More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1020 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1020  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
389 aa  742    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.259417  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0306  sodium/hydrogen exchanger  98.46 
 
 
389 aa  734    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1608  sodium/hydrogen exchanger  96.64 
 
 
387 aa  616  1e-175  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0247605  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0743  sodium/hydrogen exchanger  62.04 
 
 
395 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.286808  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4587  Sodium/hydrogen exchanger  28.76 
 
 
712 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  27.32 
 
 
386 aa  144  3e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4708  sodium/hydrogen exchanger  28.4 
 
 
715 aa  140  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6580  sodium/hydrogen exchanger  26.95 
 
 
719 aa  139  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.070036  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  30.34 
 
 
352 aa  140  6e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  28.9 
 
 
385 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  28.76 
 
 
375 aa  135  9e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  28.76 
 
 
375 aa  135  9e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  28.76 
 
 
375 aa  135  9e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  28.76 
 
 
375 aa  135  9e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  28.76 
 
 
375 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  28.5 
 
 
375 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  26.56 
 
 
389 aa  135  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  29.47 
 
 
387 aa  134  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  28.14 
 
 
375 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  27.7 
 
 
375 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  29.37 
 
 
387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  29.37 
 
 
387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  29.37 
 
 
387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  29.37 
 
 
387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  29.37 
 
 
387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  29.37 
 
 
387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  29.37 
 
 
387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  29.37 
 
 
387 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  27.44 
 
 
379 aa  130  4.0000000000000003e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  27.7 
 
 
375 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  28.95 
 
 
387 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1862  sodium/hydrogen exchanger  26.25 
 
 
751 aa  129  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1978  sodium/hydrogen exchanger  26.8 
 
 
709 aa  129  7.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2626  sodium/hydrogen exchanger  26.79 
 
 
722 aa  127  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  27.01 
 
 
396 aa  126  6e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0867  sodium/hydrogen exchanger  29.67 
 
 
530 aa  124  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.638156  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  26.68 
 
 
400 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  28.76 
 
 
375 aa  123  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  28.76 
 
 
375 aa  123  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  28.76 
 
 
375 aa  123  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1576  sodium/hydrogen exchanger  26.88 
 
 
392 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.000000405712  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1205  Na+/H+ anti-porter  26.05 
 
 
716 aa  119  7e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  27.01 
 
 
390 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1099  sodium/hydrogen exchanger  26.07 
 
 
392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1258  sodium/hydrogen exchanger  27.53 
 
 
721 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105109  normal  0.138872 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0847  sodium/hydrogen exchanger  26.32 
 
 
392 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.461656  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1681  sodium/hydrogen exchanger  26.25 
 
 
732 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  25.88 
 
 
399 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  27.81 
 
 
382 aa  111  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1103  sodium/hydrogen exchanger  24.8 
 
 
716 aa  111  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.554768  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4722  sodium/hydrogen exchanger  24.93 
 
 
692 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1963  sodium/hydrogen exchanger  26.24 
 
 
611 aa  110  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000117586  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  25.98 
 
 
404 aa  109  7.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0499  NaH antiporter protein  25.85 
 
 
389 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3051  sodium/hydrogen exchanger  27.65 
 
 
686 aa  109  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1475  putative Na+/H+ antiporter  24.41 
 
 
727 aa  108  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  27.9 
 
 
412 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0614  sodium/hydrogen exchanger  27.59 
 
 
609 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  25.41 
 
 
389 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2201  sodium/hydrogen exchanger  28.62 
 
 
708 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260378  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0590  Na+/H+ exchanger family protein, putative  26.65 
 
 
614 aa  107  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104046  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0587  sodium/hydrogen exchanger  27.44 
 
 
609 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.013374  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0754  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  27.92 
 
 
609 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133818 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0665  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.92 
 
 
609 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0609  Na+/H+ antiporter  27.92 
 
 
609 aa  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0610  Na+/H+ antiporter  27.92 
 
 
609 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0826  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  27.82 
 
 
609 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381657  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0699  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.92 
 
 
609 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4604  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  27.9 
 
 
609 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0768  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.04 
 
 
609 aa  106  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1008  sodium/hydrogen exchanger  26.97 
 
 
614 aa  105  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000272114  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1732  sodium/hydrogen exchanger  24.62 
 
 
698 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1027  sodium/hydrogen exchanger  26.97 
 
 
614 aa  105  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000401836  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0733  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  27.57 
 
 
609 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  24.37 
 
 
414 aa  103  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  24.16 
 
 
423 aa  103  4e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.95 
 
 
427 aa  103  5e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1707  sodium/hydrogen exchanger  24.1 
 
 
698 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0979  sodium/hydrogen exchanger  23.72 
 
 
688 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 
445 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4481  sodium/hydrogen exchanger  26.81 
 
 
679 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  26.48 
 
 
424 aa  101  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1067  sodium/hydrogen exchanger  28.35 
 
 
609 aa  100  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000397977  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0162  Kef-type K+ transport system, membrane component  27.82 
 
 
608 aa  100  6e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000463033  unclonable  1.19367e-27 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  26.57 
 
 
424 aa  99.8  7e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  26.11 
 
 
397 aa  99.4  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  23.18 
 
 
395 aa  99.4  9e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3830  sodium/hydrogen exchanger  25.57 
 
 
706 aa  99.4  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.417332  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  26.58 
 
 
388 aa  99  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1792  sodium/hydrogen exchanger  26.21 
 
 
388 aa  98.6  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.906777  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  27.73 
 
 
388 aa  98.6  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  25.75 
 
 
756 aa  97.4  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2302  sodium/hydrogen exchanger  24.66 
 
 
423 aa  97.8  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113166  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  26.46 
 
 
388 aa  97.4  4e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  27.47 
 
 
399 aa  96.7  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1869  sodium/hydrogen exchanger  25.71 
 
 
689 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  25.84 
 
 
767 aa  94  4e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.73 
 
 
418 aa  94  4e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  24.75 
 
 
416 aa  94  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  23.54 
 
 
385 aa  93.6  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>