More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01391 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  100 
 
 
720 aa  1461    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  60.64 
 
 
657 aa  798    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  46.8 
 
 
649 aa  592  1e-168  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  45.87 
 
 
648 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  45.86 
 
 
648 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1593  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  48.01 
 
 
655 aa  567  1e-160  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  46.15 
 
 
648 aa  566  1e-160  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  46.15 
 
 
648 aa  566  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000490638 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  46.65 
 
 
648 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  46.49 
 
 
648 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  46.65 
 
 
648 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  44.56 
 
 
649 aa  561  1e-158  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  44.56 
 
 
650 aa  560  1e-158  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  46.49 
 
 
648 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  44.73 
 
 
653 aa  552  1e-156  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  45.81 
 
 
649 aa  554  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  47.47 
 
 
648 aa  545  1e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  44.56 
 
 
649 aa  535  1e-151  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  42.34 
 
 
654 aa  498  1e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  39.3 
 
 
662 aa  476  1e-133  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  39.97 
 
 
661 aa  427  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  39.97 
 
 
661 aa  427  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000235169 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1976  sodium/hydrogen exchanger  39.31 
 
 
666 aa  419  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3810  sodium/hydrogen exchanger family protein  38.5 
 
 
680 aa  410  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.162531 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3417  potassium efflux system protein  37.66 
 
 
652 aa  412  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00166015  normal  0.19535 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  37.31 
 
 
674 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2796  sodium/hydrogen exchanger  37.93 
 
 
668 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0879164 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2171  sodium/hydrogen exchanger  37.93 
 
 
668 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  37.62 
 
 
678 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2785  sodium/hydrogen exchanger  37.93 
 
 
668 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0657605  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  37.86 
 
 
660 aa  402  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  37.21 
 
 
668 aa  405  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1519  sodium/hydrogen exchanger family protein  40.86 
 
 
579 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.49267  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1760  sodium/hydrogen exchanger family protein  37.56 
 
 
654 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303253  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5295  sodium/hydrogen exchanger  37.35 
 
 
661 aa  402  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  38.5 
 
 
663 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  37.5 
 
 
667 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2845  sodium/hydrogen exchanger  37.77 
 
 
670 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0613147  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4133  potassium efflux system protein  38.33 
 
 
661 aa  397  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.477795 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  37.65 
 
 
667 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  38.7 
 
 
669 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2703  sodium/hydrogen exchanger  37.62 
 
 
670 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  38.7 
 
 
669 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  38.7 
 
 
669 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  36.35 
 
 
659 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  38.5 
 
 
663 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1520  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  38.7 
 
 
669 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418182  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  38.7 
 
 
669 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  38.7 
 
 
669 aa  398  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  37.9 
 
 
660 aa  395  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4238  sodium/hydrogen exchanger  37.39 
 
 
656 aa  392  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  37.04 
 
 
666 aa  392  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0296  sodium/hydrogen exchanger  38.66 
 
 
659 aa  385  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  37.95 
 
 
658 aa  380  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0880  sodium/hydrogen exchanger  38.68 
 
 
655 aa  381  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.19448  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0155  sodium/hydrogen exchanger  38.31 
 
 
661 aa  379  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0414  putative glutathione-regulated potassium-efflux system K+/H+ antiporter transmembrane protein  38.36 
 
 
659 aa  378  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3491  potassium efflux system protein  38.33 
 
 
661 aa  375  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3967  Sodium/hydrogen exchanger  42.16 
 
 
570 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0269  sodium/hydrogen exchanger  38.2 
 
 
659 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4786  potassium efflux system protein  36.91 
 
 
661 aa  365  1e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4900  potassium efflux system protein  35.94 
 
 
664 aa  365  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4109  sodium/hydrogen exchanger  36.66 
 
 
661 aa  362  9e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.324646  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0181  sodium/hydrogen exchanger  37.25 
 
 
665 aa  359  9.999999999999999e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.36 
 
 
697 aa  339  9.999999999999999e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  33.38 
 
 
666 aa  336  7e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  32.98 
 
 
672 aa  332  1e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  32.71 
 
 
636 aa  329  9e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  33.18 
 
 
666 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  30.55 
 
 
674 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2194  potassium efflux system protein  36.2 
 
 
574 aa  311  2.9999999999999997e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  32.01 
 
 
741 aa  311  4e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  29.89 
 
 
671 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  33.39 
 
 
665 aa  306  7e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  32.28 
 
 
666 aa  302  1e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  30.72 
 
 
658 aa  299  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  32.87 
 
 
666 aa  298  3e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  29.92 
 
 
656 aa  296  1e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  29.26 
 
 
665 aa  295  1e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_002978  WD1249  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  32.68 
 
 
572 aa  292  2e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2952  Sodium/hydrogen exchanger, TrkA-N  35.96 
 
 
568 aa  291  4e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  31.69 
 
 
670 aa  289  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1457  K+ efflux antiporter, putative (KEA1)  34.29 
 
 
583 aa  288  2.9999999999999996e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  31.22 
 
 
663 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0802  sodium/hydrogen exchanger  33.86 
 
 
583 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0767  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.87 
 
 
539 aa  285  2.0000000000000002e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000529307  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  32.61 
 
 
652 aa  285  2.0000000000000002e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  29.78 
 
 
664 aa  282  1e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4566  sodium/hydrogen exchanger  36.4 
 
 
578 aa  281  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.218526 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11843  predicted protein  34.44 
 
 
533 aa  280  6e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1735  sodium/hydrogen exchanger  33.68 
 
 
593 aa  280  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1861  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.8 
 
 
540 aa  280  8e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000013758  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2280  sodium/hydrogen exchanger  36.28 
 
 
590 aa  277  4e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  28.11 
 
 
682 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0955  sodium/hydrogen exchanger  34 
 
 
672 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00880864  normal  0.316 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0885  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  34.29 
 
 
578 aa  274  3e-72  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0974  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.4 
 
 
543 aa  274  4.0000000000000004e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.705651  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3734  sodium/hydrogen exchanger  32.94 
 
 
591 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1380  sodium/hydrogen exchanger  33.08 
 
 
540 aa  274  5.000000000000001e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.034971  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  31.56 
 
 
668 aa  273  9e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>