More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0273 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  100 
 
 
381 aa  771    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  56.13 
 
 
369 aa  426  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  53.26 
 
 
374 aa  404  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  52.85 
 
 
378 aa  389  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0251  periplasmic binding protein  51.67 
 
 
369 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  48.07 
 
 
358 aa  335  5.999999999999999e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  48.9 
 
 
358 aa  333  2e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0427  periplasmic binding protein  46.38 
 
 
373 aa  325  9e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0410  periplasmic binding protein  45.58 
 
 
373 aa  325  1e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.579049  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  42.59 
 
 
386 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  43.21 
 
 
372 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  47.59 
 
 
409 aa  292  6e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3056  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  40.79 
 
 
369 aa  286  4e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1494  periplasmic binding protein  40.75 
 
 
374 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00826016  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0411  periplasmic binding protein  40.22 
 
 
374 aa  282  7.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  44.12 
 
 
396 aa  281  1e-74  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0424  periplasmic binding protein  40.49 
 
 
373 aa  278  1e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.212243  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  44.14 
 
 
393 aa  278  2e-73  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  43.88 
 
 
689 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  40.68 
 
 
688 aa  273  3e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0425  periplasmic binding protein  40.22 
 
 
365 aa  270  4e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.264248  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  43.68 
 
 
403 aa  265  8e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1424  periplasmic binding protein  39.57 
 
 
374 aa  264  2e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.813522  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  40.71 
 
 
370 aa  261  1e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  39.73 
 
 
373 aa  260  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  41.32 
 
 
401 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  41.53 
 
 
401 aa  252  8.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  38.15 
 
 
372 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  42.31 
 
 
390 aa  241  2e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2147  periplasmic binding protein  36.15 
 
 
387 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.985671  normal  0.111935 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1622  iron transport periplasmic binding protein  36.39 
 
 
370 aa  230  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000308392  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  35.12 
 
 
375 aa  230  3e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  36.69 
 
 
381 aa  229  6e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  34.93 
 
 
376 aa  229  7e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1653  periplasmic binding protein  33.6 
 
 
386 aa  227  3e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  36.31 
 
 
370 aa  225  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  36.27 
 
 
375 aa  225  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2329  periplasmic binding protein  39.32 
 
 
384 aa  217  2e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2328  periplasmic binding protein  38.18 
 
 
384 aa  216  4e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  34.05 
 
 
375 aa  216  7e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  33.97 
 
 
362 aa  212  9e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1823  periplasmic binding protein  34.88 
 
 
366 aa  211  2e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.717749  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  33.95 
 
 
375 aa  210  4e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0998  iron ABC transporter, solute-binding protein  37.7 
 
 
373 aa  208  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1174  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  34.22 
 
 
367 aa  202  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00124091  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  35.66 
 
 
377 aa  199  6e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0991  periplasmic binding protein  34.53 
 
 
359 aa  192  8e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.960819  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  34.97 
 
 
337 aa  187  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1092  hypothetical protein  32.62 
 
 
378 aa  185  9e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0816  periplasmic binding protein  37.07 
 
 
344 aa  177  3e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  27.7 
 
 
375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  29.81 
 
 
354 aa  117  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  27.04 
 
 
354 aa  115  8.999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  29.7 
 
 
354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  28.77 
 
 
350 aa  115  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1467  periplasmic binding protein  28.57 
 
 
406 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  unclonable  0.0000000012515  normal  0.0723513 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  26.51 
 
 
350 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  26.2 
 
 
350 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  27.71 
 
 
350 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  26.84 
 
 
349 aa  102  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  27.17 
 
 
351 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  27.41 
 
 
350 aa  99.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  26.87 
 
 
344 aa  97.8  3e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  25 
 
 
366 aa  97.4  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1093  Fe3+-hydroxamate binding protein  25.41 
 
 
426 aa  95.9  9e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000629133  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  28.09 
 
 
315 aa  95.1  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  26.72 
 
 
363 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  27.91 
 
 
483 aa  94.7  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  28.61 
 
 
389 aa  94.4  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  28.61 
 
 
389 aa  94.4  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  28.61 
 
 
381 aa  94.7  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  26.61 
 
 
351 aa  93.6  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  25.87 
 
 
478 aa  92.4  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1354  periplasmic binding protein  22.85 
 
 
371 aa  91.7  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  28.09 
 
 
315 aa  91.3  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4771  periplasmic binding protein  27.01 
 
 
370 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  23.03 
 
 
361 aa  91.3  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1702  periplasmic binding protein  28.33 
 
 
364 aa  90.5  5e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1015  periplasmic binding protein  26.7 
 
 
371 aa  89.7  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.543354 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1097  periplasmic binding protein  28.57 
 
 
373 aa  89.4  9e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1534  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.62 
 
 
351 aa  88.6  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000374232  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2480  periplasmic binding protein  27.71 
 
 
350 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.388226 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  24.04 
 
 
353 aa  89  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  24.26 
 
 
365 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1314  periplasmic binding protein  26.55 
 
 
380 aa  88.2  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  26.67 
 
 
375 aa  87.4  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1691  periplasmic binding protein  25.86 
 
 
353 aa  87.4  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000252356  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1127  periplasmic binding protein  24.11 
 
 
368 aa  86.3  9e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  27.59 
 
 
406 aa  85.9  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4648  periplasmic binding protein  23.71 
 
 
353 aa  85.9  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.76116  hitchhiker  0.000482562 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  26.49 
 
 
370 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2758  periplasmic binding protein  26.21 
 
 
373 aa  85.5  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.593995  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  27.36 
 
 
368 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3040  periplasmic binding protein  28.49 
 
 
375 aa  84.7  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1985  periplasmic binding protein  26.37 
 
 
352 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  25.07 
 
 
362 aa  83.2  0.000000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  24.65 
 
 
354 aa  82.8  0.000000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  22.76 
 
 
333 aa  82.4  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4418  periplasmic binding protein  27.97 
 
 
377 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.468441 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0745  periplasmic binding protein  26.56 
 
 
407 aa  81.3  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.300436 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>