.1 
 
 		 689 aa  361  3e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1978  sodium/hydrogen exchanger  34.94 
 
 		 709 aa  356  7.999999999999999e-97  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0979  sodium/hydrogen exchanger  34.51 
 
 		 688 aa  343  5e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4481  sodium/hydrogen exchanger  34.72 
 
 		 679 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3545  Sodium/hydrogen exchanger  37.16 
 
 		 681 aa  316  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3051  sodium/hydrogen exchanger  31.44 
 
 		 686 aa  305  2.0000000000000002e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0038  sodium/hydrogen exchanger  31.37 
 
 		 692 aa  281  2e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4587  Sodium/hydrogen exchanger  30.58 
 
 		 712 aa  253  6e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1732  sodium/hydrogen exchanger  32.7 
 
 		 698 aa  253  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1707  sodium/hydrogen exchanger  32.7 
 
 		 698 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2626  sodium/hydrogen exchanger  29.36 
 
 		 722 aa  233  1e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4722  sodium/hydrogen exchanger  31.56 
 
 		 692 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1642  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  28.33 
 
 		 699 aa  176  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0307  Na+/H+ antiporter  36.18 
 
 		 408 aa  171  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1401  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  32.51 
 
 		 699 aa  159  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.972731  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0733  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  26.85 
 
 		 609 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0665  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.85 
 
 		 609 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0609  Na+/H+ antiporter  26.85 
 
 		 609 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0610  Na+/H+ antiporter  26.85 
 
 		 609 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0699  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.85 
 
 		 609 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4604  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  26.85 
 
 		 609 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0826  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  26.72 
 
 		 609 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0754  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  26.85 
 
 		 609 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133818 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0743  sodium/hydrogen exchanger  26.69 
 
 		 395 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.286808  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  27.97 
 
 		 386 aa  112  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0614  sodium/hydrogen exchanger  26.03 
 
 		 609 aa  112  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0768  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.35 
 
 		 609 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0587  sodium/hydrogen exchanger  26.28 
 
 		 609 aa  109  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.013374  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0867  sodium/hydrogen exchanger  28.04 
 
 		 530 aa  95.9  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.638156  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  25.63 
 
 		 396 aa  94  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0590  Na+/H+ exchanger family protein, putative  26.52 
 
 		 614 aa  94  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104046  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  27.37 
 
 		 387 aa  92.4  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1020  sodium/hydrogen exchanger  25.79 
 
 		 389 aa  92  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.259417  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  26.84 
 
 		 387 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  26.84 
 
 		 387 aa  91.7  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  26.84 
 
 		 387 aa  91.3  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  26.84 
 
 		 387 aa  91.3  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  26.84 
 
 		 387 aa  90.9  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  26.84 
 
 		 387 aa  90.5  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  26.84 
 
 		 387 aa  90.5  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  26.84 
 
 		 387 aa  90.5  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1963  sodium/hydrogen exchanger  28.05 
 
 		 611 aa  89.4  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000117586  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0306  sodium/hydrogen exchanger  25.53 
 
 		 389 aa  89.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  25.82 
 
 		 389 aa  89.7  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  26.84 
 
 		 387 aa  89  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1008  sodium/hydrogen exchanger  27.04 
 
 		 614 aa  87.8  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000272114  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1027  sodium/hydrogen exchanger  27.04 
 
 		 614 aa  87.8  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000401836  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1608  sodium/hydrogen exchanger  33.56 
 
 		 387 aa  87.8  7e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0247605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  25.44 
 
 		 385 aa  87  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  26.97 
 
 		 445 aa  82.4  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0162  Kef-type K+ transport system, membrane component  28.01 
 
 		 608 aa  78.6  0.0000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000463033  unclonable  1.19367e-27 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  23.82 
 
 		 399 aa  77  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  25.74 
 
 		 404 aa  76.6  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  25.08 
 
 		 375 aa  76.6  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  28.1 
 
 		 586 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  24.85 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  25.47 
 
 		 352 aa  75.5  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  24 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  27.32 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1519  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.34 
 
 		 579 aa  73.6  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.49267  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  27.09 
 
 		 586 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.74 
 
 		 587 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  29.64 
 
 		 585 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1792  sodium/hydrogen exchanger  26.74 
 
 		 388 aa  72.4  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.906777  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1282  sodium/hydrogen exchanger  23.31 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  27.37 
 
 		 586 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  22.99 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  26.97 
 
 		 388 aa  72  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  27.37 
 
 		 587 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  27.37 
 
 		 586 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  29.12 
 
 		 585 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  22.88 
 
 		 389 aa  71.2  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1067  sodium/hydrogen exchanger  26.11 
 
 		 609 aa  71.2  0.00000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000397977  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  25.78 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  23.97 
 
 		 756 aa  71.2  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4036  sodium/hydrogen exchanger  26.69 
 
 		 422 aa  70.9  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554914  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  29.32 
 
 		 585 aa  70.9  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  22.98 
 
 		 375 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  22.98 
 
 		 375 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  22.98 
 
 		 375 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  22.98 
 
 		 375 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  22.98 
 
 		 375 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.74 
 
 		 587 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  22.98 
 
 		 375 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  26.74 
 
 		 662 aa  69.3  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5016  sodium/hydrogen exchanger  26.96 
 
 		 745 aa  69.3  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  24.93 
 
 		 388 aa  69.7  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  23.47 
 
 		 375 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  26.42 
 
 		 720 aa  68.9  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  25.7 
 
 		 395 aa  68.9  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>