More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0059 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  94.63 
 
 		 689 aa  1310    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  100 
 
 		 688 aa  1383    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  85.88 
 
 		 393 aa  597  1e-169  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  85 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  67.76 
 
 		 409 aa  486  1e-136  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1424  periplasmic binding protein  49.86 
 
 		 374 aa  321  3e-86  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.813522  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1399  hypothetical protein  55.81 
 
 		 315 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0713951 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  45.69 
 
 		 378 aa  298  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  45.14 
 
 		 374 aa  297  5e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  47.02 
 
 		 369 aa  289  1e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  43.58 
 
 		 381 aa  273  7e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  45.1 
 
 		 358 aa  268  2e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0427  periplasmic binding protein  43.49 
 
 		 373 aa  262  1e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  45.02 
 
 		 358 aa  262  2e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0410  periplasmic binding protein  43.36 
 
 		 373 aa  262  2e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.579049  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  41.14 
 
 		 386 aa  257  4e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1509  hypothetical protein  45.51 
 
 		 328 aa  244  3e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  38.76 
 
 		 372 aa  243  1e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0411  periplasmic binding protein  38.27 
 
 		 374 aa  240  5e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0251  periplasmic binding protein  37.91 
 
 		 369 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3056  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  39.49 
 
 		 369 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1494  periplasmic binding protein  37.99 
 
 		 374 aa  234  6e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00826016  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  40.85 
 
 		 373 aa  233  8.000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0424  periplasmic binding protein  37.74 
 
 		 373 aa  231  3e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.212243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0425  periplasmic binding protein  37.99 
 
 		 365 aa  230  8e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.264248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  37.32 
 
 		 390 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  37.6 
 
 		 375 aa  211  4e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1622  iron transport periplasmic binding protein  36.95 
 
 		 370 aa  210  6e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000308392  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  36.02 
 
 		 372 aa  210  8e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  35.67 
 
 		 401 aa  207  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  34.15 
 
 		 403 aa  206  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  35.42 
 
 		 401 aa  204  4e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  36.58 
 
 		 370 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2328  periplasmic binding protein  37.32 
 
 		 384 aa  200  7e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  38.19 
 
 		 362 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  35.08 
 
 		 375 aa  197  8.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2329  periplasmic binding protein  36.75 
 
 		 384 aa  196  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  33.42 
 
 		 375 aa  194  6e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2147  periplasmic binding protein  33.96 
 
 		 387 aa  194  7e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.985671  normal  0.111935 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  34.82 
 
 		 375 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0998  iron ABC transporter, solute-binding protein  35.96 
 
 		 373 aa  187  7e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  33.63 
 
 		 370 aa  187  8e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  33.6 
 
 		 377 aa  180  5.999999999999999e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1653  periplasmic binding protein  33.62 
 
 		 386 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  32.97 
 
 		 376 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  31.05 
 
 		 381 aa  173  1e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1823  periplasmic binding protein  31.96 
 
 		 366 aa  165  3e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.717749  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0816  periplasmic binding protein  33.54 
 
 		 344 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0991  periplasmic binding protein  33.82 
 
 		 359 aa  158  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.960819  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  31.34 
 
 		 337 aa  154  8e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1174  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  29.8 
 
 		 367 aa  134  5e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00124091  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1092  hypothetical protein  28.16 
 
 		 378 aa  128  3e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  29.04 
 
 		 375 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1354  periplasmic binding protein  26.8 
 
 		 371 aa  105  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  29.86 
 
 		 427 aa  98.2  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  27.22 
 
 		 315 aa  94.7  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  26.84 
 
 		 315 aa  92  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1093  Fe3+-hydroxamate binding protein  24.43 
 
 		 426 aa  91.3  6e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000629133  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  28.18 
 
 		 333 aa  90.5  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  28.65 
 
 		 354 aa  89.7  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  25.77 
 
 		 478 aa  89  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1708  periplasmic binding protein  24.65 
 
 		 392 aa  89  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  27.89 
 
 		 354 aa  88.2  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  29.19 
 
 		 363 aa  87.8  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1314  periplasmic binding protein  24.12 
 
 		 380 aa  85.5  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0745  periplasmic binding protein  28.33 
 
 		 407 aa  85.5  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300436 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  28.12 
 
 		 354 aa  84.3  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2539  periplasmic binding protein  28.77 
 
 		 368 aa  82.4  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  26.11 
 
 		 351 aa  80.1  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1097  periplasmic binding protein  27.72 
 
 		 373 aa  79.7  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  26.81 
 
 		 344 aa  79.3  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  26.69 
 
 		 362 aa  79  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  27.93 
 
 		 354 aa  78.6  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  25.74 
 
 		 380 aa  78.6  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  26.17 
 
 		 360 aa  78.2  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  27.68 
 
 		 354 aa  78.6  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  26.23 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1235  periplasmic binding protein  26.36 
 
 		 375 aa  78.2  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  24.87 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3040  periplasmic binding protein  26.63 
 
 		 375 aa  76.6  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  27.14 
 
 		 375 aa  76.3  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2480  periplasmic binding protein  27.99 
 
 		 350 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.388226 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  23.71 
 
 		 365 aa  75.5  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4771  periplasmic binding protein  27.78 
 
 		 370 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  23.65 
 
 		 483 aa  75.5  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4418  periplasmic binding protein  25.61 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.468441 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2078  periplasmic binding protein  24.45 
 
 		 327 aa  75.1  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1702  periplasmic binding protein  28.98 
 
 		 364 aa  73.9  0.000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2635  iron chelate ABC transporter periplasmic iron/siderophore-binding protein  27.75 
 
 		 363 aa  73.9  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.97529e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2696  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 377 aa  73.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.773462  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2720  periplasmic binding protein  27.47 
 
 		 363 aa  73.2  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000254593  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2758  periplasmic binding protein  27.05 
 
 		 373 aa  73.6  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.593995  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3842  periplasmic binding protein  28.71 
 
 		 349 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  23.15 
 
 		 370 aa  72.8  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.69 
 
 		 349 aa  72.8  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  23.85 
 
 		 359 aa  73.2  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7622  ABC transporter substrate binding protein (iron)  27.22 
 
 		 429 aa  72.4  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4265  periplasmic binding protein  25.08 
 
 		 393 aa  72.8  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2326  periplasmic binding protein  24.55 
 
 		 346 aa  72.4  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0417  periplasmic binding protein  26.45 
 
 		 346 aa  71.2  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0407983 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>