245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0343 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  100 
 
 		 373 aa  758    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  42.74 
 
 		 378 aa  296  3e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  42.32 
 
 		 386 aa  287  2e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0427  periplasmic binding protein  45.35 
 
 		 373 aa  285  7e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0410  periplasmic binding protein  45.05 
 
 		 373 aa  285  7e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.579049  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  41.35 
 
 		 374 aa  281  1e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  42.59 
 
 		 369 aa  273  3e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0411  periplasmic binding protein  41.62 
 
 		 374 aa  272  6e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  45.18 
 
 		 358 aa  271  1e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  45.32 
 
 		 358 aa  271  1e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  41.73 
 
 		 372 aa  270  2e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1494  periplasmic binding protein  41.26 
 
 		 374 aa  268  2e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00826016  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0425  periplasmic binding protein  38.52 
 
 		 365 aa  263  3e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.264248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0424  periplasmic binding protein  40.11 
 
 		 373 aa  263  3e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.212243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  41.18 
 
 		 381 aa  255  8e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  41.18 
 
 		 409 aa  249  4e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0251  periplasmic binding protein  35.85 
 
 		 369 aa  245  8e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  41.69 
 
 		 396 aa  239  5e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1424  periplasmic binding protein  37.11 
 
 		 374 aa  238  9e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.813522  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  40.94 
 
 		 689 aa  236  4e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  41.38 
 
 		 393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  40.85 
 
 		 688 aa  233  3e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  38.02 
 
 		 390 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  36.68 
 
 		 372 aa  231  1e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3056  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  39.02 
 
 		 369 aa  231  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1174  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  35.98 
 
 		 367 aa  225  8e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00124091  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  36.57 
 
 		 401 aa  222  8e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  40.06 
 
 		 370 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  37.4 
 
 		 401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  34.91 
 
 		 403 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2328  periplasmic binding protein  36.49 
 
 		 384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2329  periplasmic binding protein  36.49 
 
 		 384 aa  209  4e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  37.33 
 
 		 370 aa  210  4e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  35.5 
 
 		 375 aa  207  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  36.07 
 
 		 375 aa  204  2e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1653  periplasmic binding protein  37.5 
 
 		 386 aa  202  6e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  35.96 
 
 		 375 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  37.1 
 
 		 375 aa  196  6e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  36.36 
 
 		 362 aa  192  1e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1622  iron transport periplasmic binding protein  34.18 
 
 		 370 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000308392  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0998  iron ABC transporter, solute-binding protein  37.09 
 
 		 373 aa  186  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  34.49 
 
 		 376 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2147  periplasmic binding protein  30.57 
 
 		 387 aa  178  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.985671  normal  0.111935 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  33.16 
 
 		 381 aa  173  5e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  34.13 
 
 		 377 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1823  periplasmic binding protein  32.3 
 
 		 366 aa  169  5e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.717749  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1092  hypothetical protein  31.38 
 
 		 378 aa  159  9e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  32.56 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0991  periplasmic binding protein  30 
 
 		 359 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.960819  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0816  periplasmic binding protein  28.66 
 
 		 344 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  29.38 
 
 		 375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  27.55 
 
 		 351 aa  104  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  27.22 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  24.18 
 
 		 361 aa  99.8  8e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  25.82 
 
 		 369 aa  97.8  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  24.86 
 
 		 333 aa  97.1  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1691  periplasmic binding protein  26.1 
 
 		 353 aa  96.3  7e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000252356  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  26.24 
 
 		 350 aa  95.9  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  25.9 
 
 		 354 aa  93.6  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  24.41 
 
 		 350 aa  93.6  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  24.12 
 
 		 350 aa  93.2  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  24.41 
 
 		 350 aa  93.2  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  25.34 
 
 		 365 aa  92.8  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  25.3 
 
 		 354 aa  92  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  23.82 
 
 		 350 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  28.49 
 
 		 363 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  27.03 
 
 		 362 aa  90.5  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1093  Fe3+-hydroxamate binding protein  26.93 
 
 		 426 aa  90.5  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000629133  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  25.07 
 
 		 354 aa  90.1  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  26.25 
 
 		 351 aa  89.7  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2264  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  26.4 
 
 		 362 aa  88.6  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0217447  normal  0.506008 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1679  periplasmic binding protein  23.08 
 
 		 363 aa  88.2  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1354  periplasmic binding protein  23.92 
 
 		 371 aa  88.2  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  26.22 
 
 		 478 aa  87.4  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1176  ABC transporter, solute-binding protein  26.7 
 
 		 408 aa  87.4  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3842  periplasmic binding protein  27.54 
 
 		 349 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  26.11 
 
 		 370 aa  87  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  25.15 
 
 		 344 aa  87  5e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1477  periplasmic binding protein  25.3 
 
 		 345 aa  85.9  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  25.95 
 
 		 370 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1285  periplasmic binding protein  24.29 
 
 		 346 aa  84  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1470  periplasmic binding protein  25.39 
 
 		 419 aa  83.6  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000805448  normal  0.0690389 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  24.58 
 
 		 483 aa  83.2  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1991  periplasmic binding protein  26.55 
 
 		 377 aa  83.2  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0448  periplasmic binding protein  26.97 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4151  periplasmic binding protein  26.95 
 
 		 349 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00557597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  26.27 
 
 		 354 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  26.32 
 
 		 353 aa  82.4  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  25.65 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5522  periplasmic binding protein  26.93 
 
 		 361 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  24.53 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2480  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 350 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.388226 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  27.92 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1119  periplasmic binding protein  28.17 
 
 		 382 aa  78.6  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000476149  hitchhiker  0.00000000000345093 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2263  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  25 
 
 		 360 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.128024  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1015  periplasmic binding protein  25.14 
 
 		 371 aa  77.4  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.543354 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  25.14 
 
 		 360 aa  77.4  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4299  periplasmic binding protein  26.35 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24730  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  26.65 
 
 		 386 aa  76.3  0.0000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1708  periplasmic binding protein  23.56 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>