More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0497 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  100 
 
 
377 aa  765    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  54.01 
 
 
375 aa  422  1e-117  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  54.5 
 
 
375 aa  424  1e-117  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  54.29 
 
 
362 aa  413  1e-114  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  53.7 
 
 
375 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  42.82 
 
 
372 aa  261  1e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  37.47 
 
 
381 aa  237  3e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  36.66 
 
 
401 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0424  periplasmic binding protein  37.4 
 
 
373 aa  231  1e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.212243  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0427  periplasmic binding protein  38.44 
 
 
373 aa  230  2e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  34.99 
 
 
401 aa  231  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0411  periplasmic binding protein  39.12 
 
 
374 aa  229  4e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  39.36 
 
 
386 aa  229  4e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  42.39 
 
 
372 aa  227  2e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  38.03 
 
 
390 aa  226  4e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1494  periplasmic binding protein  35.81 
 
 
374 aa  225  1e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00826016  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0410  periplasmic binding protein  37.6 
 
 
373 aa  223  3e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.579049  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  35.79 
 
 
403 aa  223  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  34.24 
 
 
376 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0425  periplasmic binding protein  37.77 
 
 
365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.264248  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  38.73 
 
 
358 aa  219  5e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  35.73 
 
 
369 aa  218  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  36.56 
 
 
378 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  39.46 
 
 
358 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  37.53 
 
 
374 aa  212  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2328  periplasmic binding protein  38.89 
 
 
384 aa  210  4e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  35.58 
 
 
370 aa  208  2e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1092  hypothetical protein  33.08 
 
 
378 aa  206  7e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2329  periplasmic binding protein  37.87 
 
 
384 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  34.11 
 
 
337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3056  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  35.14 
 
 
369 aa  196  6e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  36.57 
 
 
381 aa  196  6e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1622  iron transport periplasmic binding protein  34.32 
 
 
370 aa  189  8e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000308392  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  35.74 
 
 
396 aa  186  8e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  36.28 
 
 
393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  32.48 
 
 
375 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  29.6 
 
 
370 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2147  periplasmic binding protein  33.33 
 
 
387 aa  181  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.985671  normal  0.111935 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1823  periplasmic binding protein  31.4 
 
 
366 aa  181  1e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.717749  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  33.6 
 
 
688 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1174  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  32.38 
 
 
367 aa  178  1e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00124091  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  33.06 
 
 
689 aa  178  1e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  33.91 
 
 
409 aa  179  1e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1653  periplasmic binding protein  33.81 
 
 
386 aa  177  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  34.13 
 
 
373 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0251  periplasmic binding protein  34.33 
 
 
369 aa  170  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1424  periplasmic binding protein  32.33 
 
 
374 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.813522  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0998  iron ABC transporter, solute-binding protein  31.18 
 
 
373 aa  149  7e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0991  periplasmic binding protein  32.02 
 
 
359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.960819  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  28.7 
 
 
375 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  27.89 
 
 
366 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0816  periplasmic binding protein  30.25 
 
 
344 aa  109  7.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  29.88 
 
 
378 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2395  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  25.13 
 
 
408 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  25 
 
 
333 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  28.5 
 
 
362 aa  100  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  26.58 
 
 
354 aa  101  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1470  periplasmic binding protein  26.33 
 
 
419 aa  100  6e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000805448  normal  0.0690389 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1176  ABC transporter, solute-binding protein  25.78 
 
 
408 aa  99.8  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1093  Fe3+-hydroxamate binding protein  24.01 
 
 
426 aa  99.8  8e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000629133  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  25.61 
 
 
360 aa  99.4  9e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  27.35 
 
 
334 aa  99.4  9e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  25.07 
 
 
354 aa  97.1  5e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  24.01 
 
 
354 aa  95.5  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  24.32 
 
 
354 aa  95.5  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  23.53 
 
 
365 aa  94.4  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1534  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.96 
 
 
351 aa  94  4e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000374232  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2225  periplasmic binding protein  23.53 
 
 
348 aa  93.6  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000231713  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2078  periplasmic binding protein  26.42 
 
 
327 aa  93.6  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  24.92 
 
 
483 aa  92  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  24.71 
 
 
344 aa  92.4  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  22.97 
 
 
361 aa  92  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  23.58 
 
 
351 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1354  periplasmic binding protein  24.56 
 
 
371 aa  89  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2097  periplasmic binding protein  24.81 
 
 
376 aa  89.4  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.328694  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  23.95 
 
 
478 aa  87.4  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  27.93 
 
 
375 aa  86.7  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  23.1 
 
 
354 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  24.94 
 
 
370 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  21.71 
 
 
350 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  21.71 
 
 
350 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  21.41 
 
 
350 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2069  periplasmic binding protein  25 
 
 
340 aa  84  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1721  hypothetical protein  26.72 
 
 
351 aa  83.6  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  23.31 
 
 
380 aa  84  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  21.71 
 
 
350 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  21.88 
 
 
349 aa  82.4  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  25.41 
 
 
369 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  23.58 
 
 
348 aa  82  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  25.76 
 
 
351 aa  81.3  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1174  iron ABC transporter, solute-binding protein  23.79 
 
 
438 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0448  periplasmic binding protein  25.15 
 
 
369 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  25.36 
 
 
381 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  25.36 
 
 
389 aa  81.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  24.2 
 
 
384 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  25.36 
 
 
389 aa  81.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  21.58 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1691  periplasmic binding protein  25.54 
 
 
353 aa  80.9  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000252356  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  23.67 
 
 
353 aa  80.1  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1015  periplasmic binding protein  24.8 
 
 
371 aa  79.7  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.543354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>